MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 9379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013967	CGC	3	9	1504318	1504326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4502	NC_013967	TCG	2	6	1504356	1504361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_013967	CGG	2	6	1504381	1504386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_013967	ACGT	2	8	1504427	1504434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4505	NC_013967	TCG	2	6	1504446	1504451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_013967	CGC	2	6	1504483	1504488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_013967	ACC	2	6	1504494	1504499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_013967	CGT	2	6	1504519	1504524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_013967	GGTCGC	2	12	1504543	1504554	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_013967	CGC	2	6	1504560	1504565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4511	NC_013967	CGC	2	6	1504569	1504574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_013967	TCG	2	6	1504632	1504637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_013967	CG	3	6	1504676	1504681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4514	NC_013967	TCG	2	6	1504731	1504736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_013967	GTC	2	6	1504772	1504777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_013967	GTC	3	9	1504849	1504857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_013967	CCG	2	6	1504865	1504870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_013967	CGA	2	6	1504892	1504897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_013967	CCG	2	6	1504923	1504928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_013967	GCCGAA	2	12	1505014	1505025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_013967	GC	3	6	1505057	1505062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_013967	GTC	2	6	1505098	1505103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_013967	AAG	2	6	1505378	1505383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_013967	GCG	3	9	1505396	1505404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_013967	AG	3	6	1505408	1505413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_013967	GCGA	2	8	1505497	1505504	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4527	NC_013967	GAC	3	9	1505960	1505968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_013967	TCT	2	6	1505977	1505982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_013967	GTC	2	6	1506001	1506006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_013967	CCGG	2	8	1506029	1506036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_013967	TC	3	6	1506041	1506046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4532	NC_013967	AAC	2	6	1506149	1506154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_013967	ACC	2	6	1510020	1510025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_013967	AAT	2	6	1510032	1510037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_013967	GCG	2	6	1510079	1510084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_013967	CGGT	2	8	1510100	1510107	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4537	NC_013967	CGA	3	9	1510148	1510156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_013967	GCG	2	6	1510171	1510176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_013967	GGCG	3	12	1510173	1510184	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4540	NC_013967	GAC	2	6	1510188	1510193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_013967	TAC	2	6	1510749	1510754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_013967	TCAT	2	8	1510759	1510766	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4543	NC_013967	TAA	2	6	1510776	1510781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_013967	CCGC	2	8	1511514	1511521	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4545	NC_013967	CGG	2	6	1512759	1512764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_013967	ACCG	2	8	1512784	1512791	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4547	NC_013967	CGA	2	6	1512810	1512815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_013967	CGG	2	6	1515375	1515380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_013967	GGT	2	6	1515388	1515393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_013967	GTCT	2	8	1515447	1515454	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4551	NC_013967	AT	3	6	1515483	1515488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_013967	AGC	2	6	1515498	1515503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_013967	CGG	2	6	1515563	1515568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_013967	CA	3	6	1516836	1516841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4555	NC_013967	TTC	2	6	1516873	1516878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_013967	TTTA	2	8	1516923	1516930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_013967	TC	3	6	1516947	1516952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4558	NC_013967	TCCC	2	8	1517235	1517242	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4559	NC_013967	GCC	2	6	1517705	1517710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_013967	GGCGGA	2	12	1518678	1518689	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4561	NC_013967	CGA	2	6	1518719	1518724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_013967	GCGG	2	8	1518727	1518734	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4563	NC_013967	CGC	2	6	1518742	1518747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4564	NC_013967	CG	3	6	1518766	1518771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4565	NC_013967	TC	3	6	1519183	1519188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4566	NC_013967	CCG	2	6	1519199	1519204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4567	NC_013967	GCG	2	6	1521346	1521351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_013967	CGT	2	6	1521362	1521367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_013967	TCG	2	6	1521454	1521459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_013967	GTTTCT	2	12	1522818	1522829	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4571	NC_013967	TCG	2	6	1522831	1522836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_013967	CGG	2	6	1522875	1522880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_013967	GTC	2	6	1523429	1523434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_013967	CCG	2	6	1523461	1523466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4575	NC_013967	ACG	2	6	1523499	1523504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_013967	TGG	2	6	1525236	1525241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_013967	AG	3	6	1525242	1525247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_013967	TCG	2	6	1525715	1525720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_013967	TCC	2	6	1525749	1525754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4580	NC_013967	TAC	2	6	1525867	1525872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_013967	CG	3	6	1526139	1526144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4582	NC_013967	CGCGT	2	10	1526171	1526180	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4583	NC_013967	CGCGTC	2	12	1526246	1526257	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4584	NC_013967	CG	3	6	1526346	1526351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4585	NC_013967	CGCC	2	8	1526363	1526370	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4586	NC_013967	AT	3	6	1526396	1526401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_013967	CGC	2	6	1526418	1526423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4588	NC_013967	ACG	2	6	1526448	1526453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_013967	GAG	2	6	1526784	1526789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_013967	CG	3	6	1526790	1526795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4591	NC_013967	CGA	2	6	1526805	1526810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_013967	GGGT	2	8	1527517	1527524	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_013967	CGGGT	2	10	1527540	1527549	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4594	NC_013967	TCG	2	6	1527602	1527607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_013967	CAG	2	6	1527608	1527613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_013967	CGC	2	6	1527620	1527625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_013967	A	6	6	1528125	1528130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_013967	CG	3	6	1528141	1528146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4599	NC_013967	CCG	2	6	1529217	1529222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4600	NC_013967	CCG	3	9	1529298	1529306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4601	NC_013967	CGA	2	6	1529315	1529320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_013967	CGG	2	6	1529359	1529364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_013967	AGCC	2	8	1529384	1529391	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4604	NC_013967	GGC	3	9	1529392	1529400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_013967	GCC	2	6	1530955	1530960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4606	NC_013967	CGT	2	6	1531066	1531071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_013967	GCG	2	6	1531096	1531101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_013967	GC	3	6	1531133	1531138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4609	NC_013967	GACC	2	8	1532027	1532034	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_013967	TCG	2	6	1532768	1532773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_013967	GGT	2	6	1532783	1532788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_013967	CGA	2	6	1533929	1533934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_013967	CG	3	6	1533958	1533963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4614	NC_013967	GAC	2	6	1533989	1533994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_013967	CA	3	6	1534021	1534026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4616	NC_013967	GGC	2	6	1534029	1534034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_013967	ATT	2	6	1534088	1534093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_013967	TCT	2	6	1534100	1534105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_013967	CCACC	2	10	1534139	1534148	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
4620	NC_013967	GC	3	6	1535159	1535164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4621	NC_013967	CAA	2	6	1535207	1535212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_013967	GA	3	6	1535427	1535432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_013967	TC	3	6	1535445	1535450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4624	NC_013967	CGTT	2	8	1535473	1535480	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4625	NC_013967	CG	4	8	1535901	1535908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4626	NC_013967	C	6	6	1535929	1535934	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4627	NC_013967	CG	4	8	1535937	1535944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4628	NC_013967	GC	3	6	1535956	1535961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4629	NC_013967	TA	3	6	1535974	1535979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4631	NC_013967	ACA	2	6	1536025	1536030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4898	NC_013967	CGTGT	2	10	1605139	1605148	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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