MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 1627

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013966	CGT	2	6	27	32	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013966	GGT	2	6	115	120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013966	GTG	2	6	1432	1437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013966	GGC	2	6	1493	1498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013966	ACT	2	6	1624	1629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013966	GTG	2	6	1645	1650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013966	ACG	2	6	1664	1669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013966	ACA	2	6	1787	1792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013966	CGG	2	6	1800	1805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013966	TCG	3	9	1838	1846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013966	CTG	2	6	3461	3466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013966	CTC	2	6	3961	3966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_013966	GCG	2	6	4066	4071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013966	TGG	2	6	4095	4100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013966	GCC	2	6	4110	4115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_013966	CGT	2	6	4199	4204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013966	GAA	2	6	4218	4223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013966	GGC	2	6	5649	5654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013966	GGA	2	6	5655	5660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013966	CGG	2	6	5670	5675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013966	CGC	2	6	5678	5683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_013966	CGA	2	6	5701	5706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013966	GAA	2	6	6490	6495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013966	TCG	2	6	6522	6527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013966	AGG	2	6	8024	8029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013966	GAA	2	6	8052	8057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013966	GAC	2	6	9658	9663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013966	GTC	2	6	9678	9683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013966	GTG	2	6	9699	9704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013966	TTG	2	6	9740	9745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013966	TTC	2	6	9839	9844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013966	TTA	2	6	9907	9912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013966	ATT	2	6	10687	10692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013966	CCG	2	6	12638	12643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_013966	TTG	3	9	12722	12730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013966	GAA	2	6	13336	13341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013966	GCC	2	6	13480	13485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_013966	GAG	2	6	13524	13529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013966	TCA	2	6	13716	13721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013966	AGG	2	6	14700	14705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013966	TCT	2	6	14758	14763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013966	GCT	2	6	14777	14782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013966	CTG	2	6	14852	14857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013966	CGT	2	6	14864	14869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013966	CGC	2	6	14975	14980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_013966	GTG	2	6	15156	15161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013966	AAG	2	6	15181	15186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013966	GGC	2	6	15223	15228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013966	CCG	2	6	15269	15274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_013966	GGA	2	6	15284	15289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013966	CAC	2	6	16412	16417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_013966	TCG	2	6	16434	16439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013966	AAC	2	6	16469	16474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013966	GGT	2	6	16487	16492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013966	CAG	2	6	16502	16507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013966	CTC	2	6	16803	16808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_013966	CTG	2	6	16880	16885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013966	ACC	2	6	16895	16900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_013966	GTT	2	6	16913	16918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013966	TTC	2	6	16940	16945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013966	GTG	2	6	16970	16975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013966	TCC	2	6	18098	18103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_013966	CGG	2	6	18113	18118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013966	GCC	2	6	18159	18164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013966	CTT	2	6	18201	18206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013966	CAC	2	6	18226	18231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_013966	ACG	2	6	18472	18477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013966	GTT	2	6	18694	18699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013966	GGT	2	6	20047	20052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013966	GTC	2	6	20239	20244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013966	TCC	2	6	20264	20269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_013966	GGA	2	6	20273	20278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013966	CGC	2	6	20364	20369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_013966	CAC	2	6	20555	20560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_013966	GTC	2	6	20768	20773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013966	AGC	2	6	20789	20794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013966	CGT	2	6	21739	21744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013966	CTT	2	6	21751	21756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013966	TCC	2	6	22015	22020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_013966	CGC	2	6	22101	22106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_013966	CAA	2	6	22115	22120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013966	CGT	2	6	22163	22168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013966	AGC	2	6	22173	22178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013966	GGT	2	6	22258	22263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013966	TAG	2	6	23024	23029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013966	ACC	2	6	23076	23081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_013966	ACT	2	6	23516	23521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013966	GCC	2	6	23600	23605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_013966	ACC	2	6	23606	23611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_013966	GAC	2	6	24911	24916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013966	GTG	2	6	25004	25009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013966	TCA	2	6	25011	25016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013966	GGA	2	6	27251	27256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013966	CAA	2	6	28851	28856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013966	CCT	2	6	28896	28901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_013966	GTT	2	6	29627	29632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013966	GCT	2	6	30377	30382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013966	CCG	2	6	30411	30416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_013966	ACC	2	6	30855	30860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_013966	GCA	2	6	30898	30903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013966	ACC	2	6	33090	33095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_013966	AGC	2	6	33109	33114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013966	GTT	2	6	33164	33169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013966	GGT	2	6	33235	33240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013966	CCG	2	6	33319	33324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_013966	ACA	2	6	33396	33401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013966	GGC	2	6	33472	33477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013966	CGT	2	6	33480	33485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013966	GAA	2	6	33500	33505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013966	CAA	2	6	33535	33540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013966	TCG	2	6	33851	33856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013966	CAG	2	6	35491	35496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013966	TAG	2	6	35507	35512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013966	GAA	2	6	35751	35756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013966	TCG	2	6	36766	36771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013966	TTC	2	6	37414	37419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013966	ACT	2	6	37474	37479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013966	GTA	2	6	37536	37541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013966	TCA	2	6	38814	38819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013966	ATC	2	6	38822	38827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013966	ACA	2	6	38831	38836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013966	CAT	2	6	39021	39026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013966	ATC	2	6	40025	40030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013966	GAG	2	6	40160	40165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013966	CCG	2	6	40172	40177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_013966	TAC	2	6	41409	41414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013966	GCC	2	6	41450	41455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_013966	TGC	2	6	42189	42194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013966	ATC	2	6	42241	42246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013966	GGA	2	6	42279	42284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013966	CCG	2	6	42317	42322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_013966	CGT	2	6	42372	42377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013966	CAA	3	9	43312	43320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013966	TCC	2	6	43327	43332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_013966	AGT	2	6	43791	43796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013966	GGA	2	6	43955	43960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013966	GTT	2	6	45331	45336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013966	ATC	2	6	46606	46611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013966	CGA	2	6	46920	46925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013966	GGT	2	6	48598	48603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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