MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV1

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013968	ATAA	2	8	1547	1554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013968	AGCA	2	8	4556	4563	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013968	GATG	2	8	6127	6134	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013968	TCTT	2	8	6988	6995	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013968	TGGC	2	8	7694	7701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013968	CAAG	2	8	9727	9734	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013968	GTCC	2	8	11229	11236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013968	CGAA	2	8	11296	11303	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013968	ATTC	2	8	11637	11644	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013968	GTGG	2	8	14717	14724	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013968	AATT	2	8	14980	14987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013968	TGCT	2	8	15177	15184	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013968	CGTG	2	8	17580	17587	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013968	AACT	2	8	20668	20675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013968	ACAA	2	8	20753	20760	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013968	AGAC	2	8	21474	21481	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013968	TGCT	2	8	30747	30754	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013968	TTAG	2	8	32918	32925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013968	TGCT	2	8	32932	32939	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013968	TTTA	2	8	45522	45529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013968	AATC	2	8	46851	46858	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013968	AAAT	2	8	47142	47149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013968	GAGC	2	8	48834	48841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013968	AGCG	2	8	48852	48859	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013968	TGCG	2	8	49052	49059	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013968	AATA	2	8	50203	50210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013968	CCCT	2	8	50751	50758	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_013968	AGTC	2	8	50787	50794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013968	GACC	2	8	50796	50803	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013968	GTTC	2	8	50833	50840	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013968	TGAG	2	8	51547	51554	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013968	GCGA	2	8	53168	53175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013968	ATAC	2	8	54352	54359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013968	ATTC	2	8	55112	55119	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013968	CGTT	2	8	55721	55728	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013968	AGTC	2	8	56257	56264	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013968	CCAC	2	8	57621	57628	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_013968	TTCC	2	8	57664	57671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013968	TGGG	2	8	57817	57824	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013968	GTCC	2	8	58109	58116	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013968	CCAC	2	8	58896	58903	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_013968	GCTG	2	8	60176	60183	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013968	GACC	2	8	60713	60720	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013968	CGAC	2	8	61011	61018	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013968	GTGG	2	8	63356	63363	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013968	ACTA	2	8	63468	63475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013968	GTCG	2	8	63736	63743	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013968	AGCA	2	8	70182	70189	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013968	CGCA	2	8	74662	74669	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013968	GACT	2	8	77774	77781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013968	CCAG	2	8	78973	78980	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013968	GTCA	2	8	78995	79002	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013968	TCAC	2	8	79142	79149	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013968	TCCA	2	8	79361	79368	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013968	GATC	2	8	79697	79704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013968	GCAA	2	8	81175	81182	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013968	AGTG	2	8	81255	81262	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.