MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 14524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014323	AAG	2	6	1689557	1689562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_014323	A	6	6	1689584	1689589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_014323	CAT	2	6	1689623	1689628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_014323	ACTA	2	8	1689644	1689651	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4505	NC_014323	TG	3	6	1689656	1689661	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_014323	GCG	2	6	1689695	1689700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_014323	TATG	2	8	1689761	1689768	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_014323	GAG	2	6	1689779	1689784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_014323	GC	3	6	1690223	1690228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4510	NC_014323	A	6	6	1690236	1690241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_014323	AC	3	6	1690247	1690252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4512	NC_014323	CTC	2	6	1691663	1691668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_014323	GGCG	2	8	1691690	1691697	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4514	NC_014323	TCA	2	6	1691708	1691713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_014323	TCA	2	6	1691742	1691747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_014323	ATC	2	6	1691768	1691773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_014323	ATG	2	6	1691809	1691814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_014323	A	6	6	1691833	1691838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_014323	GGA	2	6	1692937	1692942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_014323	GGA	2	6	1693917	1693922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_014323	GCG	2	6	1693987	1693992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_014323	GCG	2	6	1694034	1694039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_014323	GCG	2	6	1694168	1694173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_014323	GCG	2	6	1694215	1694220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_014323	AGAAA	2	10	1695162	1695171	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_014323	GGC	2	6	1695202	1695207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_014323	CGC	2	6	1695221	1695226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_014323	GC	3	6	1695225	1695230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_014323	GCG	2	6	1695239	1695244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_014323	GGC	2	6	1695247	1695252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_014323	AT	3	6	1696411	1696416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_014323	GCG	2	6	1696417	1696422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_014323	AT	3	6	1696429	1696434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_014323	TCG	2	6	1696453	1696458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_014323	TAAT	2	8	1698253	1698260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_014323	GCG	2	6	1698346	1698351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_014323	A	8	8	1698414	1698421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_014323	GCCC	2	8	1698432	1698439	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4539	NC_014323	ACG	2	6	1698534	1698539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_014323	GC	3	6	1698542	1698547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4541	NC_014323	CGC	3	9	1698568	1698576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4542	NC_014323	TTC	2	6	1698581	1698586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_014323	GCC	2	6	1698617	1698622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4544	NC_014323	AGA	2	6	1698668	1698673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_014323	TCC	2	6	1698674	1698679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_014323	AGG	2	6	1698713	1698718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_014323	GCAGC	2	10	1703689	1703698	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4548	NC_014323	TGC	2	6	1703712	1703717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_014323	CAG	2	6	1703750	1703755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_014323	TTG	2	6	1704627	1704632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_014323	TGG	2	6	1704644	1704649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_014323	AGG	2	6	1704681	1704686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_014323	T	6	6	1704974	1704979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_014323	TCCA	2	8	1705531	1705538	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4555	NC_014323	GGCC	2	8	1705629	1705636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4556	NC_014323	CAGC	2	8	1707711	1707718	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_014323	CGGG	2	8	1707752	1707759	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4558	NC_014323	CGC	2	6	1707778	1707783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4559	NC_014323	ATGA	2	8	1708984	1708991	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_014323	GAT	2	6	1709005	1709010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_014323	A	6	6	1709019	1709024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_014323	TTG	2	6	1709606	1709611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_014323	CCG	2	6	1709628	1709633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4564	NC_014323	CGG	2	6	1709642	1709647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_014323	CAG	2	6	1709649	1709654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_014323	GCG	2	6	1709670	1709675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_014323	CGC	2	6	1709689	1709694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4568	NC_014323	CTGT	2	8	1710502	1710509	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4569	NC_014323	GT	3	6	1710508	1710513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_014323	GTGG	2	8	1712301	1712308	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_014323	AGC	2	6	1712345	1712350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_014323	G	6	6	1712381	1712386	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_014323	CAC	2	6	1713585	1713590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4574	NC_014323	AAG	2	6	1713600	1713605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_014323	TAA	2	6	1713675	1713680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_014323	CGC	2	6	1713692	1713697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4577	NC_014323	GGC	2	6	1713796	1713801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_014323	GTG	2	6	1713842	1713847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_014323	ACT	2	6	1713875	1713880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_014323	CTT	2	6	1713936	1713941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_014323	GAG	2	6	1713958	1713963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_014323	GTT	2	6	1713978	1713983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_014323	GC	3	6	1714777	1714782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4584	NC_014323	T	6	6	1715132	1715137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_014323	CGA	2	6	1715151	1715156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_014323	CG	3	6	1715166	1715171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4587	NC_014323	CAA	2	6	1715193	1715198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_014323	AAGTG	2	10	1715245	1715254	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_014323	ATC	2	6	1715267	1715272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_014323	A	7	7	1715279	1715285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_014323	GGC	2	6	1715299	1715304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_014323	TAA	2	6	1717492	1717497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_014323	AAT	2	6	1717502	1717507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_014323	CG	4	8	1717577	1717584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4595	NC_014323	TTCAA	2	10	1717589	1717598	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4596	NC_014323	GCT	2	6	1717644	1717649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_014323	AGC	2	6	1717684	1717689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_014323	CG	3	6	1718850	1718855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4599	NC_014323	AGT	2	6	1718987	1718992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_014323	GCA	3	9	1719033	1719041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_014323	AGG	2	6	1719050	1719055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_014323	CAC	2	6	1719130	1719135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4603	NC_014323	GCG	3	9	1719985	1719993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_014323	GCC	2	6	1720008	1720013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4605	NC_014323	GAA	2	6	1720016	1720021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_014323	CGC	2	6	1720031	1720036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4607	NC_014323	GCG	2	6	1720052	1720057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_014323	GGA	2	6	1720068	1720073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_014323	GCG	2	6	1723879	1723884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_014323	AGC	2	6	1724966	1724971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_014323	T	7	7	1725018	1725024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_014323	CGC	2	6	1725031	1725036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4613	NC_014323	GTTTAC	2	12	1725146	1725157	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4614	NC_014323	GTA	2	6	1726887	1726892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_014323	CCGG	2	8	1726905	1726912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4616	NC_014323	GCAA	2	8	1726924	1726931	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4617	NC_014323	GCG	2	6	1728805	1728810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_014323	TGT	2	6	1729318	1729323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_014323	CGG	2	6	1729402	1729407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_014323	G	7	7	1729411	1729417	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_014323	TTG	2	6	1729464	1729469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_014323	CTG	2	6	1729485	1729490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_014323	AGC	2	6	1729504	1729509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_014323	CCG	2	6	1729858	1729863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_014323	GAA	2	6	1729883	1729888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_014323	T	6	6	1730533	1730538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_014323	GCA	2	6	1731387	1731392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_014323	ACG	2	6	1731954	1731959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_014323	CTG	2	6	1731978	1731983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4631	NC_014323	GCT	2	6	1732859	1732864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4758	NC_014323	GT	3	6	1781993	1781998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4990	NC_014323	CCGG	2	8	1861093	1861100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4991	NC_014323	CATTC	2	10	1861103	1861112	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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