MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 3

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014300	GTC	2	6	2092	2097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014300	TGG	2	6	2109	2114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014300	GTC	2	6	2207	2212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014300	ACG	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014300	GTC	2	6	3273	3278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014300	AAC	2	6	3279	3284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014300	AGA	2	6	4033	4038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014300	GTG	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014300	CTC	2	6	4544	4549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_014300	GAC	2	6	4675	4680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014300	ATG	2	6	4764	4769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014300	CTT	2	6	4771	4776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014300	GGC	2	6	4864	4869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014300	CGC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014300	TCG	3	9	6231	6239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014300	CAC	2	6	6454	6459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014300	TCG	2	6	6592	6597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014300	GTG	2	6	6608	6613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014300	TCG	2	6	6620	6625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014300	CCT	2	6	6629	6634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014300	TGG	2	6	6715	6720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014300	GTC	2	6	6908	6913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014300	GAT	2	6	6926	6931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014300	TCC	2	6	7406	7411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014300	CGA	3	9	11694	11702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014300	AGC	2	6	11752	11757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014300	TCG	2	6	11760	11765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014300	TAG	2	6	12545	12550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014300	TCT	2	6	12555	12560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014300	GTC	3	9	12800	12808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014300	GTG	2	6	12859	12864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014300	TGA	2	6	12868	12873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014300	AAC	2	6	13607	13612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014300	TGA	2	6	13643	13648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014300	GAC	2	6	16424	16429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014300	CGT	2	6	16544	16549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014300	TCG	2	6	16694	16699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014300	ATT	2	6	17573	17578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014300	GTT	2	6	17603	17608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014300	ACG	2	6	17623	17628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014300	AAT	2	6	17690	17695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014300	TCT	2	6	17698	17703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014300	TTC	2	6	17762	17767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014300	CAA	2	6	17778	17783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014300	ATG	2	6	17793	17798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014300	GTG	2	6	19259	19264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014300	CTC	2	6	20551	20556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_014300	CTT	2	6	20796	20801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014300	TGG	2	6	20805	20810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014300	GTT	2	6	20849	20854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014300	AAG	2	6	30104	30109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014300	ATA	2	6	30130	30135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014300	GCT	2	6	32542	32547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014300	CAA	2	6	32675	32680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014300	CGC	2	6	33214	33219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_014300	ACT	2	6	33244	33249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014300	GAC	2	6	33272	33277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014300	AGC	2	6	33293	33298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014300	CGC	2	6	33306	33311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_014300	GCA	2	6	33361	33366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014300	CGG	2	6	33370	33375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014300	TAG	2	6	34638	34643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014300	ACT	2	6	34667	34672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014300	GTG	8	24	34685	34708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014300	GGT	2	6	34713	34718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014300	TTC	2	6	34777	34782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014300	TGG	2	6	34904	34909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014300	GAC	2	6	35182	35187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014300	AGT	2	6	35247	35252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014300	GAC	2	6	36260	36265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014300	ACG	2	6	36347	36352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014300	GGA	2	6	36379	36384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014300	AGG	2	6	36404	36409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014300	TTG	2	6	38878	38883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014300	GTG	2	6	40032	40037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014300	TTA	2	6	40051	40056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014300	GTG	2	6	40068	40073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014300	CTT	2	6	40106	40111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014300	ATG	2	6	40173	40178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014300	GAT	2	6	40187	40192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014300	GCG	2	6	40244	40249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014300	CAG	2	6	40376	40381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014300	AAC	2	6	40415	40420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014300	CGG	2	6	40465	40470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014300	GTA	2	6	40552	40557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014300	TTC	3	9	40593	40601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014300	AGA	2	6	41250	41255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014300	AGT	2	6	41264	41269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014300	ACC	2	6	41291	41296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_014300	GAA	2	6	41302	41307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014300	CAA	2	6	41308	41313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014300	GAA	2	6	41314	41319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014300	GTG	2	6	41355	41360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014300	ACT	3	9	41409	41417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014300	GTT	2	6	41441	41446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014300	TCG	2	6	41492	41497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014300	ATC	2	6	42310	42315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014300	GGC	2	6	42321	42326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014300	TAA	2	6	42785	42790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014300	TGG	2	6	42871	42876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014300	CGA	2	6	43019	43024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014300	CAG	2	6	43097	43102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014300	GAT	2	6	43146	43151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014300	ACT	2	6	43153	43158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014300	CAG	2	6	43310	43315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014300	CGT	3	9	43656	43664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014300	ACC	2	6	43692	43697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_014300	TAC	2	6	43980	43985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014300	CCT	2	6	43986	43991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_014300	GAC	2	6	44480	44485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014300	CGT	2	6	44527	44532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.