MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 1

Total Repeats: 409

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014298	CGTT	2	8	41	48	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014298	AAAC	2	8	127	134	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014298	ATCG	2	8	4568	4575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014298	GAGC	2	8	4908	4915	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014298	ATCG	2	8	6226	6233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014298	TGAT	2	8	6691	6698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014298	GCGT	2	8	6807	6814	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014298	CCAG	2	8	7256	7263	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014298	TTGA	2	8	7512	7519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014298	TGAC	2	8	16505	16512	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014298	TCCG	2	8	17674	17681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014298	TAGA	2	8	20701	20708	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014298	CAAA	2	8	21107	21114	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014298	AAGT	2	8	21121	21128	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014298	CTAT	2	8	22154	22161	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014298	GATG	2	8	22208	22215	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014298	CGCT	2	8	22445	22452	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014298	GAAC	2	8	22860	22867	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014298	TGAA	2	8	22894	22901	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014298	CGAG	2	8	22906	22913	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014298	AATA	2	8	23609	23616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014298	CAAG	2	8	24090	24097	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014298	TTGT	2	8	26005	26012	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014298	GATG	2	8	26309	26316	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014298	TAGC	2	8	27493	27500	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014298	CTGA	2	8	28661	28668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014298	GATA	2	8	28727	28734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014298	CGAT	2	8	30529	30536	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014298	ACTT	2	8	31191	31198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014298	ATCG	2	8	32108	32115	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014298	TCTG	2	8	32734	32741	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014298	TATC	2	8	32873	32880	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014298	GGTA	2	8	32920	32927	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014298	GTCG	2	8	33506	33513	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014298	CTCG	2	8	33531	33538	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014298	ATTG	2	8	33772	33779	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014298	AACG	2	8	34558	34565	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014298	TGGG	2	8	36083	36090	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014298	ACTG	2	8	36707	36714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014298	TACG	2	8	37318	37325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014298	GTTC	2	8	37782	37789	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014298	ATTT	2	8	37816	37823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014298	CGTC	2	8	41686	41693	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014298	CGAT	2	8	47764	47771	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014298	GAGT	2	8	53606	53613	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014298	GAAT	2	8	53745	53752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014298	CGGT	2	8	63105	63112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014298	ATGT	2	8	66348	66355	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014298	TCGC	2	8	67845	67852	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014298	CGTC	2	8	69216	69223	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014298	CTTG	2	8	69533	69540	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014298	CTTG	2	8	70126	70133	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014298	TGCA	2	8	71033	71040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014298	ACAG	2	8	71869	71876	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014298	CGAG	2	8	72496	72503	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014298	TGGG	2	8	72660	72667	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014298	CCAT	2	8	72875	72882	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014298	GTAT	2	8	73190	73197	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014298	TTCC	2	8	73602	73609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014298	GAGT	2	8	73611	73618	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014298	CGGC	2	8	73637	73644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014298	ATCG	2	8	74658	74665	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014298	ACTC	2	8	76019	76026	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014298	TCGA	2	8	76389	76396	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014298	ATCC	2	8	76792	76799	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014298	TATG	2	8	76862	76869	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014298	GTGC	2	8	76870	76877	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014298	GTAT	2	8	76939	76946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014298	CGTG	2	8	80017	80024	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014298	TCCC	2	8	80240	80247	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_014298	CGTG	2	8	81287	81294	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014298	TGCT	2	8	83375	83382	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014298	GTTC	2	8	84327	84334	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014298	CCCT	2	8	85568	85575	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_014298	GTCG	2	8	85682	85689	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014298	TAGA	2	8	87088	87095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014298	TAGA	2	8	88406	88413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014298	TTCG	2	8	88447	88454	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014298	TAGA	2	8	88530	88537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014298	TCAC	2	8	89371	89378	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014298	ACCG	2	8	89485	89492	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014298	GATA	2	8	90575	90582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014298	CGCC	2	8	90674	90681	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_014298	GTAC	2	8	94384	94391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014298	TACG	2	8	94876	94883	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014298	GTCC	2	8	95546	95553	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014298	GCCG	2	8	95653	95660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014298	GGTA	2	8	95740	95747	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014298	ATAG	2	8	96197	96204	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014298	GTGA	2	8	96416	96423	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014298	CGTT	2	8	96550	96557	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014298	TGAA	2	8	96947	96954	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014298	CGTT	2	8	98991	98998	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014298	AGTT	2	8	99158	99165	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014298	GCGA	2	8	99270	99277	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014298	GACT	2	8	103206	103213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014298	GCTC	2	8	103498	103505	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014298	CCGG	2	8	103679	103686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014298	TCGA	2	8	103862	103869	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014298	GGAA	2	8	104507	104514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014298	CGAG	2	8	104636	104643	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014298	CCGG	2	8	104684	104691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014298	TCGA	2	8	104940	104947	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014298	CGGG	2	8	107808	107815	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014298	TTTA	2	8	113280	113287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014298	TTGA	2	8	113330	113337	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014298	GGGC	2	8	113607	113614	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014298	CAGC	2	8	120751	120758	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014298	CGTC	2	8	120795	120802	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014298	CGGC	2	8	126405	126412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014298	CGGA	2	8	126445	126452	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014298	TCCA	2	8	130229	130236	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014298	GGAC	2	8	130765	130772	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014298	TAAA	2	8	132007	132014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014298	ACTA	2	8	133944	133951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014298	GTTC	2	8	134018	134025	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014298	CGTT	2	8	134032	134039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014298	CGGT	2	8	134045	134052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014298	ATAC	2	8	134550	134557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014298	TTGT	2	8	134587	134594	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014298	TATC	2	8	140427	140434	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014298	GAAC	2	8	141698	141705	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014298	TTTG	2	8	141755	141762	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014298	CAAT	2	8	141983	141990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014298	GATT	2	8	142056	142063	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014298	GTCA	2	8	144792	144799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014298	AACG	2	8	148394	148401	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014298	TGCC	2	8	149010	149017	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014298	TAGA	2	8	149201	149208	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014298	TCCC	2	8	151133	151140	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
131	NC_014298	CGGT	2	8	151274	151281	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014298	GCCC	2	8	151291	151298	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_014298	ATCA	2	8	151662	151669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014298	GCTA	2	8	153151	153158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014298	GAAA	2	8	153172	153179	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014298	ATTC	2	8	153212	153219	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014298	TCCG	2	8	154680	154687	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014298	TTCT	2	8	156701	156708	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014298	TGGG	2	8	156857	156864	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014298	AAAT	2	8	158432	158439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014298	ATAA	2	8	158459	158466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014298	ACGA	2	8	158679	158686	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014298	CGAA	2	8	158934	158941	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014298	ATCG	2	8	163237	163244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014298	GGAC	2	8	163534	163541	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014298	CTTC	2	8	163591	163598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014298	TCGC	2	8	163605	163612	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014298	CCGA	2	8	163826	163833	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014298	TTTG	2	8	163894	163901	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014298	GCTG	2	8	164570	164577	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014298	TGGC	2	8	166584	166591	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_014298	CGGT	2	8	168292	168299	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_014298	ATCA	2	8	168566	168573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.