MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 chromosome

Total Repeats: 8719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014313	GCG	2	6	2245486	2245491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_014313	C	6	6	2245492	2245497	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5503	NC_014313	TCCAC	2	10	2248655	2248664	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5504	NC_014313	CCA	2	6	2248668	2248673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_014313	GA	3	6	2248676	2248681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_014313	TCG	2	6	2248745	2248750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_014313	GC	3	6	2248773	2248778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_014313	GTC	2	6	2248874	2248879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_014313	CGG	2	6	2248942	2248947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_014313	CTC	2	6	2248952	2248957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5511	NC_014313	CAAA	2	8	2248976	2248983	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5512	NC_014313	A	7	7	2248981	2248987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_014313	CCGG	2	8	2248996	2249003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_014313	GCC	2	6	2249534	2249539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5515	NC_014313	CAA	2	6	2249568	2249573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_014313	GCG	2	6	2249576	2249581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_014313	GAA	2	6	2249670	2249675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_014313	GGC	3	9	2249676	2249684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_014313	A	6	6	2249694	2249699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_014313	AGA	2	6	2252874	2252879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_014313	ACG	2	6	2252916	2252921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_014313	C	6	6	2252959	2252964	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5523	NC_014313	CG	3	6	2253041	2253046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5524	NC_014313	CG	4	8	2253082	2253089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_014313	GA	3	6	2253126	2253131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_014313	CCGCG	2	10	2253232	2253241	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5527	NC_014313	TTGC	2	8	2253270	2253277	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5528	NC_014313	GCCG	2	8	2253301	2253308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5529	NC_014313	GCCG	2	8	2253357	2253364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5530	NC_014313	CGT	2	6	2253382	2253387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_014313	GCCG	2	8	2253420	2253427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5532	NC_014313	ACCG	2	8	2253449	2253456	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_014313	GT	3	6	2253468	2253473	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_014313	CGT	2	6	2253474	2253479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_014313	GCCG	2	8	2253521	2253528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5536	NC_014313	GT	3	6	2253540	2253545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_014313	CGT	2	6	2253546	2253551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_014313	CGAG	2	8	2253568	2253575	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5539	NC_014313	CGG	2	6	2253607	2253612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_014313	GCC	2	6	2253652	2253657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_014313	AC	3	6	2253664	2253669	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5542	NC_014313	CCGG	2	8	2253681	2253688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5543	NC_014313	GGC	2	6	2254089	2254094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_014313	GCCG	2	8	2254139	2254146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_014313	CAAA	2	8	2254230	2254237	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5546	NC_014313	A	6	6	2254235	2254240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_014313	CGGA	2	8	2254243	2254250	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5548	NC_014313	CCG	2	6	2254286	2254291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5549	NC_014313	TCC	2	6	2254610	2254615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_014313	CA	3	6	2254671	2254676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5551	NC_014313	TGC	2	6	2254812	2254817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_014313	GAG	2	6	2254921	2254926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_014313	GGC	2	6	2255647	2255652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_014313	CAT	2	6	2255964	2255969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_014313	TA	3	6	2255995	2256000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_014313	CCG	2	6	2256034	2256039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5557	NC_014313	CGG	3	9	2256406	2256414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_014313	GCCG	2	8	2256467	2256474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5559	NC_014313	TTC	2	6	2256484	2256489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_014313	GCCG	2	8	2256517	2256524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5561	NC_014313	A	6	6	2256540	2256545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_014313	GC	3	6	2256558	2256563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5563	NC_014313	GCG	2	6	2257431	2257436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_014313	GCG	2	6	2257755	2257760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_014313	ATTT	2	8	2257762	2257769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_014313	TGT	2	6	2257786	2257791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_014313	C	6	6	2260392	2260397	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5568	NC_014313	GC	3	6	2260401	2260406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5569	NC_014313	CCT	2	6	2260708	2260713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5570	NC_014313	GCAGA	2	10	2260739	2260748	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5571	NC_014313	GC	3	6	2260758	2260763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5572	NC_014313	GCA	2	6	2260906	2260911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_014313	TTTC	2	8	2261108	2261115	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5574	NC_014313	GCG	2	6	2262177	2262182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_014313	CGC	2	6	2262188	2262193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5576	NC_014313	GCG	2	6	2262278	2262283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_014313	ACA	2	6	2262308	2262313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_014313	CTG	2	6	2263493	2263498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_014313	TG	3	6	2263517	2263522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_014313	ACG	2	6	2263555	2263560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_014313	TGC	2	6	2264110	2264115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_014313	CGG	2	6	2264125	2264130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_014313	TCAGA	2	10	2264167	2264176	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5584	NC_014313	CGCGA	2	10	2264189	2264198	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5585	NC_014313	CA	3	6	2264215	2264220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5586	NC_014313	GCA	2	6	2264242	2264247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_014313	TGC	2	6	2264284	2264289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_014313	GC	3	6	2264337	2264342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5589	NC_014313	TGC	2	6	2264353	2264358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_014313	ACG	2	6	2264363	2264368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_014313	ATTT	2	8	2264716	2264723	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_014313	GAC	2	6	2264734	2264739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_014313	GCC	2	6	2264741	2264746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5594	NC_014313	GCG	3	9	2265165	2265173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_014313	GC	3	6	2265825	2265830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5596	NC_014313	GCC	2	6	2265860	2265865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5597	NC_014313	CGA	2	6	2265869	2265874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_014313	GCC	3	9	2265877	2265885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5599	NC_014313	CCCG	2	8	2265900	2265907	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5600	NC_014313	GAC	2	6	2266379	2266384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_014313	CT	3	6	2268498	2268503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5602	NC_014313	CGG	2	6	2268516	2268521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_014313	TAGG	2	8	2272010	2272017	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_014313	GCG	2	6	2274196	2274201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_014313	GCGCC	2	10	2274208	2274217	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5606	NC_014313	GCC	2	6	2274225	2274230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5607	NC_014313	T	6	6	2274253	2274258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_014313	TGGC	2	8	2274277	2274284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5609	NC_014313	ACA	2	6	2274299	2274304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_014313	GCTA	2	8	2274362	2274369	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5611	NC_014313	CAT	2	6	2274413	2274418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_014313	CGCA	2	8	2276652	2276659	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_014313	CG	3	6	2277948	2277953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5614	NC_014313	GCG	2	6	2279584	2279589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_014313	GCG	2	6	2279622	2279627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_014313	GAA	2	6	2279632	2279637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_014313	ACC	2	6	2280093	2280098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5618	NC_014313	CCT	2	6	2280119	2280124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5619	NC_014313	GCGT	2	8	2280153	2280160	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5620	NC_014313	GAGTGC	2	12	2280266	2280277	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5621	NC_014313	CGC	2	6	2280857	2280862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5622	NC_014313	GCC	2	6	2280878	2280883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5623	NC_014313	TTG	2	6	2282116	2282121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_014313	CG	3	6	2283585	2283590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5625	NC_014313	CCTGC	2	10	2285087	2285096	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5626	NC_014313	GCG	2	6	2285124	2285129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_014313	TCC	2	6	2285153	2285158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5628	NC_014313	TTG	2	6	2285228	2285233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_014313	C	6	6	2285248	2285253	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5630	NC_014313	CGC	2	6	2286367	2286372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5631	NC_014313	GTG	2	6	2286381	2286386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_014313	GCC	2	6	2286390	2286395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5633	NC_014313	GCGCTC	2	12	2286405	2286416	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5634	NC_014313	CGG	2	6	2286499	2286504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5635	NC_014313	GC	3	6	2286513	2286518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5636	NC_014313	CGT	2	6	2286524	2286529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5642	NC_014313	AAAAG	2	10	2287683	2287692	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5669	NC_014313	GA	3	6	2298445	2298450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5753	NC_014313	CCGAT	2	10	2327481	2327490	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5755	NC_014313	CG	4	8	2327924	2327931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5756	NC_014313	GCG	2	6	2327949	2327954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5881	NC_014313	CGCTC	2	10	2382579	2382588	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5882	NC_014313	CG	3	6	2382778	2382783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5883	NC_014313	CGC	2	6	2382814	2382819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5887	NC_014313	GCGG	2	8	2385268	2385275	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5888	NC_014313	GCGCC	2	10	2385286	2385295	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5889	NC_014313	ACGC	2	8	2385339	2385346	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5890	NC_014313	CCA	2	6	2385815	2385820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5891	NC_014313	GCATG	2	10	2385937	2385946	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5892	NC_014313	CCA	2	6	2385978	2385983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5893	NC_014313	GC	3	6	2385995	2386000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5894	NC_014313	GCC	2	6	2386002	2386007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5895	NC_014313	GC	3	6	2386019	2386024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5897	NC_014313	GCA	2	6	2386445	2386450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5997	NC_014313	GCCA	2	8	2432059	2432066	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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