MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 9379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013967	CCGG	2	8	1868646	1868653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6002	NC_013967	GC	3	6	1868667	1868672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_013967	GCG	2	6	1868708	1868713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_013967	CGT	2	6	1868778	1868783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_013967	GCG	2	6	1868797	1868802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_013967	TC	3	6	1868803	1868808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6007	NC_013967	CTC	2	6	1868821	1868826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_013967	TG	4	8	1870063	1870070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_013967	GCC	2	6	1870101	1870106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_013967	CAT	2	6	1870109	1870114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_013967	AT	4	8	1870121	1870128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_013967	CGT	2	6	1870181	1870186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_013967	GCC	3	9	1870198	1870206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_013967	CGG	2	6	1871407	1871412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_013967	GTCC	2	8	1871453	1871460	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_013967	CGG	2	6	1871486	1871491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_013967	TCCG	2	8	1872186	1872193	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6018	NC_013967	TCGCG	2	10	1872210	1872219	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6019	NC_013967	GC	3	6	1872230	1872235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_013967	CTG	2	6	1872237	1872242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_013967	CAC	2	6	1872259	1872264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6022	NC_013967	ACC	2	6	1872289	1872294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_013967	GCCC	2	8	1872508	1872515	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6024	NC_013967	CGG	2	6	1872517	1872522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_013967	GTGATT	2	12	1874964	1874975	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_013967	TCG	2	6	1875008	1875013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_013967	GCC	2	6	1875071	1875076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6028	NC_013967	TCG	2	6	1875077	1875082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_013967	AAT	2	6	1875164	1875169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_013967	TGAG	2	8	1875189	1875196	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_013967	CAC	2	6	1876437	1876442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_013967	GGCAC	2	10	1880228	1880237	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6033	NC_013967	CGC	2	6	1880261	1880266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_013967	CGAC	2	8	1880268	1880275	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_013967	CCG	2	6	1881472	1881477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_013967	AAT	2	6	1881741	1881746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_013967	CA	3	6	1881759	1881764	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_013967	AT	3	6	1881811	1881816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_013967	ATAG	2	8	1881821	1881828	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_013967	AACG	2	8	1881837	1881844	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6041	NC_013967	TTA	2	6	1881881	1881886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_013967	TA	3	6	1881920	1881925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_013967	CGC	2	6	1881995	1882000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_013967	CTGT	2	8	1882008	1882015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6045	NC_013967	GTTA	2	8	1882021	1882028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_013967	ACG	2	6	1882360	1882365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_013967	GTA	2	6	1882398	1882403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_013967	TCAC	2	8	1882406	1882413	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_013967	TCGC	2	8	1882441	1882448	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_013967	CGA	2	6	1882538	1882543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_013967	GAC	2	6	1882554	1882559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_013967	GTCC	2	8	1882692	1882699	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6053	NC_013967	GT	3	6	1882740	1882745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_013967	TTCG	2	8	1882793	1882800	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6055	NC_013967	TCG	2	6	1883080	1883085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_013967	CGA	2	6	1883116	1883121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_013967	CCA	2	6	1883128	1883133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_013967	TG	3	6	1884432	1884437	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_013967	GTC	2	6	1884510	1884515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_013967	ACG	2	6	1884563	1884568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_013967	GTC	2	6	1885055	1885060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_013967	CGG	2	6	1885119	1885124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_013967	GTCC	2	8	1885151	1885158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6064	NC_013967	CGAG	2	8	1885169	1885176	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6065	NC_013967	CGT	2	6	1885233	1885238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_013967	CTC	2	6	1885305	1885310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_013967	GTG	2	6	1885333	1885338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_013967	CG	3	6	1885344	1885349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_013967	CAC	2	6	1885402	1885407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6070	NC_013967	GT	3	6	1886387	1886392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_013967	CGT	2	6	1886491	1886496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_013967	CGGT	2	8	1887027	1887034	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6073	NC_013967	ACGA	2	8	1887040	1887047	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6074	NC_013967	CCT	2	6	1887048	1887053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6075	NC_013967	GCC	2	6	1887064	1887069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6078	NC_013967	CGA	2	6	1887151	1887156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_013967	CGA	2	6	1887175	1887180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6081	NC_013967	GTG	2	6	1887333	1887338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_013967	CGG	2	6	1887356	1887361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6084	NC_013967	ACC	2	6	1887442	1887447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6085	NC_013967	AG	3	6	1887468	1887473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_013967	CTCTC	2	10	1887487	1887496	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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6089	NC_013967	AACG	2	8	1887521	1887528	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6090	NC_013967	CT	3	6	1887542	1887547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6091	NC_013967	AG	3	6	1887580	1887585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_013967	GGGT	2	8	1887628	1887635	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_013967	GAC	2	6	1887683	1887688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6095	NC_013967	C	6	6	1887918	1887923	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6096	NC_013967	CAG	2	6	1887960	1887965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6099	NC_013967	CAA	2	6	1888112	1888117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_013967	CCCAC	2	10	1888131	1888140	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6101	NC_013967	TG	3	6	1888174	1888179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_013967	GGT	2	6	1888201	1888206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_013967	CAT	2	6	1888221	1888226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6105	NC_013967	TTC	2	6	1888276	1888281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_013967	TA	3	6	1888285	1888290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_013967	AT	3	6	1888324	1888329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_013967	GTGG	2	8	1889611	1889618	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_013967	TC	3	6	1889635	1889640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_013967	A	7	7	1889642	1889648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_013967	GTG	2	6	1889657	1889662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_013967	GTC	2	6	1889728	1889733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_013967	CGC	2	6	1889742	1889747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_013967	TC	3	6	1889916	1889921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6115	NC_013967	CTG	3	9	1889934	1889942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_013967	TG	3	6	1889958	1889963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_013967	CGA	2	6	1889994	1889999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6119	NC_013967	GGA	2	6	1890047	1890052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_013967	TG	3	6	1890069	1890074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_013967	ACG	2	6	1890103	1890108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_013967	AACT	2	8	1890118	1890125	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6123	NC_013967	C	6	6	1890164	1890169	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6124	NC_013967	AGT	2	6	1890895	1890900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_013967	ACT	2	6	1890914	1890919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_013967	GA	3	6	1892051	1892056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_013967	GGC	2	6	1892067	1892072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_013967	TAT	2	6	1892141	1892146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_013967	TTG	2	6	1892416	1892421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_013967	AGT	2	6	1893698	1893703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6132	NC_013967	TAT	2	6	1893719	1893724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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