MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 9379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013967	AGT	2	6	1347070	1347075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_013967	GGGT	2	8	1347085	1347092	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_013967	ATG	2	6	1347142	1347147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_013967	CCG	2	6	1347160	1347165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_013967	G	6	6	1347168	1347173	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_013967	CGC	2	6	1347201	1347206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_013967	GCGG	2	8	1347207	1347214	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_013967	TC	3	6	1347216	1347221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_013967	TCG	2	6	1348312	1348317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_013967	CCA	2	6	1348374	1348379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_013967	CCG	2	6	1349353	1349358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_013967	ACCCG	2	10	1349359	1349368	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4013	NC_013967	CCGC	2	8	1349397	1349404	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4014	NC_013967	GC	3	6	1351065	1351070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_013967	GGC	2	6	1351073	1351078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_013967	GCC	2	6	1351100	1351105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_013967	GCCC	2	8	1351107	1351114	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4018	NC_013967	CCG	2	6	1351132	1351137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_013967	CGGC	2	8	1352001	1352008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_013967	CGGT	2	8	1352010	1352017	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4021	NC_013967	CGC	2	6	1352026	1352031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_013967	CGC	2	6	1352067	1352072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_013967	GGC	2	6	1352421	1352426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_013967	GCC	2	6	1352433	1352438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4025	NC_013967	CG	3	6	1353320	1353325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_013967	AG	3	6	1353354	1353359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_013967	CT	3	6	1355140	1355145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4028	NC_013967	TCTCGT	2	12	1355224	1355235	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_013967	CGC	2	6	1355921	1355926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4030	NC_013967	GCCCG	2	10	1355930	1355939	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4031	NC_013967	CCG	2	6	1355972	1355977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_013967	CG	3	6	1357832	1357837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_013967	TCG	2	6	1357903	1357908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_013967	CGA	2	6	1357937	1357942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_013967	CTC	2	6	1357952	1357957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_013967	CGA	2	6	1359771	1359776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_013967	GA	3	6	1359830	1359835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_013967	GCG	2	6	1359937	1359942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_013967	CG	3	6	1360033	1360038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_013967	CGG	2	6	1360057	1360062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_013967	AAC	2	6	1360102	1360107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_013967	GTC	2	6	1362014	1362019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_013967	CGG	2	6	1362061	1362066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_013967	TCG	2	6	1362068	1362073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_013967	GTC	2	6	1362081	1362086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_013967	GGTC	2	8	1362087	1362094	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4047	NC_013967	GTC	2	6	1362098	1362103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_013967	ACCG	2	8	1362132	1362139	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4049	NC_013967	CGA	2	6	1362142	1362147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_013967	CGG	2	6	1362614	1362619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_013967	CTC	2	6	1362627	1362632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_013967	CG	3	6	1362644	1362649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4053	NC_013967	CGAGT	2	10	1362710	1362719	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4054	NC_013967	CGC	2	6	1362881	1362886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4056	NC_013967	C	7	7	1362923	1362929	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4057	NC_013967	CGC	2	6	1362944	1362949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_013967	ACGAA	2	10	1362962	1362971	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4059	NC_013967	CGG	2	6	1362976	1362981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_013967	GAC	2	6	1362995	1363000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_013967	CGA	2	6	1363028	1363033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_013967	CG	3	6	1363061	1363066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4063	NC_013967	TAA	2	6	1364100	1364105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_013967	GCC	2	6	1364182	1364187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4065	NC_013967	AGCG	2	8	1364194	1364201	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4066	NC_013967	A	6	6	1364202	1364207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_013967	TTCG	2	8	1367146	1367153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4068	NC_013967	AGGT	2	8	1370120	1370127	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_013967	AGT	2	6	1370133	1370138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4076	NC_013967	GTCG	2	8	1377040	1377047	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4077	NC_013967	GTG	2	6	1377075	1377080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_013967	GA	3	6	1377140	1377145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_013967	TAA	2	6	1377289	1377294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4082	NC_013967	CGC	2	6	1378962	1378967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4085	NC_013967	GAAC	2	8	1379314	1379321	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4086	NC_013967	CG	3	6	1379367	1379372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4087	NC_013967	CG	4	8	1380645	1380652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_013967	TCC	2	6	1381367	1381372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4091	NC_013967	CTA	2	6	1382526	1382531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_013967	TC	3	6	1382536	1382541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4093	NC_013967	CGTA	2	8	1382568	1382575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4094	NC_013967	ACA	2	6	1382585	1382590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_013967	GC	3	6	1382612	1382617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4096	NC_013967	CAT	2	6	1382628	1382633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4098	NC_013967	CTGT	2	8	1382663	1382670	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4099	NC_013967	TCG	2	6	1382681	1382686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4101	NC_013967	GC	3	6	1382793	1382798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_013967	AC	3	6	1382855	1382860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_013967	GCT	2	6	1382875	1382880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_013967	CT	3	6	1382892	1382897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_013967	TGCT	2	8	1383017	1383024	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_013967	CGG	2	6	1384247	1384252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4109	NC_013967	TC	3	6	1384298	1384303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4110	NC_013967	CTC	2	6	1384398	1384403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_013967	GA	3	6	1384405	1384410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_013967	CGC	2	6	1384526	1384531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4113	NC_013967	GCA	2	6	1384542	1384547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_013967	CTGAA	2	10	1384564	1384573	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4115	NC_013967	AAC	2	6	1384634	1384639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4117	NC_013967	GTT	2	6	1384721	1384726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_013967	ACCGA	2	10	1384729	1384738	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4119	NC_013967	CGG	2	6	1384745	1384750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_013967	TCG	2	6	1384792	1384797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4123	NC_013967	GA	3	6	1385015	1385020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_013967	GC	3	6	1385029	1385034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_013967	GC	3	6	1385058	1385063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4126	NC_013967	CTG	2	6	1385076	1385081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_013967	GAC	2	6	1385123	1385128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_013967	CAT	2	6	1385138	1385143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_013967	ATC	2	6	1385154	1385159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_013967	TGA	3	9	1385176	1385184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4132	NC_013967	GCC	2	6	1385239	1385244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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