MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 chromosome

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014297	ACCGGA	2	12	7071	7082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014297	TTATAT	2	12	81260	81271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014297	ACCTCG	2	12	193993	194004	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014297	TATAAA	2	12	195840	195851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014297	CGGTCG	2	12	208004	208015	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014297	GCTACC	2	12	330245	330256	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014297	CGGATC	2	12	353883	353894	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014297	TGCCGT	2	12	376908	376919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014297	CTATCC	2	12	398004	398015	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014297	TAGGTG	2	12	418319	418330	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014297	TTGGCT	2	12	424391	424402	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014297	GGACGC	2	12	455714	455725	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014297	TCGGGT	2	12	458814	458825	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014297	CATTTC	2	12	462099	462110	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014297	TTGCTC	2	12	492625	492636	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014297	AGCGAT	2	12	498671	498682	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014297	CCGATC	2	12	504305	504316	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014297	GATGTG	2	12	531203	531214	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014297	TCAATT	2	12	537168	537179	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014297	ACCGAA	2	12	538051	538062	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014297	TTATAC	2	12	547664	547675	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014297	AGATCA	2	12	549840	549851	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014297	TTACTC	2	12	576155	576166	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014297	TATCGA	2	12	603103	603114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014297	TGAAAC	2	12	605810	605821	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014297	CCGAAC	2	12	624128	624139	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014297	TATAAC	2	12	693724	693735	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014297	CGATCG	2	12	699760	699771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014297	AGTCCG	2	12	741138	741149	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014297	CTCTCA	2	12	760085	760096	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014297	TCCCGG	2	12	795444	795455	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014297	GGTGTC	2	12	804481	804492	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014297	CTCGCG	2	12	876104	876115	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014297	GGATCT	2	12	892167	892178	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014297	CGCGAG	2	12	903293	903304	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014297	GCCCGC	2	12	903341	903352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014297	TGCTAA	2	12	951530	951541	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014297	CGAAGC	2	12	987107	987118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014297	TCCTGA	2	12	1021535	1021546	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014297	CCGCGT	2	12	1058421	1058432	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014297	TAATGA	2	12	1097194	1097205	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014297	TTCGTA	2	12	1110303	1110314	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014297	ATTTCT	2	12	1110484	1110495	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014297	TTGCGC	2	12	1177832	1177843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014297	GGATCG	2	12	1213932	1213943	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014297	GATACG	2	12	1259753	1259764	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014297	TACTCA	2	12	1292357	1292368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014297	CCGAAA	2	12	1345137	1345148	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014297	ATTGCT	2	12	1359300	1359311	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014297	AGATGG	2	12	1359425	1359436	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014297	ACCGGT	2	12	1386948	1386959	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014297	AGATAT	2	12	1419797	1419808	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014297	CCGAGC	2	12	1446017	1446028	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014297	TAACCC	2	12	1484598	1484609	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014297	TGTTTA	2	12	1514165	1514176	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014297	ACTCAC	2	12	1577564	1577575	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014297	CCGTAC	2	12	1585867	1585878	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014297	TTACAC	2	12	1585918	1585929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014297	CGGCGA	2	12	1609072	1609083	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014297	ACAGCG	2	12	1609132	1609143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014297	TTTCGC	2	12	1630385	1630396	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014297	ACCGAC	2	12	1708056	1708067	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014297	CCCCCG	2	12	1730119	1730130	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
64	NC_014297	ACCCGT	2	12	1764279	1764290	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014297	AATATC	2	12	1797837	1797848	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014297	GAAACG	2	12	1844712	1844723	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014297	TCGGTT	2	12	1848208	1848219	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014297	TGTCCG	2	12	1868092	1868103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014297	GGAGAA	2	12	1901665	1901676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014297	TATGCT	2	12	1921203	1921214	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014297	CGGCGA	2	12	1923192	1923203	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014297	CCCGCA	2	12	1941561	1941572	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_014297	CCCTCG	2	12	1946713	1946724	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_014297	GGTATA	2	12	1955348	1955359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014297	GTTGAT	2	12	1994228	1994239	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014297	CGAGTC	2	12	2062971	2062982	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014297	CCCGAA	2	12	2136854	2136865	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014297	ACCGCA	2	12	2196504	2196515	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014297	GATCCG	2	12	2281300	2281311	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014297	CCGACG	2	12	2288208	2288219	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014297	TCGGAT	2	12	2301521	2301532	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014297	GACGAG	2	12	2318736	2318747	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014297	TACCGG	2	12	2447281	2447292	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014297	TATTAC	2	12	2530749	2530760	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014297	CGCGGC	2	12	2675312	2675323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014297	ACCCCG	2	12	2688450	2688461	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_014297	CCTACC	2	12	2689220	2689231	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_014297	ACTACA	2	12	2694367	2694378	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014297	ACCCCG	2	12	2700931	2700942	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_014297	CCGGTT	2	12	2711934	2711945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014297	TCTTGT	2	12	2712031	2712042	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014297	GACGGC	2	12	2787662	2787673	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014297	CACCGA	2	12	2790515	2790526	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.