MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 2

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014299	TCTAGA	2	12	18184	18195	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014299	GATCTA	3	18	18201	18218	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014299	TCATAT	2	12	18413	18424	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014299	TTAACG	2	12	31833	31844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014299	GGATGG	2	12	53003	53014	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014299	AGTCGG	2	12	84204	84215	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014299	AGGGGG	2	12	96107	96118	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014299	CTCCCG	2	12	99011	99022	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_014299	TTGGTG	2	12	99703	99714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014299	AGTCGA	2	12	117476	117487	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014299	GAACGC	2	12	119208	119219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014299	TGAAGC	2	12	119720	119731	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014299	GTTGTA	2	12	124455	124466	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014299	CTTCGA	2	12	133294	133305	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014299	AAGCCA	2	12	140794	140805	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014299	TCAGCG	2	12	146924	146935	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014299	TTGCCG	2	12	163782	163793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014299	CCCCCT	2	12	173950	173961	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
19	NC_014299	CGGTAG	2	12	175538	175549	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014299	TTGCCG	2	12	182549	182560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014299	CCCCCT	2	12	192717	192728	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
22	NC_014299	CGGTAG	2	12	194305	194316	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014299	CCAGTA	2	12	203790	203801	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014299	TCTGAT	2	12	204456	204467	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014299	GCAGTG	2	12	211416	211427	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014299	TTTGTT	2	12	233185	233196	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014299	ATCACG	2	12	234302	234313	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014299	CATACA	2	12	252199	252210	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014299	GCGGCC	2	12	260356	260367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014299	TATCGA	2	12	284988	284999	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014299	TCTCAC	2	12	298460	298471	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014299	CCCATT	2	12	314225	314236	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014299	CCCGAG	2	12	342911	342922	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.