MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 chromosome

Total Repeats: 8719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014313	GGT	2	6	1037339	1037344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_014313	CGGC	2	8	1038757	1038764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2503	NC_014313	GGTG	2	8	1038829	1038836	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_014313	GC	3	6	1038877	1038882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2505	NC_014313	TCA	2	6	1038923	1038928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_014313	GAC	2	6	1039248	1039253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_014313	CCAT	2	8	1039269	1039276	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2508	NC_014313	CG	3	6	1040674	1040679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2509	NC_014313	TAGA	2	8	1040804	1040811	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_014313	TCC	2	6	1041294	1041299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2511	NC_014313	CGGCG	2	10	1041705	1041714	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2512	NC_014313	TCG	2	6	1041769	1041774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_014313	CGA	2	6	1041827	1041832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_014313	CATTT	2	10	1041908	1041917	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2515	NC_014313	AGG	2	6	1041918	1041923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_014313	TGT	2	6	1041952	1041957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_014313	CGGTGG	2	12	1041959	1041970	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2518	NC_014313	CCG	2	6	1042527	1042532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2519	NC_014313	CAC	2	6	1042533	1042538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2520	NC_014313	GCA	2	6	1042590	1042595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_014313	GTT	2	6	1042609	1042614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_014313	AC	3	6	1042670	1042675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2523	NC_014313	AG	3	6	1042717	1042722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_014313	CT	3	6	1042738	1042743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2525	NC_014313	TTTG	2	8	1042745	1042752	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_014313	AAAT	2	8	1043128	1043135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_014313	G	6	6	1043247	1043252	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_014313	AAT	2	6	1044730	1044735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_014313	CGC	2	6	1044755	1044760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2530	NC_014313	GC	3	6	1044775	1044780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2531	NC_014313	CG	3	6	1044799	1044804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2532	NC_014313	ACA	2	6	1045375	1045380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_014313	CGC	2	6	1045427	1045432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2534	NC_014313	ATC	2	6	1045469	1045474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_014313	AGGC	2	8	1046064	1046071	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2536	NC_014313	GGCG	2	8	1046218	1046225	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2537	NC_014313	TCG	2	6	1046694	1046699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_014313	TTCAG	2	10	1046704	1046713	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2539	NC_014313	CG	3	6	1050952	1050957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2540	NC_014313	TTG	2	6	1050960	1050965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_014313	TTTG	2	8	1050978	1050985	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_014313	GAT	2	6	1051014	1051019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_014313	GC	4	8	1051332	1051339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2544	NC_014313	GCT	2	6	1051378	1051383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_014313	CGC	2	6	1051384	1051389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2546	NC_014313	GCT	2	6	1051421	1051426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_014313	GCGGG	2	10	1054296	1054305	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2548	NC_014313	TCCG	2	8	1054358	1054365	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2549	NC_014313	CCG	2	6	1054392	1054397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2550	NC_014313	AGC	3	9	1054532	1054540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_014313	CGG	2	6	1054593	1054598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_014313	ATGC	2	8	1055465	1055472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2553	NC_014313	GCA	2	6	1055477	1055482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_014313	AGC	2	6	1055662	1055667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_014313	GCGTC	2	10	1056045	1056054	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2556	NC_014313	CAA	2	6	1056064	1056069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_014313	CGT	2	6	1056129	1056134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_014313	GCC	2	6	1057797	1057802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2559	NC_014313	GAC	3	9	1057840	1057848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_014313	GC	3	6	1057933	1057938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2561	NC_014313	GCCA	2	8	1057968	1057975	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2562	NC_014313	CCGC	2	8	1058014	1058021	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2563	NC_014313	A	6	6	1058471	1058476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_014313	TCAA	2	8	1058685	1058692	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2565	NC_014313	CGG	2	6	1059646	1059651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_014313	CGA	2	6	1059742	1059747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_014313	GCC	2	6	1061181	1061186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2568	NC_014313	CGT	2	6	1061222	1061227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_014313	GGC	2	6	1061248	1061253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_014313	GCA	2	6	1061290	1061295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_014313	GAGAC	2	10	1061298	1061307	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2572	NC_014313	TGC	2	6	1061895	1061900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_014313	CCGG	2	8	1062330	1062337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2574	NC_014313	CGGT	2	8	1062346	1062353	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2575	NC_014313	CTG	2	6	1062381	1062386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_014313	CT	3	6	1062388	1062393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2577	NC_014313	GAA	2	6	1062419	1062424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2579	NC_014313	CGA	2	6	1066785	1066790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_014313	GCT	2	6	1066792	1066797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_014313	GAG	2	6	1066881	1066886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_014313	TGAT	2	8	1071135	1071142	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_014313	GGC	2	6	1071168	1071173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_014313	T	6	6	1071179	1071184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_014313	TTC	2	6	1071256	1071261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2587	NC_014313	CGGGC	2	10	1071332	1071341	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2588	NC_014313	AT	3	6	1071364	1071369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_014313	GGT	2	6	1071392	1071397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_014313	GTC	2	6	1071400	1071405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2591	NC_014313	GGC	2	6	1071491	1071496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_014313	T	6	6	1071509	1071514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_014313	CAC	2	6	1072002	1072007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2594	NC_014313	GTCA	2	8	1072028	1072035	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2595	NC_014313	GA	3	6	1074641	1074646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_014313	GAG	2	6	1074682	1074687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_014313	CCG	2	6	1075920	1075925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2598	NC_014313	CGG	2	6	1075932	1075937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_014313	AGGA	2	8	1076321	1076328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_014313	ACG	2	6	1081398	1081403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2601	NC_014313	GGA	2	6	1082817	1082822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_014313	GAA	2	6	1082823	1082828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_014313	GCCG	2	8	1083561	1083568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2604	NC_014313	CG	3	6	1085915	1085920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2605	NC_014313	CGT	2	6	1085934	1085939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_014313	CTTTT	2	10	1088035	1088044	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2607	NC_014313	ACG	2	6	1088197	1088202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_014313	ATC	2	6	1089096	1089101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_014313	CG	3	6	1089105	1089110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2610	NC_014313	GC	3	6	1089121	1089126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2611	NC_014313	AAT	2	6	1090248	1090253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_014313	CAA	2	6	1090320	1090325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_014313	GCG	2	6	1090774	1090779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_014313	GC	3	6	1090804	1090809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2615	NC_014313	CG	3	6	1090830	1090835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2616	NC_014313	TCT	2	6	1090863	1090868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_014313	GCC	2	6	1090904	1090909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2618	NC_014313	GCC	2	6	1091992	1091997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2619	NC_014313	CGG	2	6	1092010	1092015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_014313	A	7	7	1094313	1094319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_014313	GTG	2	6	1094389	1094394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_014313	CCA	2	6	1097699	1097704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2623	NC_014313	ATT	2	6	1097756	1097761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_014313	GC	3	6	1097826	1097831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2625	NC_014313	GCC	2	6	1099370	1099375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2626	NC_014313	CGAG	2	8	1099412	1099419	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2627	NC_014313	TGG	2	6	1099493	1099498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_014313	A	7	7	1099644	1099650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_014313	GAT	2	6	1099699	1099704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_014313	GGT	2	6	1099707	1099712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_014313	GAACA	2	10	1102074	1102083	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2632	NC_014313	GGC	2	6	1102103	1102108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2633	NC_014313	CTA	2	6	1102126	1102131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2634	NC_014313	G	6	6	1102137	1102142	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2635	NC_014313	CCGG	2	8	1102211	1102218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2636	NC_014313	GCC	2	6	1102223	1102228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2637	NC_014313	CCGG	2	8	1102255	1102262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2638	NC_014313	CCG	2	6	1102275	1102280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2640	NC_014313	CTA	2	6	1102333	1102338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2642	NC_014313	GTC	2	6	1102838	1102843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2662	NC_014313	GGGGA	2	10	1106242	1106251	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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2758	NC_014313	GAG	2	6	1143939	1143944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2759	NC_014313	CGT	2	6	1144044	1144049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2763	NC_014313	GCT	2	6	1144564	1144569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2764	NC_014313	GCG	2	6	1144608	1144613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2765	NC_014313	CCG	2	6	1144688	1144693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2766	NC_014313	CTCC	2	8	1144694	1144701	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2767	NC_014313	ATC	2	6	1144754	1144759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2769	NC_014313	GC	3	6	1144785	1144790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2770	NC_014313	CA	3	6	1144894	1144899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2773	NC_014313	A	6	6	1144973	1144978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2795	NC_014313	ACG	3	9	1153308	1153316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2797	NC_014313	CG	3	6	1153342	1153347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2798	NC_014313	CGGC	2	8	1153351	1153358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2799	NC_014313	GC	3	6	1153378	1153383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2880	NC_014313	ATG	2	6	1212079	1212084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2883	NC_014313	TAA	2	6	1212137	1212142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2884	NC_014313	GATT	2	8	1212172	1212179	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2885	NC_014313	TCA	2	6	1212251	1212256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2890	NC_014313	ATT	2	6	1213877	1213882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2891	NC_014313	CG	3	6	1213892	1213897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2892	NC_014313	CAT	2	6	1213949	1213954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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