MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 9379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013967	GCC	2	6	1654367	1654372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5002	NC_013967	CTAT	2	8	1654376	1654383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5003	NC_013967	ACG	2	6	1654386	1654391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_013967	CCG	2	6	1654697	1654702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_013967	CGA	2	6	1654715	1654720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_013967	GCGAC	2	10	1654738	1654747	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5007	NC_013967	CCG	2	6	1654761	1654766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_013967	ACA	2	6	1654773	1654778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_013967	GAC	2	6	1654913	1654918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_013967	G	6	6	1655002	1655007	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_013967	TGG	2	6	1655008	1655013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_013967	GAA	2	6	1655938	1655943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_013967	GATTT	2	10	1656980	1656989	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_013967	TGC	2	6	1657022	1657027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_013967	GA	3	6	1657065	1657070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_013967	CGG	2	6	1657082	1657087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_013967	ACCG	2	8	1657108	1657115	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_013967	TAC	2	6	1657650	1657655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_013967	ACG	2	6	1657668	1657673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_013967	GAC	2	6	1657706	1657711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_013967	GAACA	2	10	1657712	1657721	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5022	NC_013967	TCA	2	6	1657722	1657727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_013967	ACC	2	6	1657761	1657766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_013967	G	7	7	1659205	1659211	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_013967	TC	3	6	1659217	1659222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_013967	TCG	2	6	1659243	1659248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_013967	GTCG	2	8	1659334	1659341	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5028	NC_013967	CCT	2	6	1659382	1659387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_013967	CGC	2	6	1659392	1659397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_013967	TCCCG	2	10	1659456	1659465	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5031	NC_013967	GCC	2	6	1659506	1659511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_013967	GC	3	6	1660282	1660287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_013967	CGGT	2	8	1660506	1660513	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5034	NC_013967	CGC	2	6	1660530	1660535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_013967	GGC	2	6	1661779	1661784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_013967	ACCG	2	8	1661788	1661795	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_013967	TCG	2	6	1661809	1661814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_013967	CGG	2	6	1661837	1661842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_013967	GCCG	2	8	1661867	1661874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_013967	GA	3	6	1662288	1662293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_013967	GA	3	6	1662302	1662307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_013967	GA	3	6	1662316	1662321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_013967	GA	3	6	1662343	1662348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_013967	CG	3	6	1662349	1662354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_013967	CGG	2	6	1662362	1662367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_013967	CAG	2	6	1663791	1663796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_013967	ACG	2	6	1663802	1663807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_013967	CGAG	2	8	1663826	1663833	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_013967	AAG	2	6	1664180	1664185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_013967	GCG	2	6	1664222	1664227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_013967	GAC	2	6	1664242	1664247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_013967	CGAC	2	8	1665462	1665469	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_013967	CGG	2	6	1665482	1665487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_013967	GAG	2	6	1665503	1665508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_013967	GCGTCC	2	12	1665544	1665555	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5056	NC_013967	CGCGG	2	10	1665617	1665626	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5057	NC_013967	TCCCT	2	10	1665710	1665719	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5058	NC_013967	CGG	2	6	1665762	1665767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_013967	CG	4	8	1665774	1665781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_013967	CAT	2	6	1665782	1665787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_013967	GGTCG	2	10	1665789	1665798	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5062	NC_013967	G	6	6	1665872	1665877	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_013967	CT	4	8	1665914	1665921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_013967	GGTC	2	8	1665940	1665947	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5065	NC_013967	AAC	2	6	1666017	1666022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_013967	CAC	2	6	1666052	1666057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_013967	GTC	2	6	1666678	1666683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_013967	CGA	2	6	1666685	1666690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_013967	CGC	3	9	1666741	1666749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5070	NC_013967	CGGTC	2	10	1668345	1668354	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5071	NC_013967	CGGG	2	8	1669807	1669814	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5072	NC_013967	GCGG	2	8	1670324	1670331	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5073	NC_013967	AACGG	2	10	1670340	1670349	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5074	NC_013967	TCGAA	2	10	1671856	1671865	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5075	NC_013967	GTC	2	6	1671884	1671889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_013967	CGG	2	6	1672483	1672488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_013967	CGAGCG	2	12	1672495	1672506	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_013967	ACCCCG	2	12	1672521	1672532	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5079	NC_013967	ACGA	2	8	1673048	1673055	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5080	NC_013967	GT	3	6	1673056	1673061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_013967	CGGT	2	8	1673080	1673087	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5082	NC_013967	CGG	2	6	1673096	1673101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_013967	AGC	2	6	1673109	1673114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_013967	TCGCC	2	10	1673127	1673136	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5085	NC_013967	ACCG	2	8	1673186	1673193	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5086	NC_013967	GGT	2	6	1673239	1673244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_013967	AT	3	6	1673252	1673257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_013967	CGC	2	6	1675876	1675881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5089	NC_013967	CGG	2	6	1675882	1675887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_013967	GTC	2	6	1675903	1675908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_013967	CA	3	6	1677062	1677067	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_013967	AT	3	6	1677076	1677081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_013967	C	6	6	1677117	1677122	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5094	NC_013967	CCG	2	6	1677134	1677139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_013967	CGG	2	6	1677163	1677168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_013967	CGT	2	6	1677182	1677187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_013967	CAC	2	6	1677215	1677220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_013967	CAT	2	6	1677236	1677241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_013967	T	6	6	1677778	1677783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_013967	A	7	7	1677868	1677874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_013967	GCC	2	6	1677893	1677898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_013967	GTC	2	6	1678813	1678818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_013967	GGGAC	2	10	1678819	1678828	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5104	NC_013967	TC	3	6	1678856	1678861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_013967	GACT	2	8	1679555	1679562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5107	NC_013967	CGG	2	6	1681382	1681387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_013967	CCG	2	6	1681405	1681410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_013967	CCGGA	2	10	1681430	1681439	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5110	NC_013967	CGGCG	2	10	1682032	1682041	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5111	NC_013967	CG	3	6	1682816	1682821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_013967	C	6	6	1682845	1682850	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5113	NC_013967	GCG	3	9	1683818	1683826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_013967	GAC	2	6	1684342	1684347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_013967	A	6	6	1684348	1684353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_013967	GCCG	3	12	1684370	1684381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5117	NC_013967	GCC	2	6	1684399	1684404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5118	NC_013967	TCGGT	2	10	1684900	1684909	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5119	NC_013967	CCG	2	6	1684939	1684944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_013967	GAG	2	6	1684955	1684960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_013967	AAACT	2	10	1686284	1686293	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5122	NC_013967	GCG	2	6	1686782	1686787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_013967	AG	3	6	1687250	1687255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_013967	CACC	2	8	1687727	1687734	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5125	NC_013967	GCG	2	6	1688135	1688140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_013967	GAG	2	6	1688149	1688154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_013967	ACG	2	6	1688163	1688168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_013967	GGT	2	6	1688174	1688179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_013967	CGC	2	6	1688187	1688192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5130	NC_013967	GCG	2	6	1688216	1688221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5132	NC_013967	CGG	2	6	1689350	1689355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5392	NC_013967	CG	3	6	1733461	1733466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5393	NC_013967	ACA	2	6	1733484	1733489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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