MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori B8 chromosome

Total Repeats: 222

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014256	TA	3	6	16390	16395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014256	AG	3	6	33531	33536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014256	TA	3	6	45606	45611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014256	GC	3	6	66590	66595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014256	GA	4	8	72079	72086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014256	AT	3	6	72087	72092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014256	TG	3	6	82664	82669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014256	CT	3	6	85286	85291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014256	TG	3	6	85518	85523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014256	AT	3	6	88304	88309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014256	AC	3	6	97794	97799	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014256	TC	3	6	98305	98310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014256	GA	3	6	98459	98464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014256	AC	3	6	98690	98695	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014256	CA	4	8	98931	98938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014256	AC	3	6	121183	121188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014256	CT	3	6	167448	167453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014256	AC	3	6	167846	167851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014256	AT	3	6	168084	168089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014256	GA	3	6	201047	201052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014256	GA	3	6	213522	213527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014256	GA	3	6	218790	218795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014256	TG	3	6	236666	236671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014256	AT	3	6	244675	244680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014256	AG	3	6	245287	245292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014256	TA	3	6	250080	250085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014256	AG	3	6	255231	255236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014256	GA	3	6	255355	255360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014256	TC	4	8	255377	255384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014256	CG	3	6	257045	257050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014256	AG	3	6	257647	257652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014256	CG	3	6	257952	257957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014256	CT	3	6	258277	258282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014256	GC	3	6	258609	258614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014256	AG	3	6	259093	259098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014256	AG	4	8	260421	260428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014256	GT	3	6	260620	260625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014256	CT	3	6	266852	266857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014256	AC	3	6	267323	267328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014256	TC	3	6	268568	268573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014256	TA	4	8	268845	268852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014256	TC	3	6	272438	272443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014256	GA	3	6	272514	272519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014256	AG	3	6	272570	272575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014256	TA	4	8	272743	272750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014256	TC	4	8	274020	274027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014256	AG	4	8	274036	274043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014256	AT	3	6	284734	284739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014256	TA	4	8	298574	298581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014256	CT	3	6	300253	300258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014256	AT	3	6	300276	300281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014256	AC	3	6	307641	307646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014256	AC	3	6	323878	323883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014256	TC	3	6	324389	324394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014256	GA	3	6	324543	324548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014256	AC	3	6	324774	324779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014256	CA	4	8	325015	325022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014256	AG	3	6	330449	330454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014256	CT	3	6	344943	344948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014256	AT	3	6	388463	388468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014256	AG	3	6	444328	444333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014256	AG	3	6	448747	448752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014256	AG	3	6	448867	448872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014256	AT	3	6	449551	449556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014256	TG	3	6	449763	449768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014256	AT	3	6	450003	450008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014256	TG	3	6	451112	451117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014256	AC	3	6	451433	451438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014256	TG	3	6	451536	451541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014256	AG	3	6	451657	451662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014256	TG	3	6	455391	455396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014256	CA	3	6	469078	469083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014256	TA	3	6	471528	471533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014256	TC	3	6	487923	487928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014256	CA	3	6	488066	488071	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014256	TA	4	8	490573	490580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014256	AC	3	6	492534	492539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014256	AT	3	6	494622	494627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014256	TA	3	6	496639	496644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014256	GT	3	6	505096	505101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014256	GT	3	6	505150	505155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014256	CA	3	6	505159	505164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014256	TA	3	6	505548	505553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014256	TA	3	6	505597	505602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014256	GT	3	6	530706	530711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014256	CT	3	6	531856	531861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014256	AG	3	6	537907	537912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014256	TC	6	12	550545	550556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014256	GA	3	6	570376	570381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014256	GA	3	6	580578	580583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014256	CT	3	6	580596	580601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014256	GT	3	6	582889	582894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014256	AT	3	6	607600	607605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014256	TA	3	6	613545	613550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014256	TA	3	6	633284	633289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014256	AT	3	6	640065	640070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014256	GC	3	6	645716	645721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014256	GA	3	6	645796	645801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014256	GA	3	6	649852	649857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014256	GA	3	6	663266	663271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014256	TG	3	6	670584	670589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014256	AG	3	6	671985	671990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014256	TA	3	6	681549	681554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014256	TC	3	6	682031	682036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014256	TA	3	6	683136	683141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014256	CA	3	6	683292	683297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014256	CT	3	6	684158	684163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014256	TC	4	8	685736	685743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014256	TC	3	6	686020	686025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014256	AT	3	6	695553	695558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014256	GT	3	6	716738	716743	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014256	TG	3	6	720558	720563	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014256	AG	3	6	720796	720801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014256	TC	3	6	721282	721287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014256	GA	3	6	721328	721333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014256	GA	4	8	727978	727985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014256	TA	3	6	732163	732168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014256	AC	3	6	733593	733598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014256	AT	3	6	736658	736663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014256	TA	3	6	744826	744831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014256	TC	3	6	761605	761610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014256	AT	3	6	763362	763367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014256	AT	3	6	769681	769686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014256	TA	3	6	780798	780803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014256	TA	3	6	818860	818865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014256	TA	3	6	835457	835462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014256	AT	3	6	835463	835468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014256	CT	3	6	836719	836724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014256	TA	3	6	850994	850999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014256	CT	3	6	865236	865241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014256	CT	3	6	869356	869361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014256	TA	3	6	876676	876681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014256	TG	3	6	895067	895072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014256	CT	3	6	895478	895483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014256	GA	3	6	937828	937833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014256	AG	3	6	946624	946629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014256	TC	3	6	978034	978039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014256	CT	3	6	983764	983769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014256	TC	3	6	987388	987393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014256	AT	3	6	1015163	1015168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014256	CT	3	6	1027585	1027590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014256	AC	3	6	1063229	1063234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014256	CT	3	6	1069131	1069136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014256	AG	3	6	1069535	1069540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014256	CT	3	6	1075880	1075885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014256	CA	4	8	1075895	1075902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014256	TA	3	6	1075990	1075995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014256	TA	4	8	1089733	1089740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014256	GC	3	6	1104342	1104347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_014256	AC	3	6	1132972	1132977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_014256	TC	3	6	1144697	1144702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_014256	CA	4	8	1144801	1144808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_014256	CT	4	8	1157267	1157274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_014256	AG	3	6	1165114	1165119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014256	CT	3	6	1165411	1165416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_014256	TC	3	6	1166868	1166873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_014256	AT	3	6	1168556	1168561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014256	AC	3	6	1203063	1203068	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_014256	TC	3	6	1203124	1203129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_014256	CT	3	6	1211185	1211190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
161	NC_014256	CA	3	6	1217452	1217457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_014256	AT	3	6	1277016	1277021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014256	CT	4	8	1311167	1311174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
164	NC_014256	TC	3	6	1311176	1311181	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
165	NC_014256	AG	3	6	1353707	1353712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014256	CT	3	6	1353741	1353746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
167	NC_014256	TC	3	6	1358959	1358964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
168	NC_014256	AT	3	6	1358965	1358970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_014256	CA	3	6	1362554	1362559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
170	NC_014256	TG	3	6	1365076	1365081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014256	AG	3	6	1374515	1374520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014256	CA	3	6	1377696	1377701	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
173	NC_014256	TC	3	6	1386023	1386028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
174	NC_014256	CT	3	6	1399767	1399772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
175	NC_014256	AT	3	6	1406021	1406026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_014256	CT	3	6	1406063	1406068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
177	NC_014256	GA	3	6	1426983	1426988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
178	NC_014256	CT	3	6	1441644	1441649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
179	NC_014256	TA	3	6	1442638	1442643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_014256	TC	3	6	1446178	1446183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
181	NC_014256	TC	3	6	1454568	1454573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
182	NC_014256	CT	3	6	1454594	1454599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
183	NC_014256	AG	3	6	1458964	1458969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
184	NC_014256	CT	3	6	1458974	1458979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
185	NC_014256	TA	5	10	1460014	1460023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_014256	CT	3	6	1479296	1479301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
187	NC_014256	GA	3	6	1479370	1479375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
188	NC_014256	CT	4	8	1479648	1479655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
189	NC_014256	TC	3	6	1487799	1487804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
190	NC_014256	AG	3	6	1517569	1517574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
191	NC_014256	CG	3	6	1522069	1522074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
192	NC_014256	TA	3	6	1526443	1526448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_014256	CT	3	6	1529385	1529390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
194	NC_014256	CA	3	6	1529506	1529511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
195	NC_014256	GT	3	6	1529609	1529614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
196	NC_014256	CA	3	6	1529930	1529935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
197	NC_014256	AT	3	6	1531039	1531044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_014256	CA	3	6	1531279	1531284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
199	NC_014256	AT	3	6	1531491	1531496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_014256	CT	3	6	1532175	1532180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
201	NC_014256	CT	3	6	1532295	1532300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
202	NC_014256	CT	3	6	1539274	1539279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
203	NC_014256	TC	4	8	1539321	1539328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
204	NC_014256	CT	3	6	1547736	1547741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
205	NC_014256	CT	3	6	1551553	1551558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
206	NC_014256	TA	3	6	1564613	1564618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
207	NC_014256	CT	3	6	1566229	1566234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
208	NC_014256	TG	3	6	1575339	1575344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
209	NC_014256	GT	3	6	1578413	1578418	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
210	NC_014256	AC	3	6	1596303	1596308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
211	NC_014256	AT	3	6	1600748	1600753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
212	NC_014256	AG	3	6	1619198	1619203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
213	NC_014256	CT	3	6	1625912	1625917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
214	NC_014256	CA	3	6	1642932	1642937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
215	NC_014256	AG	3	6	1647874	1647879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
216	NC_014256	CA	3	6	1657295	1657300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
217	NC_014256	TG	3	6	1659747	1659752	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
218	NC_014256	TG	3	6	1659777	1659782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
219	NC_014256	TC	3	6	1659980	1659985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
220	NC_014256	AT	3	6	1668962	1668967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
221	NC_014256	TG	3	6	1669114	1669119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
222	NC_014256	CT	3	6	1673787	1673792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.