MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 14524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014323	AAAGAA	2	12	2032477	2032488	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_014323	TGGC	2	8	2032569	2032576	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5503	NC_014323	GCCG	2	8	2032582	2032589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_014323	CGG	2	6	2036427	2036432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_014323	ATTTC	2	10	2036471	2036480	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5506	NC_014323	ATAGCC	2	12	2038195	2038206	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_014323	TTA	2	6	2039928	2039933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_014323	ATT	2	6	2049550	2049555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_014323	GCC	2	6	2049652	2049657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5510	NC_014323	CAT	2	6	2049667	2049672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_014323	GAG	2	6	2049678	2049683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_014323	TCGAT	2	10	2051359	2051368	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5513	NC_014323	CGG	2	6	2052313	2052318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_014323	GCT	2	6	2052320	2052325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_014323	GCT	2	6	2052951	2052956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_014323	CA	3	6	2052993	2052998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5517	NC_014323	ACAGA	2	10	2053003	2053012	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5518	NC_014323	T	6	6	2054662	2054667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_014323	CGC	2	6	2055528	2055533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5520	NC_014323	CAT	2	6	2055568	2055573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_014323	CGC	2	6	2056759	2056764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_014323	GGT	2	6	2056849	2056854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_014323	AGG	2	6	2056867	2056872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_014323	GTGGAA	2	12	2057290	2057301	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_014323	ATGCT	2	10	2057331	2057340	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5526	NC_014323	TCA	3	9	2057390	2057398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_014323	GCC	2	6	2058286	2058291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_014323	T	6	6	2060251	2060256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_014323	A	6	6	2060259	2060264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_014323	CAG	2	6	2060303	2060308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_014323	CGA	2	6	2060329	2060334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_014323	AGC	2	6	2060844	2060849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_014323	T	6	6	2060873	2060878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_014323	CGG	2	6	2060886	2060891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_014323	ATTG	2	8	2060896	2060903	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_014323	GCT	2	6	2060990	2060995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_014323	ATTGTG	2	12	2061032	2061043	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_014323	CTCA	2	8	2061446	2061453	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5539	NC_014323	TCC	2	6	2061454	2061459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_014323	TCCC	2	8	2061530	2061537	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5541	NC_014323	AGA	2	6	2061549	2061554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_014323	TGCGCC	2	12	2061897	2061908	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5543	NC_014323	GATC	2	8	2061927	2061934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5544	NC_014323	GCG	2	6	2061936	2061941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_014323	A	6	6	2062013	2062018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_014323	CTG	2	6	2070781	2070786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_014323	CGGCG	2	10	2071538	2071547	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5548	NC_014323	GTC	2	6	2071559	2071564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_014323	AACC	2	8	2071568	2071575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5550	NC_014323	TCAG	2	8	2071578	2071585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5551	NC_014323	TCG	2	6	2071652	2071657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_014323	CTGC	2	8	2078143	2078150	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5553	NC_014323	GGCG	2	8	2078159	2078166	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5554	NC_014323	ACC	2	6	2078182	2078187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5555	NC_014323	GTT	2	6	2078322	2078327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_014323	CAT	2	6	2078361	2078366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_014323	A	8	8	2078368	2078375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_014323	TCT	2	6	2080753	2080758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_014323	CATCGG	2	12	2081543	2081554	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_014323	TGC	2	6	2081569	2081574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_014323	CAG	2	6	2081595	2081600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_014323	CAG	2	6	2081613	2081618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_014323	GGC	2	6	2081641	2081646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_014323	GCG	2	6	2081650	2081655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_014323	A	6	6	2083857	2083862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_014323	TCAG	2	8	2085279	2085286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5567	NC_014323	CTG	2	6	2085323	2085328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_014323	CGGC	2	8	2085345	2085352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5569	NC_014323	GGCC	2	8	2085355	2085362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_014323	GGA	2	6	2086150	2086155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_014323	CGA	2	6	2086211	2086216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_014323	CCT	2	6	2087571	2087576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5573	NC_014323	GCT	2	6	2087595	2087600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_014323	GCG	2	6	2087601	2087606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_014323	TGC	2	6	2087681	2087686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_014323	CAA	2	6	2087732	2087737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_014323	TTGA	2	8	2087754	2087761	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_014323	GCAGG	2	10	2087780	2087789	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5579	NC_014323	GC	3	6	2087812	2087817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_014323	GCCTG	2	10	2087820	2087829	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5581	NC_014323	CGCC	3	12	2087833	2087844	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5582	NC_014323	GGCGCG	2	12	2087847	2087858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_014323	GC	3	6	2087859	2087864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5584	NC_014323	GGAA	2	8	2088828	2088835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_014323	TGCGC	2	10	2088884	2088893	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5586	NC_014323	CTG	2	6	2088901	2088906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_014323	CGT	2	6	2088933	2088938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_014323	TG	3	6	2088945	2088950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_014323	T	6	6	2088990	2088995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_014323	GAA	2	6	2089006	2089011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_014323	AT	3	6	2089019	2089024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_014323	T	6	6	2089030	2089035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_014323	ATT	2	6	2089145	2089150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_014323	CAG	2	6	2091171	2091176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_014323	GA	3	6	2091177	2091182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_014323	GCG	2	6	2093043	2093048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_014323	TGT	2	6	2093068	2093073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_014323	CGT	2	6	2093108	2093113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_014323	GA	3	6	2093158	2093163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_014323	GTA	2	6	2094747	2094752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_014323	AGT	2	6	2094757	2094762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_014323	CGG	2	6	2094778	2094783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_014323	GCC	2	6	2094794	2094799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5604	NC_014323	GCG	2	6	2094819	2094824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_014323	GGGT	2	8	2094846	2094853	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_014323	AG	3	6	2094874	2094879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_014323	CTT	2	6	2098657	2098662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_014323	TGG	2	6	2098671	2098676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_014323	TTG	2	6	2098678	2098683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_014323	AGGC	2	8	2098735	2098742	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5611	NC_014323	TGA	2	6	2099686	2099691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_014323	GAC	2	6	2100681	2100686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_014323	GAA	2	6	2100702	2100707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_014323	AGAGCA	2	12	2101233	2101244	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5615	NC_014323	GCAG	2	8	2101247	2101254	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5616	NC_014323	T	6	6	2101280	2101285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_014323	AT	3	6	2101294	2101299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_014323	AGG	2	6	2101389	2101394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_014323	AGT	2	6	2101427	2101432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_014323	GTT	2	6	2101479	2101484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_014323	T	7	7	2101499	2101505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_014323	GAA	2	6	2101574	2101579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_014323	GTG	2	6	2102645	2102650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_014323	GCAT	2	8	2102676	2102683	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5625	NC_014323	GCG	2	6	2102744	2102749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_014323	GCT	2	6	2102769	2102774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_014323	GCG	2	6	2102823	2102828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_014323	CT	3	6	2102852	2102857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5629	NC_014323	CATC	2	8	2102862	2102869	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5630	NC_014323	TGTC	2	8	2103584	2103591	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5631	NC_014323	CAT	2	6	2103652	2103657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5632	NC_014323	CTG	2	6	2103676	2103681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5633	NC_014323	GCCT	2	8	2104368	2104375	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5634	NC_014323	GCC	2	6	2107055	2107060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5635	NC_014323	GGC	2	6	2107075	2107080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5637	NC_014323	TGCA	2	8	2109323	2109330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5638	NC_014323	T	6	6	2109335	2109340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5643	NC_014323	GAT	2	6	2110923	2110928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5645	NC_014323	GGT	2	6	2110996	2111001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5652	NC_014323	TGC	2	6	2111218	2111223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5653	NC_014323	GC	3	6	2111299	2111304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5654	NC_014323	GACT	2	8	2111342	2111349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5655	NC_014323	T	6	6	2111514	2111519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5745	NC_014323	TG	3	6	2140695	2140700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5746	NC_014323	CCGCG	2	10	2140774	2140783	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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5751	NC_014323	GCT	2	6	2141341	2141346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5753	NC_014323	TCGA	2	8	2141360	2141367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5754	NC_014323	TA	3	6	2141369	2141374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5755	NC_014323	CGGG	2	8	2142538	2142545	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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5758	NC_014323	TGAG	2	8	2143648	2143655	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5894	NC_014323	CTA	2	6	2200263	2200268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5895	NC_014323	T	7	7	2200278	2200284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5896	NC_014323	CGC	2	6	2200291	2200296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5897	NC_014323	A	6	6	2200921	2200926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5898	NC_014323	A	6	6	2201071	2201076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5899	NC_014323	T	7	7	2201097	2201103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5900	NC_014323	GAGC	2	8	2201116	2201123	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5903	NC_014323	A	6	6	2201161	2201166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5959	NC_014323	CGGGG	2	10	2225956	2225965	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5960	NC_014323	CGG	2	6	2225979	2225984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5961	NC_014323	GGC	2	6	2225991	2225996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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