MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 9379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013967	CGGTCG	2	12	476363	476374	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_013967	TCG	2	6	476956	476961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_013967	TCGG	2	8	477015	477022	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_013967	GCC	2	6	477042	477047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_013967	CGG	2	6	477237	477242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_013967	CGC	2	6	477251	477256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_013967	GCG	2	6	477267	477272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_013967	G	6	6	477971	477976	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_013967	TCG	3	9	477977	477985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_013967	CGC	2	6	477992	477997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_013967	CGC	2	6	478005	478010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_013967	CGG	2	6	478011	478016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_013967	GTC	2	6	478017	478022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_013967	TCG	2	6	479542	479547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_013967	TCG	2	6	479593	479598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_013967	GTC	2	6	479603	479608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_013967	CGA	2	6	480667	480672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_013967	CCGG	2	8	480705	480712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_013967	CCGAC	2	10	481111	481120	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1520	NC_013967	GGGC	2	8	486139	486146	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_013967	CGG	2	6	486147	486152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_013967	CGC	3	9	486185	486193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_013967	CGG	2	6	486203	486208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_013967	TTC	2	6	486277	486282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_013967	CGG	2	6	486305	486310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_013967	TA	3	6	486319	486324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_013967	CGC	2	6	490084	490089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_013967	CGC	2	6	490094	490099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_013967	CG	3	6	490152	490157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_013967	ACC	2	6	490158	490163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_013967	ACC	2	6	490220	490225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_013967	AGCGT	2	10	490250	490259	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1533	NC_013967	G	6	6	490278	490283	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_013967	TTG	2	6	492013	492018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_013967	GTG	2	6	492116	492121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_013967	AAG	2	6	492141	492146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_013967	GCC	2	6	492174	492179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_013967	CCG	2	6	492229	492234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_013967	GGA	2	6	492244	492249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_013967	CGA	2	6	492358	492363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_013967	ACGCT	2	10	492373	492382	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1542	NC_013967	TAC	2	6	492416	492421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_013967	ACCG	2	8	492509	492516	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_013967	CG	3	6	492535	492540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_013967	CGA	2	6	492583	492588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_013967	GACA	2	8	492621	492628	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_013967	CAA	2	6	492655	492660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_013967	TCC	2	6	492732	492737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_013967	GTT	2	6	492769	492774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_013967	GAG	2	6	492839	492844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_013967	GCT	2	6	492871	492876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_013967	TAC	2	6	492899	492904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_013967	AGG	2	6	492960	492965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_013967	CGA	2	6	492990	492995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_013967	GGT	2	6	493025	493030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_013967	CAG	2	6	493086	493091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_013967	TTC	2	6	493124	493129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_013967	A	6	6	493157	493162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_013967	TAC	2	6	493202	493207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_013967	GGA	2	6	493219	493224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_013967	ACCG	2	8	493340	493347	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_013967	CAC	2	6	493372	493377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_013967	GAA	2	6	493402	493407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_013967	GA	3	6	493409	493414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_013967	AAC	2	6	493429	493434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_013967	GGT	2	6	493447	493452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_013967	CAG	2	6	493462	493467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_013967	GC	3	6	494394	494399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_013967	CCCT	2	8	494400	494407	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1570	NC_013967	ACC	2	6	494419	494424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_013967	CGA	2	6	494433	494438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_013967	CCG	2	6	494919	494924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_013967	TCGAT	2	10	495123	495132	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1574	NC_013967	CGG	2	6	495184	495189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_013967	AG	3	6	495197	495202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_013967	CGTG	2	8	495883	495890	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1577	NC_013967	GC	3	6	495975	495980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_013967	GTG	2	6	495996	496001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_013967	GGC	2	6	496003	496008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_013967	ATG	2	6	499367	499372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_013967	AT	3	6	499385	499390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_013967	ACG	2	6	499463	499468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1584	NC_013967	CGC	2	6	500772	500777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_013967	ATA	2	6	502813	502818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_013967	C	6	6	502871	502876	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1587	NC_013967	CGT	2	6	506160	506165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1589	NC_013967	GA	3	6	506336	506341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_013967	CGTC	3	12	507278	507289	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1593	NC_013967	CGC	2	6	507414	507419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_013967	ACCA	2	8	507481	507488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_013967	CAG	2	6	507516	507521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_013967	CCT	2	6	507581	507586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_013967	ACGAG	2	10	508846	508855	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1598	NC_013967	TAA	2	6	508888	508893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_013967	TCGC	2	8	509598	509605	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_013967	CGG	2	6	509626	509631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_013967	CGG	2	6	509637	509642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_013967	CG	3	6	509672	509677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_013967	GCC	2	6	510554	510559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_013967	T	6	6	511532	511537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_013967	CGC	2	6	511542	511547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_013967	GCCG	2	8	512400	512407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_013967	GGTGTG	3	18	513073	513090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_013967	CGT	2	6	513101	513106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_013967	TCG	2	6	513109	513114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_013967	CGC	2	6	513122	513127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_013967	GAGT	2	8	513163	513170	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_013967	GGT	2	6	513878	513883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_013967	GGC	2	6	514154	514159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_013967	GTC	2	6	514182	514187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_013967	CTCGA	2	10	514193	514202	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1616	NC_013967	GCC	2	6	514919	514924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_013967	GC	3	6	514927	514932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_013967	CGC	2	6	514939	514944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1619	NC_013967	CCT	2	6	514971	514976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_013967	ACCG	2	8	514985	514992	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_013967	CAGA	2	8	516010	516017	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_013967	CGG	2	6	516044	516049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_013967	GAA	2	6	516064	516069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_013967	GCG	3	9	516110	516118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_013967	CG	3	6	516121	516126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_013967	GC	3	6	517555	517560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1627	NC_013967	GACG	2	8	517596	517603	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1628	NC_013967	GCC	2	6	517618	517623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_013967	CAC	2	6	517661	517666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_013967	CGG	2	6	517690	517695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_013967	CGG	2	6	518345	518350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_013967	AC	3	6	518375	518380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_013967	AGC	2	6	518464	518469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1635	NC_013967	CGT	2	6	518582	518587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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