MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 chromosome

Total Repeats: 8719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014313	GCT	2	6	1934602	1934607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_014313	GCCGC	2	10	1934619	1934628	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4503	NC_014313	ACG	2	6	1934640	1934645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_014313	CAAGAA	2	12	1934710	1934721	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4505	NC_014313	CGT	2	6	1934722	1934727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_014313	GCG	2	6	1934751	1934756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_014313	GTGGAC	2	12	1934761	1934772	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4508	NC_014313	GAC	2	6	1934889	1934894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_014313	CGTAG	2	10	1934998	1935007	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4510	NC_014313	GAA	2	6	1935051	1935056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_014313	TCG	2	6	1935065	1935070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_014313	GCATGA	2	12	1935131	1935142	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4513	NC_014313	CGCC	2	8	1935150	1935157	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4514	NC_014313	AAG	2	6	1935175	1935180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_014313	GCCA	2	8	1935184	1935191	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4516	NC_014313	CTT	2	6	1935214	1935219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_014313	T	7	7	1935218	1935224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_014313	CGG	2	6	1935273	1935278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_014313	CAC	2	6	1935283	1935288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_014313	GCT	2	6	1935292	1935297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_014313	CGA	2	6	1935354	1935359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_014313	AAG	2	6	1935365	1935370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_014313	CG	4	8	1935403	1935410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4524	NC_014313	ACGAG	2	10	1935427	1935436	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4525	NC_014313	TACA	2	8	1935448	1935455	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4526	NC_014313	CGC	2	6	1935507	1935512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_014313	CGAATG	2	12	1938623	1938634	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4528	NC_014313	TGC	3	9	1940281	1940289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_014313	CCGCA	2	10	1940306	1940315	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4530	NC_014313	GAA	2	6	1940404	1940409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_014313	GGC	2	6	1940434	1940439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_014313	CGG	2	6	1945604	1945609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_014313	GCC	2	6	1946687	1946692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_014313	CCG	2	6	1946699	1946704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4535	NC_014313	TGAA	2	8	1946739	1946746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_014313	AATC	2	8	1946784	1946791	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4537	NC_014313	GCC	3	9	1946838	1946846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4538	NC_014313	GCC	2	6	1949286	1949291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4539	NC_014313	GC	3	6	1949308	1949313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4540	NC_014313	CGG	2	6	1949317	1949322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_014313	CGT	2	6	1949339	1949344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_014313	TCT	2	6	1949356	1949361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_014313	GTT	2	6	1949375	1949380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_014313	CAA	2	6	1949409	1949414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_014313	CTT	2	6	1949423	1949428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_014313	C	6	6	1949435	1949440	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4547	NC_014313	CTG	2	6	1949457	1949462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_014313	GAATC	2	10	1950719	1950728	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4549	NC_014313	GCG	2	6	1950729	1950734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_014313	TCC	2	6	1954302	1954307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4551	NC_014313	GCC	2	6	1954323	1954328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4552	NC_014313	A	6	6	1955140	1955145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_014313	CG	3	6	1955182	1955187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_014313	TGT	2	6	1956164	1956169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_014313	GGC	2	6	1957345	1957350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_014313	GCC	2	6	1957389	1957394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4557	NC_014313	CCG	2	6	1957477	1957482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4558	NC_014313	GCC	2	6	1957498	1957503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4559	NC_014313	ACGGC	2	10	1957540	1957549	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4560	NC_014313	GGCTG	2	10	1957978	1957987	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4561	NC_014313	AGA	2	6	1958019	1958024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_014313	CGT	2	6	1958392	1958397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_014313	ATT	2	6	1958408	1958413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_014313	CGTGCG	2	12	1958432	1958443	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_014313	CAT	2	6	1962027	1962032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_014313	GC	3	6	1964109	1964114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4567	NC_014313	T	6	6	1965731	1965736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_014313	CGTG	2	8	1965825	1965832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4569	NC_014313	TGCC	2	8	1966177	1966184	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4570	NC_014313	CGG	2	6	1966195	1966200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_014313	CGT	2	6	1966614	1966619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_014313	GGC	2	6	1966641	1966646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_014313	TCGT	2	8	1974103	1974110	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4574	NC_014313	CCG	2	6	1978815	1978820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4575	NC_014313	GGTCA	2	10	1981326	1981335	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4576	NC_014313	ACGA	2	8	1981337	1981344	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4577	NC_014313	CGCCA	2	10	1981353	1981362	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4578	NC_014313	GAA	2	6	1981420	1981425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_014313	GCG	2	6	1981451	1981456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_014313	AGCA	2	8	1981482	1981489	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4581	NC_014313	TGA	2	6	1981524	1981529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_014313	GTT	2	6	1982058	1982063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_014313	CG	3	6	1982115	1982120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4584	NC_014313	CCG	2	6	1982130	1982135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4585	NC_014313	GGCA	2	8	1982152	1982159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4586	NC_014313	CG	3	6	1982186	1982191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4587	NC_014313	CGG	2	6	1982210	1982215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_014313	CG	3	6	1982230	1982235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4589	NC_014313	CCG	2	6	1982240	1982245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4590	NC_014313	GGAACC	2	12	1984224	1984235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_014313	GCC	2	6	1986310	1986315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4592	NC_014313	CGGC	2	8	1986534	1986541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4593	NC_014313	CGC	2	6	1986553	1986558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4594	NC_014313	T	6	6	1986575	1986580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_014313	CCGG	2	8	1986671	1986678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4596	NC_014313	CG	3	6	1987021	1987026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4597	NC_014313	TGA	2	6	1987056	1987061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_014313	CACT	2	8	1987100	1987107	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4599	NC_014313	TCG	2	6	1987132	1987137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_014313	TG	3	6	1987139	1987144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_014313	GCA	2	6	1987204	1987209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_014313	GC	3	6	1987227	1987232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4603	NC_014313	CGC	2	6	1987297	1987302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4604	NC_014313	CAA	2	6	1987610	1987615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_014313	CG	3	6	1987616	1987621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4606	NC_014313	CG	3	6	1987642	1987647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4607	NC_014313	CTT	2	6	1987653	1987658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_014313	CG	3	6	1987715	1987720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4609	NC_014313	CCG	2	6	1987737	1987742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4610	NC_014313	CGG	2	6	1988189	1988194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_014313	CGG	2	6	1988217	1988222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_014313	ATTGC	2	10	1988234	1988243	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4613	NC_014313	CGC	2	6	1988276	1988281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4614	NC_014313	ACA	2	6	1988319	1988324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_014313	CG	3	6	1990606	1990611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4616	NC_014313	GCG	2	6	1990613	1990618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_014313	GCG	2	6	1991734	1991739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_014313	GC	3	6	1991779	1991784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4619	NC_014313	TTG	2	6	1991798	1991803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_014313	TGC	2	6	1991840	1991845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_014313	CGA	2	6	1991907	1991912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_014313	TAC	2	6	1991916	1991921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_014313	GTT	2	6	1991929	1991934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_014313	ATT	2	6	1991970	1991975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_014313	ATTT	2	8	1991983	1991990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_014313	AT	3	6	1992015	1992020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_014313	ACTT	2	8	1992051	1992058	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4628	NC_014313	CCGA	2	8	1994006	1994013	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4629	NC_014313	CGG	3	9	1994016	1994024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_014313	CGC	2	6	1994028	1994033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4631	NC_014313	CGG	2	6	1994040	1994045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_014313	TGCGAA	2	12	1994053	1994064	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4633	NC_014313	GA	3	6	1994129	1994134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_014313	CCG	2	6	1994156	1994161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4635	NC_014313	GCG	2	6	1994169	1994174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4636	NC_014313	CGT	2	6	1994230	1994235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4662	NC_014313	CGTCC	2	10	1998746	1998755	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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4745	NC_014313	TCGC	2	8	2030577	2030584	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4746	NC_014313	GGCG	2	8	2031270	2031277	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4747	NC_014313	GGAGT	2	10	2031290	2031299	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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4750	NC_014313	CG	3	6	2032891	2032896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4751	NC_014313	CTC	2	6	2034247	2034252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4755	NC_014313	GTT	2	6	2037737	2037742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4760	NC_014313	TTCG	2	8	2044595	2044602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4761	NC_014313	CTA	2	6	2044616	2044621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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