MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 9379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013967	GTCA	2	8	342052	342059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_013967	GCGA	2	8	342091	342098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_013967	GAC	2	6	342126	342131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_013967	GTC	2	6	342135	342140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_013967	ACG	2	6	342193	342198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_013967	GAAAC	2	10	342429	342438	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1007	NC_013967	ATT	2	6	342531	342536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_013967	GTG	2	6	342605	342610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_013967	GTC	2	6	342619	342624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_013967	CGAA	2	8	342652	342659	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_013967	CGT	2	6	342671	342676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_013967	TCG	2	6	342727	342732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_013967	GC	3	6	342756	342761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_013967	CCG	2	6	342781	342786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_013967	GAA	2	6	343285	343290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_013967	ACGC	2	8	343295	343302	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_013967	CG	3	6	343303	343308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_013967	TCG	2	6	343656	343661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_013967	CCG	2	6	343691	343696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_013967	TCG	2	6	345090	345095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_013967	GC	3	6	345096	345101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_013967	TG	3	6	345105	345110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_013967	GCC	2	6	345123	345128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_013967	CG	3	6	345494	345499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_013967	GCC	2	6	345530	345535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_013967	CCG	2	6	346088	346093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_013967	CG	3	6	346822	346827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_013967	CGC	2	6	346854	346859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_013967	CG	4	8	346868	346875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_013967	CCG	2	6	346893	346898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_013967	CGG	2	6	346921	346926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_013967	CGT	2	6	346946	346951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_013967	CT	3	6	347013	347018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_013967	GAC	2	6	347391	347396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_013967	GTC	2	6	347493	347498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_013967	CG	3	6	350456	350461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_013967	CGTTT	2	10	350477	350486	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1038	NC_013967	ACT	2	6	350542	350547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_013967	TC	3	6	350578	350583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_013967	CGA	2	6	350631	350636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_013967	TGG	3	9	350640	350648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_013967	GCT	2	6	350665	350670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_013967	CGT	2	6	350688	350693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_013967	TGG	2	6	350697	350702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_013967	T	6	6	351020	351025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_013967	GCC	2	6	351047	351052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_013967	ACC	2	6	351056	351061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_013967	CGCGAG	2	12	351075	351086	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_013967	ACG	2	6	351091	351096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_013967	GTC	3	9	351110	351118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_013967	CGGCG	2	10	352250	352259	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1052	NC_013967	GCC	2	6	353364	353369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_013967	CTC	2	6	354483	354488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_013967	GAC	2	6	354525	354530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_013967	GTCG	2	8	354587	354594	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_013967	CGG	2	6	354600	354605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_013967	CGC	2	6	354638	354643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_013967	CCT	2	6	354963	354968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_013967	CAGG	2	8	355003	355010	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_013967	CA	3	6	356568	356573	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_013967	CGCC	2	8	356576	356583	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1062	NC_013967	AC	3	6	356628	356633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_013967	GCGA	2	8	356639	356646	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_013967	CGG	2	6	357200	357205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_013967	GC	3	6	357251	357256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_013967	CGC	2	6	357968	357973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_013967	GTG	2	6	358006	358011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_013967	CAC	2	6	359075	359080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_013967	C	6	6	359260	359265	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1070	NC_013967	ACC	2	6	359266	359271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_013967	TCG	2	6	359273	359278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_013967	ACCG	2	8	359279	359286	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_013967	CGC	2	6	359288	359293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_013967	ACCC	2	8	359301	359308	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1075	NC_013967	ACCC	5	20	359311	359330	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1076	NC_013967	TCCG	2	8	359409	359416	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_013967	T	6	6	361427	361432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_013967	CGT	2	6	361450	361455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_013967	A	6	6	361472	361477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_013967	A	6	6	361486	361491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_013967	GGC	2	6	361492	361497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_013967	CTCC	2	8	361500	361507	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1083	NC_013967	CGA	2	6	361572	361577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_013967	CCA	2	6	361584	361589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_013967	TCC	2	6	361601	361606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_013967	ACG	2	6	361613	361618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_013967	CCCT	2	8	363425	363432	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1088	NC_013967	CGGAG	2	10	363434	363443	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1089	NC_013967	CGT	2	6	363451	363456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_013967	GCCA	2	8	363470	363477	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_013967	GGC	2	6	364604	364609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_013967	ACGAA	2	10	364626	364635	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1093	NC_013967	GCC	2	6	364643	364648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_013967	TCGG	2	8	365271	365278	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_013967	CGA	2	6	365766	365771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_013967	CCG	2	6	365796	365801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_013967	GCT	2	6	365811	365816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_013967	CAC	2	6	365820	365825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_013967	CGA	2	6	365838	365843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_013967	CGG	3	9	367710	367718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_013967	CG	3	6	367732	367737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_013967	GCC	2	6	367765	367770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_013967	GCGCTC	2	12	367783	367794	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_013967	GTC	2	6	371476	371481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_013967	GCG	2	6	371497	371502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_013967	GGTC	2	8	373036	373043	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_013967	TAA	2	6	373052	373057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_013967	GTT	3	9	373084	373092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_013967	ATAG	2	8	373135	373142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_013967	GTT	2	6	373173	373178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_013967	GCTT	2	8	373181	373188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_013967	CGC	2	6	374786	374791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_013967	CGG	2	6	375929	375934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_013967	CGCA	2	8	375966	375973	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_013967	CCG	2	6	375977	375982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_013967	CGC	2	6	376006	376011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_013967	ACC	2	6	377759	377764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_013967	CGA	2	6	377765	377770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_013967	CGG	2	6	377776	377781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_013967	TCG	2	6	379728	379733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_013967	TCG	2	6	379737	379742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_013967	GGT	2	6	379807	379812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_013967	CGG	2	6	379817	379822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_013967	TTG	2	6	380157	380162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_013967	GCG	2	6	380197	380202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_013967	GGA	2	6	380203	380208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_013967	CGC	2	6	382449	382454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_013967	TAC	2	6	382475	382480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_013967	CGAA	2	8	383471	383478	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_013967	CGAGA	2	10	385543	385552	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1131	NC_013967	CGAGA	2	10	385575	385584	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1132	NC_013967	CGGG	2	8	385585	385592	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_013967	TCG	2	6	386635	386640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_013967	CGC	2	6	387538	387543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_013967	CGC	3	9	387784	387792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_013967	CCGC	3	12	387789	387800	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1252	NC_013967	ACC	2	6	419566	419571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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