MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori PeCan4 chromosome

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014555	GCTTGC	2	12	6099	6110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014555	ATTATA	2	12	9524	9535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014555	AAACAC	2	12	18082	18093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014555	AGATAA	2	12	54342	54353	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014555	AGATAA	10	60	56045	56104	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014555	GATGTG	2	12	56331	56342	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014555	AGCCAA	2	12	56409	56420	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014555	CCAACA	2	12	58280	58291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014555	ACAGAA	2	12	60771	60782	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014555	AGCGGG	2	12	62569	62580	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014555	ATAAAA	2	12	101863	101874	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014555	GTTTTA	2	12	126665	126676	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014555	TAAAAA	2	12	163050	163061	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014555	TATAAT	2	12	206412	206423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014555	ATTAAA	2	12	219829	219840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014555	ATTTTA	2	12	242536	242547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014555	ATTTTT	2	12	315521	315532	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014555	GATTTA	2	12	316930	316941	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014555	CAAAGC	2	12	319750	319761	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014555	GTTTTT	2	12	355254	355265	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014555	AAAATA	2	12	426486	426497	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014555	TAAAAA	2	12	440650	440661	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014555	ATTTTT	2	12	452068	452079	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014555	TATTTT	2	12	465616	465627	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014555	TTTAAT	2	12	478168	478179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014555	TTGTAA	2	12	515381	515392	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014555	TCTTAT	2	12	534188	534199	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014555	TTTAAA	2	12	540848	540859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014555	ATTTTA	2	12	574175	574186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014555	ACAGGC	2	12	577494	577505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014555	ATTTGA	2	12	577519	577530	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014555	AAAATC	2	12	587476	587487	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014555	ATAGTT	2	12	614582	614593	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014555	CAAAGC	2	12	615405	615416	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014555	CTCATT	2	12	679608	679619	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014555	AGGCTT	2	12	743097	743108	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014555	CTTCCA	2	12	743724	743735	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014555	ATTATA	2	12	822751	822762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014555	TCTTTA	2	12	830076	830087	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014555	CATAAG	2	12	840905	840916	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014555	TTTTCT	2	12	907690	907701	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014555	ATTATA	2	12	928399	928410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014555	TAAAAT	2	12	928424	928435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014555	ATTGAA	2	12	935802	935813	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014555	TCAAAT	2	12	958228	958239	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014555	GTCAAA	2	12	981069	981080	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014555	TAAAAT	2	12	985556	985567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014555	GCTGAA	2	12	994603	994614	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014555	CTAAAA	2	12	1013285	1013296	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014555	ACAAAA	2	12	1101675	1101686	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014555	TTTTAA	2	12	1162690	1162701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014555	ATCCTT	2	12	1182041	1182052	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014555	TTGTAT	2	12	1184462	1184473	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014555	ACTTAA	2	12	1201469	1201480	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014555	AAACTT	2	12	1224935	1224946	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014555	ATTTTT	2	12	1256420	1256431	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014555	TAAAAA	2	12	1284423	1284434	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014555	TATATT	2	12	1287072	1287083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014555	AGTTTT	2	12	1366045	1366056	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014555	AAACAA	2	12	1369147	1369158	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014555	AGCGGG	2	12	1378101	1378112	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014555	ATTAAG	2	12	1380234	1380245	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014555	TTTTTA	2	12	1381787	1381798	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014555	GTTTTA	2	12	1388251	1388262	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014555	CTAAGT	2	12	1398678	1398689	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014555	TGTTTA	2	12	1407181	1407192	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014555	CGCTAA	2	12	1502094	1502105	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014555	AGCGAT	2	12	1531023	1531034	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014555	AAAGCC	2	12	1532812	1532823	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014555	AGAAAA	2	12	1532841	1532852	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014555	CTCAAA	2	12	1533291	1533302	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014555	CCTAAT	2	12	1533412	1533423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014555	CTTTTT	2	12	1533604	1533615	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014555	TTGGTT	2	12	1536326	1536337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014555	TAAAAT	2	12	1548879	1548890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014555	CTCTTT	2	12	1561113	1561124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014555	AGCTTG	2	12	1563540	1563551	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014555	TCTTGC	2	12	1565465	1565476	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014555	GTTATT	2	12	1566790	1566801	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014555	AATTTC	2	12	1567618	1567629	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014555	ACCACT	2	12	1572455	1572466	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014555	TCAAAA	2	12	1577308	1577319	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014555	GTTTTT	2	12	1577940	1577951	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014555	ATTCTT	2	12	1578134	1578145	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014555	ATTGCT	2	12	1578662	1578673	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.