MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 2

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014299	CTGGT	2	10	14020	14029	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014299	CGCGT	2	10	14055	14064	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014299	GCGGT	2	10	26878	26887	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014299	CCGCC	2	10	29082	29091	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5	NC_014299	GTGTC	2	10	37522	37531	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014299	TATTC	2	10	41872	41881	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014299	TCTGT	2	10	48050	48059	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014299	TCGAC	2	10	52371	52380	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014299	TTGAG	2	10	52779	52788	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014299	GATAC	2	10	53338	53347	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014299	AGTCA	2	10	57988	57997	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014299	ATCAC	2	10	59966	59975	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_014299	GATTC	2	10	68563	68572	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014299	GATTC	2	10	72452	72461	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014299	CGGTT	2	10	76680	76689	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014299	GGGTA	2	10	94855	94864	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014299	ATTCC	2	10	95287	95296	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_014299	CCAAC	2	10	95773	95782	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_014299	CGTTT	2	10	97313	97322	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014299	CTCTA	2	10	101183	101192	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_014299	TAATA	2	10	114122	114131	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014299	TTCCT	2	10	116759	116768	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014299	GCCTG	2	10	117460	117469	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_014299	GAATG	2	10	117556	117565	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014299	TGATT	2	10	117691	117700	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014299	GTTCC	2	10	124788	124797	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014299	GAAAA	2	10	125531	125540	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014299	ACGAG	2	10	125551	125560	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014299	ACTCA	2	10	133573	133582	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_014299	TCCGT	2	10	140739	140748	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_014299	TGTCG	2	10	140945	140954	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014299	AGAGA	2	10	145406	145415	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014299	ACCAC	2	10	146808	146817	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_014299	TACGA	2	10	153936	153945	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014299	AATAT	2	10	156655	156664	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014299	GCGAC	2	10	157407	157416	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014299	GAGAA	2	10	157715	157724	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014299	CGGTG	2	10	159876	159885	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014299	GCGGT	2	10	161993	162002	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014299	TATCT	2	10	162037	162046	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014299	GGTCC	2	10	165285	165294	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_014299	GGCCC	2	10	168542	168551	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_014299	CCGCT	2	10	169085	169094	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_014299	GAGAA	2	10	176482	176491	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014299	CGGTG	2	10	178643	178652	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014299	GCGGT	2	10	180760	180769	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014299	TATCT	2	10	180804	180813	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014299	GGTCC	2	10	184052	184061	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_014299	GGCCC	2	10	187309	187318	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_014299	CCGCT	2	10	187852	187861	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_014299	TCCGC	2	10	195630	195639	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
52	NC_014299	TAGAA	2	10	195648	195657	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014299	ACTAA	2	10	205138	205147	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014299	TTCCG	2	10	207126	207135	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014299	AAGCG	2	10	210254	210263	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014299	AGGGA	2	10	210320	210329	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014299	AACCA	2	10	219631	219640	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014299	TGACG	2	10	234204	234213	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014299	CCCAT	2	10	234318	234327	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
60	NC_014299	AGAGT	2	10	239181	239190	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014299	TCTTG	2	10	239718	239727	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014299	TATGA	2	10	239788	239797	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014299	ATCCA	2	10	244078	244087	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_014299	TCGTT	2	10	247740	247749	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014299	TTTTC	2	10	254935	254944	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014299	CCAAC	2	10	255601	255610	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_014299	GGAAA	2	10	255620	255629	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014299	ATACA	2	10	265769	265778	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014299	ACGGG	2	10	276422	276431	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014299	CACTA	2	10	286832	286841	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_014299	TCCCT	2	10	287019	287028	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
72	NC_014299	GACAG	2	10	287327	287336	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014299	CTCAC	2	10	291626	291635	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
74	NC_014299	GACTC	2	10	292544	292553	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_014299	CACGA	2	10	293318	293327	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_014299	AGTGC	2	10	295269	295278	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014299	GAACT	2	10	299657	299666	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014299	ACCCA	2	10	300912	300921	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
79	NC_014299	TACGT	2	10	309444	309453	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014299	CTCTG	2	10	314069	314078	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_014299	TACGA	2	10	322215	322224	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014299	CGAAC	2	10	323135	323144	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_014299	TCGTG	2	10	323302	323311	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014299	GGTGA	2	10	333733	333742	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014299	TAATA	2	10	334115	334124	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014299	GCCCA	2	10	342768	342777	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_014299	CGCCA	2	10	345353	345362	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_014299	GACGG	2	10	346150	346159	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014299	TACGA	2	10	346210	346219	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014299	CAAAC	2	10	347781	347790	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_014299	AACAG	2	10	348067	348076	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014299	AGGTA	2	10	362322	362331	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014299	ACCTC	2	10	362400	362409	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.