MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 chromosome

Total Repeats: 8719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_014313	C	6	6	864034	864039	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2002	NC_014313	CGG	2	6	865593	865598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_014313	CTT	2	6	868674	868679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_014313	CGA	2	6	868684	868689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_014313	CGG	2	6	869160	869165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_014313	TGC	2	6	869211	869216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NC_014313	GCG	2	6	869230	869235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_014313	CG	3	6	869237	869242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2009	NC_014313	CGG	2	6	870836	870841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_014313	ATG	2	6	870952	870957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_014313	CCCG	2	8	871510	871517	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2012	NC_014313	CGAT	2	8	872120	872127	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2013	NC_014313	TCGT	2	8	872142	872149	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2014	NC_014313	TAT	2	6	872172	872177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_014313	GA	3	6	873301	873306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_014313	CGTGC	2	10	876329	876338	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2017	NC_014313	GGCT	2	8	877489	877496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2018	NC_014313	CGG	3	9	877505	877513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_014313	TG	3	6	879845	879850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_014313	CGG	2	6	879912	879917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2021	NC_014313	CAT	2	6	879929	879934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2023	NC_014313	GCC	2	6	879991	879996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2024	NC_014313	CG	3	6	880033	880038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2025	NC_014313	GC	3	6	883137	883142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2026	NC_014313	GCG	2	6	883173	883178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2031	NC_014313	CG	3	6	883276	883281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2032	NC_014313	CG	3	6	883301	883306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2033	NC_014313	GCC	2	6	883458	883463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2034	NC_014313	TAAC	2	8	883483	883490	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2035	NC_014313	CATC	2	8	883516	883523	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2036	NC_014313	T	7	7	883574	883580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2037	NC_014313	GGTT	2	8	883630	883637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_014313	GCA	2	6	883664	883669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2039	NC_014313	AT	4	8	883820	883827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_014313	G	6	6	883856	883861	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_014313	GCG	2	6	883868	883873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2044	NC_014313	GTT	2	6	885220	885225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_014313	TGC	2	6	885228	885233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2047	NC_014313	GCG	2	6	887932	887937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2050	NC_014313	AGCGC	2	10	889158	889167	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2051	NC_014313	TCG	2	6	889202	889207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2052	NC_014313	ATG	2	6	889659	889664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_014313	CG	3	6	889665	889670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2054	NC_014313	CGC	2	6	889755	889760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2055	NC_014313	CGT	2	6	889781	889786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2057	NC_014313	T	7	7	890184	890190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_014313	GCG	2	6	890252	890257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2059	NC_014313	CGC	2	6	890303	890308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2060	NC_014313	CGGG	2	8	895461	895468	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2061	NC_014313	CCG	2	6	897282	897287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2062	NC_014313	GCA	2	6	897341	897346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2063	NC_014313	CGC	2	6	897402	897407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2064	NC_014313	GCTC	2	8	897529	897536	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2065	NC_014313	ATCG	2	8	897544	897551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2066	NC_014313	CGA	2	6	897555	897560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2072	NC_014313	GAGAG	2	10	899424	899433	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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2094	NC_014313	CTG	2	6	904836	904841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2095	NC_014313	AAGGC	2	10	904882	904891	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2096	NC_014313	GGA	2	6	904909	904914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2097	NC_014313	GTTC	2	8	904915	904922	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2098	NC_014313	AACG	2	8	904931	904938	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2099	NC_014313	GTCG	2	8	904976	904983	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2100	NC_014313	GAA	2	6	905341	905346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_014313	CAC	2	6	905694	905699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2102	NC_014313	CA	3	6	905732	905737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2103	NC_014313	GTG	2	6	905793	905798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2104	NC_014313	GGC	3	9	905824	905832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2105	NC_014313	CGT	2	6	905879	905884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2106	NC_014313	AG	3	6	905908	905913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2107	NC_014313	CCG	2	6	906237	906242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2108	NC_014313	CAA	2	6	906302	906307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2109	NC_014313	AGGC	2	8	906371	906378	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2110	NC_014313	GGGT	2	8	906385	906392	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2111	NC_014313	TGCG	2	8	907294	907301	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2112	NC_014313	GGCGC	2	10	907305	907314	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2113	NC_014313	GATG	2	8	907689	907696	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2116	NC_014313	GC	3	6	908676	908681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2117	NC_014313	CG	4	8	909654	909661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2118	NC_014313	TC	3	6	910709	910714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2119	NC_014313	CG	4	8	910730	910737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2120	NC_014313	GCT	2	6	912219	912224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2121	NC_014313	GC	3	6	912312	912317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2122	NC_014313	GCA	2	6	912320	912325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2124	NC_014313	GCG	2	6	913424	913429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2125	NC_014313	CGG	2	6	913551	913556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2126	NC_014313	GTGC	2	8	913574	913581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2127	NC_014313	GCG	2	6	914329	914334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2128	NC_014313	CG	3	6	914374	914379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2129	NC_014313	AT	3	6	914670	914675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2130	NC_014313	CAA	2	6	914693	914698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2132	NC_014313	A	6	6	914844	914849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2133	NC_014313	ATC	2	6	914873	914878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2134	NC_014313	GCG	2	6	918668	918673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2135	NC_014313	CGT	2	6	918699	918704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2136	NC_014313	CGT	2	6	918733	918738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2137	NC_014313	TC	3	6	919193	919198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2138	NC_014313	CGT	2	6	919277	919282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2139	NC_014313	TAC	2	6	920344	920349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2141	NC_014313	CGA	2	6	921146	921151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2142	NC_014313	GC	3	6	921161	921166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2143	NC_014313	T	7	7	921245	921251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2145	NC_014313	GTG	2	6	921299	921304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2152	NC_014313	GATCG	2	10	922831	922840	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2256	NC_014313	GGAC	2	8	943870	943877	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2257	NC_014313	CCA	2	6	943924	943929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2259	NC_014313	TCGA	2	8	943948	943955	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2260	NC_014313	CCA	2	6	945376	945381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2261	NC_014313	GCA	2	6	945452	945457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2262	NC_014313	GA	3	6	945470	945475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2263	NC_014313	TGC	2	6	948880	948885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2264	NC_014313	C	6	6	950488	950493	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2265	NC_014313	TGC	2	6	954541	954546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2266	NC_014313	CCT	2	6	954573	954578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2267	NC_014313	TGCG	2	8	954596	954603	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2268	NC_014313	GTC	2	6	954636	954641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2269	NC_014313	GC	3	6	954670	954675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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