MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 chromosome

Total Repeats: 8719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014313	T	7	7	2432730	2432736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_014313	GC	3	6	2432744	2432749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_014313	GC	3	6	2432790	2432795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_014313	A	6	6	2432811	2432816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_014313	CCG	2	6	2432839	2432844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6006	NC_014313	TGTT	2	8	2432857	2432864	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_014313	GGC	2	6	2433763	2433768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_014313	CG	3	6	2433797	2433802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_014313	AGG	2	6	2433856	2433861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_014313	CGGG	2	8	2433864	2433871	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6011	NC_014313	GGA	2	6	2441078	2441083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_014313	GCT	2	6	2441902	2441907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_014313	GC	3	6	2441921	2441926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6014	NC_014313	GCC	2	6	2443640	2443645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6015	NC_014313	GAC	2	6	2443657	2443662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_014313	CTTT	2	8	2443682	2443689	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6017	NC_014313	CG	4	8	2443900	2443907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6018	NC_014313	CCG	2	6	2443908	2443913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_014313	GAG	2	6	2443955	2443960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_014313	CAG	2	6	2445868	2445873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_014313	CGG	3	9	2445884	2445892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_014313	AGA	2	6	2445893	2445898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_014313	CCG	2	6	2445905	2445910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6024	NC_014313	G	6	6	2446211	2446216	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_014313	ACG	2	6	2446639	2446644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_014313	CCG	2	6	2446651	2446656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6027	NC_014313	CG	3	6	2447374	2447379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6028	NC_014313	TCTT	2	8	2447391	2447398	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6029	NC_014313	CAA	2	6	2447405	2447410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_014313	GAG	2	6	2447415	2447420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_014313	ACG	2	6	2447508	2447513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_014313	TGT	2	6	2447626	2447631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_014313	CAA	2	6	2447645	2447650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_014313	GAA	2	6	2447685	2447690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_014313	G	6	6	2447745	2447750	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_014313	CA	3	6	2447762	2447767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_014313	GCTTG	2	10	2447825	2447834	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6038	NC_014313	CGG	2	6	2447835	2447840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_014313	G	6	6	2447845	2447850	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_014313	GGC	2	6	2447858	2447863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_014313	TCG	2	6	2447905	2447910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_014313	GC	3	6	2447931	2447936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6043	NC_014313	GC	3	6	2449316	2449321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_014313	TGCC	2	8	2449336	2449343	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_014313	TCA	2	6	2449879	2449884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_014313	GGT	2	6	2449941	2449946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_014313	CG	3	6	2450921	2450926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6048	NC_014313	AATC	2	8	2450944	2450951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6049	NC_014313	CTTGC	2	10	2450970	2450979	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6050	NC_014313	CGAT	2	8	2451059	2451066	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6051	NC_014313	TCG	2	6	2452112	2452117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_014313	ACG	2	6	2452134	2452139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_014313	AGT	2	6	2452170	2452175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_014313	AGC	2	6	2452325	2452330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_014313	GACC	2	8	2452336	2452343	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_014313	GC	3	6	2452364	2452369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_014313	TCA	2	6	2452390	2452395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_014313	ACG	2	6	2452480	2452485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_014313	GCC	2	6	2452488	2452493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_014313	GCT	3	9	2452561	2452569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_014313	T	6	6	2453236	2453241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_014313	GGC	2	6	2454331	2454336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_014313	CGC	2	6	2454357	2454362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_014313	GCG	2	6	2454391	2454396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_014313	CT	3	6	2455293	2455298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6066	NC_014313	AGA	2	6	2455311	2455316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_014313	TGC	2	6	2456430	2456435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_014313	ACG	2	6	2456526	2456531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_014313	AGG	2	6	2456685	2456690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_014313	CCG	2	6	2456726	2456731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6071	NC_014313	GGGC	2	8	2457663	2457670	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6072	NC_014313	GGA	2	6	2457716	2457721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_014313	GC	3	6	2458193	2458198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6074	NC_014313	CACG	2	8	2458764	2458771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6075	NC_014313	CGGGCG	2	12	2458821	2458832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_014313	CAC	2	6	2458921	2458926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6077	NC_014313	GACGC	2	10	2458938	2458947	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6078	NC_014313	AGG	2	6	2461134	2461139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_014313	GC	3	6	2462416	2462421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6080	NC_014313	AC	3	6	2462425	2462430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6081	NC_014313	CTTT	2	8	2462448	2462455	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6082	NC_014313	TGC	2	6	2462456	2462461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_014313	CAT	2	6	2462472	2462477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_014313	TCA	2	6	2463572	2463577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_014313	GCC	2	6	2463623	2463628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6086	NC_014313	ACT	2	6	2463659	2463664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_014313	CG	3	6	2465021	2465026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6088	NC_014313	TTTCG	2	10	2465036	2465045	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6089	NC_014313	GCC	2	6	2466810	2466815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_014313	TTA	2	6	2466843	2466848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_014313	CGG	2	6	2466902	2466907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_014313	ACA	2	6	2468237	2468242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_014313	GCC	2	6	2469197	2469202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6094	NC_014313	GCA	2	6	2469321	2469326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_014313	GAAC	2	8	2469337	2469344	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6096	NC_014313	GC	4	8	2469417	2469424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6097	NC_014313	GC	3	6	2469426	2469431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6098	NC_014313	GCG	2	6	2470369	2470374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_014313	GCG	2	6	2470381	2470386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_014313	TCGC	2	8	2470456	2470463	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6101	NC_014313	CTG	2	6	2471883	2471888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_014313	CGC	2	6	2471955	2471960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6103	NC_014313	ATC	2	6	2472065	2472070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_014313	GGC	2	6	2472073	2472078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_014313	GTC	2	6	2473609	2473614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_014313	CGC	2	6	2476797	2476802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6107	NC_014313	G	7	7	2476812	2476818	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_014313	GGTC	2	8	2476865	2476872	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6109	NC_014313	CCACC	2	10	2476899	2476908	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6110	NC_014313	AGGGG	2	10	2476927	2476936	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_014313	TCG	2	6	2476952	2476957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_014313	CAAA	2	8	2476996	2477003	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6113	NC_014313	GCCCTG	2	12	2481504	2481515	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6114	NC_014313	CCCG	2	8	2482493	2482500	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6115	NC_014313	TCCGC	2	10	2483187	2483196	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6116	NC_014313	GCG	2	6	2483357	2483362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_014313	CGA	2	6	2483462	2483467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_014313	TGG	2	6	2483498	2483503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_014313	CAA	2	6	2483516	2483521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_014313	ACA	2	6	2483561	2483566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_014313	TTG	2	6	2484048	2484053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_014313	ATT	2	6	2484064	2484069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_014313	CCG	2	6	2484105	2484110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6124	NC_014313	AAG	2	6	2484117	2484122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_014313	TC	3	6	2485470	2485475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_014313	CCAT	2	8	2487884	2487891	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6127	NC_014313	GAA	2	6	2487895	2487900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_014313	TCGG	2	8	2487910	2487917	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6129	NC_014313	GC	3	6	2487919	2487924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6130	NC_014313	AGA	2	6	2487939	2487944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_014313	CG	3	6	2487955	2487960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6132	NC_014313	TCGC	2	8	2487969	2487976	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6133	NC_014313	GAT	2	6	2487990	2487995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_014313	CTGA	2	8	2488008	2488015	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6135	NC_014313	CGC	2	6	2488023	2488028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6136	NC_014313	CGC	2	6	2488055	2488060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6137	NC_014313	GGT	2	6	2488111	2488116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6138	NC_014313	CG	4	8	2488142	2488149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6139	NC_014313	AATG	2	8	2488235	2488242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6142	NC_014313	TCAA	2	8	2488311	2488318	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6143	NC_014313	A	7	7	2488384	2488390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6144	NC_014313	AC	3	6	2488450	2488455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6145	NC_014313	A	7	7	2488486	2488492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6146	NC_014313	GGT	2	6	2488834	2488839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6147	NC_014313	GGC	2	6	2491852	2491857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6154	NC_014313	CG	3	6	2498375	2498380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6155	NC_014313	ACT	2	6	2498432	2498437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6157	NC_014313	GCG	2	6	2498786	2498791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6162	NC_014313	GCA	2	6	2501228	2501233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6163	NC_014313	GATG	2	8	2501284	2501291	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6164	NC_014313	CT	3	6	2501847	2501852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6165	NC_014313	TACGT	2	10	2501905	2501914	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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6168	NC_014313	TCTT	2	8	2502105	2502112	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6169	NC_014313	GGA	2	6	2502121	2502126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6251	NC_014313	A	6	6	2534670	2534675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6252	NC_014313	CCG	2	6	2534678	2534683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6260	NC_014313	GCC	2	6	2535154	2535159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6262	NC_014313	CG	3	6	2535293	2535298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6263	NC_014313	CCG	2	6	2535326	2535331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6266	NC_014313	GAC	2	6	2535402	2535407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6267	NC_014313	AGC	2	6	2535409	2535414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6269	NC_014313	CGT	2	6	2538209	2538214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6271	NC_014313	CG	3	6	2539249	2539254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6343	NC_014313	GTTAT	2	10	2557327	2557336	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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6355	NC_014313	AAC	2	6	2563668	2563673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6366	NC_014313	AACG	2	8	2568309	2568316	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6381	NC_014313	A	6	6	2578338	2578343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6382	NC_014313	CGG	2	6	2578382	2578387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6383	NC_014313	CTC	2	6	2579269	2579274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6385	NC_014313	GGC	2	6	2581227	2581232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6386	NC_014313	CGCAAA	2	12	2584542	2584553	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6388	NC_014313	CGT	2	6	2584561	2584566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6389	NC_014313	GGC	3	9	2584588	2584596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6391	NC_014313	CCG	2	6	2585676	2585681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6392	NC_014313	CGT	2	6	2585767	2585772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6393	NC_014313	TGCG	2	8	2585777	2585784	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6394	NC_014313	ATG	2	6	2587023	2587028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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