MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 9379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013967	GC	4	8	1028647	1028654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_013967	A	6	6	1028655	1028660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_013967	TCG	2	6	1028668	1028673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_013967	CGC	2	6	1028722	1028727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_013967	AGT	2	6	1028735	1028740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_013967	GCCGC	2	10	1030870	1030879	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3007	NC_013967	CGTTT	2	10	1030890	1030899	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3008	NC_013967	CGAGA	2	10	1031520	1031529	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3009	NC_013967	CGC	2	6	1031791	1031796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_013967	CGC	2	6	1031800	1031805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_013967	GGT	2	6	1031806	1031811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_013967	CGG	2	6	1031819	1031824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_013967	TCGG	2	8	1031835	1031842	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3014	NC_013967	GCG	2	6	1031851	1031856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_013967	CGA	2	6	1033236	1033241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_013967	TGGCG	2	10	1033303	1033312	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3017	NC_013967	T	6	6	1033364	1033369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_013967	AAG	2	6	1033403	1033408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_013967	CGA	2	6	1033770	1033775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_013967	TC	3	6	1033777	1033782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_013967	GACC	2	8	1033797	1033804	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_013967	CCGAC	2	10	1033844	1033853	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3023	NC_013967	CGC	2	6	1033866	1033871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_013967	CCG	2	6	1033915	1033920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_013967	ACAGCG	2	12	1033953	1033964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_013967	CGA	2	6	1033969	1033974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_013967	CTG	2	6	1036351	1036356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_013967	TCGC	2	8	1036365	1036372	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_013967	CCG	2	6	1036411	1036416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_013967	CCG	2	6	1038161	1038166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_013967	GTC	2	6	1038180	1038185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_013967	CGC	2	6	1038194	1038199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_013967	GCC	2	6	1038222	1038227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_013967	CGG	2	6	1038239	1038244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_013967	GGC	2	6	1038282	1038287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_013967	CG	3	6	1038320	1038325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3037	NC_013967	ATC	2	6	1038330	1038335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_013967	GGC	2	6	1038336	1038341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_013967	GAG	2	6	1038342	1038347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_013967	C	6	6	1038350	1038355	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3041	NC_013967	CGG	2	6	1038374	1038379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_013967	CGG	2	6	1038419	1038424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_013967	CCGGC	2	10	1040122	1040131	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3044	NC_013967	GTCG	2	8	1040133	1040140	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3045	NC_013967	CGTC	2	8	1040168	1040175	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_013967	GA	3	6	1040183	1040188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_013967	GCC	2	6	1040205	1040210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_013967	TCC	2	6	1041125	1041130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_013967	CCG	2	6	1041175	1041180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3050	NC_013967	CGG	2	6	1041187	1041192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_013967	CCG	2	6	1041227	1041232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_013967	CGG	2	6	1041237	1041242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_013967	ACGG	2	8	1041255	1041262	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3054	NC_013967	AGA	2	6	1041263	1041268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_013967	CGAC	2	8	1041292	1041299	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3056	NC_013967	GCG	2	6	1041303	1041308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_013967	G	6	6	1042416	1042421	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_013967	G	6	6	1042436	1042441	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_013967	GA	3	6	1043994	1043999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_013967	CCG	2	6	1044017	1044022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_013967	CCG	2	6	1044025	1044030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_013967	CCG	2	6	1044071	1044076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_013967	TTCCG	2	10	1044403	1044412	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3064	NC_013967	TCCG	2	8	1045132	1045139	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_013967	CGT	2	6	1045156	1045161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_013967	CCGC	2	8	1045164	1045171	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3067	NC_013967	CGG	2	6	1045203	1045208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_013967	GC	3	6	1045712	1045717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3069	NC_013967	GCG	2	6	1045753	1045758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_013967	CGA	2	6	1045814	1045819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_013967	CG	3	6	1048456	1048461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3072	NC_013967	CGGTC	2	10	1048505	1048514	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3073	NC_013967	GGA	2	6	1048550	1048555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3075	NC_013967	CGAGC	2	10	1048656	1048665	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3076	NC_013967	CGAA	2	8	1048715	1048722	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3077	NC_013967	GAGC	2	8	1048725	1048732	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3078	NC_013967	CACT	2	8	1048766	1048773	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_013967	TCGT	2	8	1048801	1048808	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3080	NC_013967	TCGCT	2	10	1048828	1048837	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3081	NC_013967	TC	4	8	1048864	1048871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_013967	AGCGA	2	10	1048885	1048894	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3083	NC_013967	AGC	2	6	1048940	1048945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_013967	GAGT	2	8	1048965	1048972	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_013967	T	7	7	1049048	1049054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3088	NC_013967	TTA	2	6	1049153	1049158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_013967	GT	3	6	1049166	1049171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3092	NC_013967	CTG	2	6	1049662	1049667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_013967	CGG	2	6	1049723	1049728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3095	NC_013967	CCG	2	6	1049882	1049887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3096	NC_013967	GTG	2	6	1049907	1049912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_013967	GAAC	2	8	1049933	1049940	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3098	NC_013967	GGA	2	6	1050000	1050005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_013967	GAA	2	6	1050042	1050047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_013967	GAA	2	6	1050082	1050087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_013967	TCA	2	6	1050141	1050146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_013967	GT	3	6	1050188	1050193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_013967	GGA	2	6	1050388	1050393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_013967	TCGG	2	8	1050567	1050574	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3106	NC_013967	ACG	2	6	1050664	1050669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_013967	GA	3	6	1050684	1050689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_013967	ACT	2	6	1050831	1050836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_013967	GAG	2	6	1050879	1050884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_013967	AGGT	2	8	1050955	1050962	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_013967	CGT	2	6	1050999	1051004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_013967	CCGC	2	8	1052482	1052489	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3113	NC_013967	CGG	2	6	1053794	1053799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_013967	CAG	2	6	1061408	1061413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_013967	AGCGA	2	10	1061440	1061449	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3116	NC_013967	GAAC	2	8	1061472	1061479	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3117	NC_013967	GA	3	6	1061485	1061490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_013967	TC	3	6	1061576	1061581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_013967	AGA	2	6	1061621	1061626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_013967	GA	3	6	1061625	1061630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_013967	CCG	2	6	1062011	1062016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_013967	GT	3	6	1062063	1062068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_013967	GTCG	2	8	1062077	1062084	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3124	NC_013967	GGC	2	6	1062096	1062101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_013967	CGG	2	6	1062117	1062122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_013967	CCG	2	6	1062136	1062141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_013967	AAT	2	6	1062149	1062154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_013967	TC	3	6	1062734	1062739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_013967	CGGG	2	8	1063621	1063628	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3130	NC_013967	CGGT	2	8	1063640	1063647	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3131	NC_013967	GGC	2	6	1064855	1064860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_013967	AC	3	6	1064875	1064880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3133	NC_013967	CCGG	2	8	1065285	1065292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3162	NC_013967	TCGG	2	8	1076632	1076639	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3261	NC_013967	G	6	6	1117307	1117312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_013967	GAC	2	6	1118910	1118915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3264	NC_013967	CTA	2	6	1118954	1118959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3268	NC_013967	CGC	2	6	1122575	1122580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3390	NC_013967	GTC	2	6	1157853	1157858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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