MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Halomonas elongata DSM 2581 chromosome

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014532	TCATTG	2	12	6569	6580	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014532	TATTGA	2	12	41222	41233	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014532	CCTTTT	2	12	153156	153167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014532	AAAAAC	2	12	234858	234869	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014532	ACTGAC	2	12	260262	260273	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014532	TGAAAT	2	12	263620	263631	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014532	GACCGA	2	12	298120	298131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014532	TGCCGG	2	12	313089	313100	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014532	TTATCG	2	12	328339	328350	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014532	TCCGGG	2	12	385969	385980	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014532	ACTGAC	2	12	394097	394108	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014532	TGAAAT	2	12	397553	397564	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014532	GAGGAC	2	12	431747	431758	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014532	CCCGAG	2	12	438493	438504	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014532	CGAGCC	2	12	466892	466903	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014532	CGATCC	2	12	515551	515562	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014532	AGCGGA	2	12	516425	516436	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014532	TCTACT	2	12	516624	516635	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014532	CACAAT	2	12	591943	591954	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014532	CCACTT	2	12	611605	611616	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014532	GAGCGT	2	12	635764	635775	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014532	AACCGG	2	12	700436	700447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014532	AATAAA	2	12	703031	703042	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014532	GTTTTT	2	12	709682	709693	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014532	TCAGGT	2	12	740093	740104	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014532	GACGCC	2	12	782051	782062	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014532	GGCGTC	2	12	782076	782087	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014532	ACTGAC	2	12	865533	865544	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014532	TGAAAT	2	12	868989	869000	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014532	CGTCGA	2	12	894955	894966	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014532	ATGCCG	2	12	926622	926633	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014532	CCCGCG	2	12	936274	936285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014532	AGCTGT	2	12	1007289	1007300	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014532	GCGTGC	2	12	1008547	1008558	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014532	CTTGTC	2	12	1009533	1009544	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014532	GTTGTC	2	12	1047354	1047365	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014532	CGGCCG	2	12	1076545	1076556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014532	TTAGCT	2	12	1089527	1089538	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014532	GCAGGG	2	12	1124237	1124248	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014532	CGCTCC	2	12	1167117	1167128	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_014532	CCATTG	2	12	1172599	1172610	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014532	AGCAGA	2	12	1262844	1262855	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014532	GCCTCC	2	12	1270291	1270302	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_014532	CGTGGC	2	12	1274386	1274397	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014532	TTGTGA	2	12	1304455	1304466	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014532	CCGAGC	2	12	1305199	1305210	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014532	CTTTCT	2	12	1309804	1309815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014532	GGATCG	2	12	1310041	1310052	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014532	CCATAC	2	12	1316025	1316036	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014532	AAATGA	2	12	1316722	1316733	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014532	ACATTA	2	12	1318448	1318459	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014532	AAGGGC	2	12	1329963	1329974	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014532	CGCCGG	2	12	1332448	1332459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014532	CACAAC	2	12	1440443	1440454	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014532	CGGTAT	2	12	1444273	1444284	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014532	AACAAA	2	12	1509294	1509305	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014532	GGAGCC	2	12	1576137	1576148	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014532	AAGTGG	2	12	1602998	1603009	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014532	TTTTGA	2	12	1610459	1610470	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014532	TATGAA	2	12	1614796	1614807	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014532	CGGAAG	2	12	1615094	1615105	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014532	GATGCG	2	12	1620833	1620844	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014532	TCCAGC	2	12	1623082	1623093	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014532	CGGGTG	2	12	1623196	1623207	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014532	CCTCGC	2	12	1624727	1624738	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_014532	GCGGTC	2	12	1626024	1626035	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014532	CGGGCC	2	12	1626664	1626675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014532	TGGCCA	2	12	1626944	1626955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014532	GCCGTC	2	12	1629357	1629368	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014532	GTGCAG	2	12	1629441	1629452	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014532	CGGTGG	2	12	1629620	1629631	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014532	ATGCGA	2	12	1659170	1659181	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014532	CCCATC	2	12	1774568	1774579	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_014532	CCGAGG	2	12	1785919	1785930	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014532	CGAGTC	2	12	1809124	1809135	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014532	CGGGGG	2	12	1892204	1892215	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014532	TTGCCG	2	12	1908532	1908543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014532	CGTTTC	2	12	1918280	1918291	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014532	ATCACA	2	12	1923135	1923146	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014532	TCATGT	2	12	1923793	1923804	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014532	ATAAAA	2	12	1949572	1949583	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014532	ACCGCC	2	12	1977646	1977657	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014532	CTCTCC	2	12	2023526	2023537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_014532	CATTCA	2	12	2029864	2029875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014532	TTGTCA	2	12	2091922	2091933	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014532	TCGACA	2	12	2126755	2126766	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014532	CATTTA	2	12	2126901	2126912	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014532	CGTCAA	2	12	2126933	2126944	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014532	GCCTGT	2	12	2154118	2154129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014532	CCGAGT	2	12	2213984	2213995	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014532	CAAAAA	2	12	2259672	2259683	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014532	GCCTGA	2	12	2267909	2267920	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014532	TGAGAT	2	12	2275616	2275627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014532	ATTTTA	2	12	2304008	2304019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014532	ATGGTG	2	12	2307738	2307749	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014532	AAAGAC	2	12	2331195	2331206	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014532	TGGCCA	2	12	2373567	2373578	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014532	GATTTT	2	12	2386197	2386208	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014532	GCAAGA	2	12	2395980	2395991	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014532	CCTCGG	2	12	2400481	2400492	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014532	GCACTG	2	12	2475187	2475198	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014532	TCGGCG	2	12	2477243	2477254	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014532	GTGGAC	2	12	2595639	2595650	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014532	AGCATC	2	12	2683556	2683567	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014532	AACCCA	2	12	2693685	2693696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014532	CTGGTG	2	12	2696383	2696394	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014532	ATCTCA	2	12	2697579	2697590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014532	CATCGA	2	12	2697919	2697930	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014532	ATTTTT	2	12	2698104	2698115	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014532	TCATAC	2	12	2703774	2703785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014532	ACACCA	2	12	2704305	2704316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014532	TTCAGT	2	12	2707510	2707521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014532	GCCCTA	2	12	2707678	2707689	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014532	TCTCGG	2	12	2796167	2796178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014532	TGGTGC	2	12	2865726	2865737	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_014532	TCGCGA	2	12	2903076	2903087	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014532	AAAACC	2	12	2930235	2930246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014532	GCCCCG	2	12	2964587	2964598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_014532	TGGCAC	2	12	3001893	3001904	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014532	CTCAGC	2	12	3050366	3050377	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_014532	CTTGCG	2	12	3053219	3053230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014532	AGCAGG	2	12	3125713	3125724	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014532	TGCCGT	2	12	3174649	3174660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014532	GTTGCC	2	12	3174746	3174757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014532	AGCCGT	2	12	3268682	3268693	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014532	GATGCC	2	12	3306785	3306796	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014532	ATGGCC	2	12	3381312	3381323	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014532	TCGTTA	2	12	3451230	3451241	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014532	ATGGTC	2	12	3532936	3532947	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_014532	TCTGCC	2	12	3565060	3565071	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014532	GCAAGC	2	12	3580879	3580890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014532	CTATGC	2	12	3591144	3591155	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014532	AGGAAA	2	12	3599431	3599442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014532	AAGGGG	2	12	3602526	3602537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014532	CAAAAA	2	12	3609463	3609474	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_014532	GTTCAG	2	12	3615273	3615284	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_014532	GCCTAT	2	12	3622538	3622549	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014532	CTTGCC	2	12	3638030	3638041	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014532	CACCTC	2	12	3638547	3638558	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_014532	ATTTCA	2	12	3653209	3653220	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_014532	GTCAGT	2	12	3656672	3656683	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_014532	CACGGA	2	12	3663187	3663198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014532	TGTTTT	2	12	3719660	3719671	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014532	CGAGAA	2	12	3719950	3719961	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_014532	CCATCC	2	12	3734241	3734252	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_014532	TGTTTT	2	12	3764430	3764441	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014532	CGTGGC	2	12	3785325	3785336	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_014532	TGACCC	2	12	3856778	3856789	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014532	TCACCG	2	12	3861369	3861380	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
150	NC_014532	CGGGGT	2	12	3866496	3866507	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_014532	CGCCAG	2	12	3867538	3867549	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
152	NC_014532	CGCCGG	2	12	3934222	3934233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_014532	GCGGCA	2	12	3975490	3975501	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_014532	TCGCCC	2	12	3987199	3987210	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_014532	GCCTTT	2	12	4010287	4010298	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.