MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 210

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013964	AC	3	6	1519	1524	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013964	TC	3	6	3259	3264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013964	TC	3	6	4919	4924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013964	TA	3	6	7360	7365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013964	AC	3	6	9741	9746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013964	TC	3	6	11266	11271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013964	CG	3	6	13368	13373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013964	GA	3	6	13484	13489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013964	CA	3	6	18336	18341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013964	TG	3	6	18448	18453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013964	GC	3	6	18494	18499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013964	CG	3	6	19919	19924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013964	TA	3	6	20748	20753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013964	GT	3	6	27009	27014	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013964	AT	3	6	27027	27032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013964	TA	3	6	27078	27083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013964	AT	3	6	27138	27143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013964	CG	3	6	28314	28319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013964	TC	3	6	29159	29164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013964	GC	4	8	29198	29205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013964	TG	3	6	29404	29409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013964	CT	3	6	29455	29460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013964	TC	4	8	29572	29579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013964	GT	3	6	29705	29710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013964	CT	3	6	29711	29716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013964	GA	3	6	41704	41709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013964	GT	3	6	43079	43084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013964	CG	3	6	43112	43117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013964	TC	3	6	45878	45883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013964	TC	3	6	45928	45933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013964	TC	3	6	46008	46013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013964	AG	3	6	55366	55371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013964	CG	3	6	56664	56669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013964	TA	3	6	76642	76647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013964	AC	3	6	78462	78467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013964	CA	3	6	78491	78496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013964	GT	3	6	80005	80010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013964	TG	3	6	81887	81892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013964	TG	3	6	93348	93353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013964	AT	3	6	93899	93904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013964	CA	3	6	93927	93932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013964	TC	3	6	93951	93956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013964	TC	3	6	98759	98764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013964	GA	4	8	100018	100025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013964	CA	3	6	100365	100370	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013964	GA	3	6	104749	104754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013964	CG	3	6	108628	108633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013964	GC	3	6	109653	109658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013964	AC	3	6	109853	109858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013964	CT	3	6	110025	110030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013964	CG	3	6	110095	110100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013964	AT	3	6	110122	110127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013964	GC	3	6	110204	110209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013964	CG	3	6	110217	110222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013964	GC	3	6	112391	112396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013964	CG	3	6	113923	113928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013964	TA	3	6	114728	114733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013964	CG	3	6	114809	114814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013964	CT	3	6	117296	117301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013964	AT	3	6	117347	117352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013964	TC	3	6	122506	122511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013964	GT	3	6	123884	123889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013964	GC	4	8	130249	130256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013964	GT	3	6	130449	130454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013964	AG	3	6	134594	134599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013964	TC	3	6	135790	135795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013964	TC	3	6	142327	142332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013964	CG	3	6	143309	143314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013964	TC	3	6	143336	143341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013964	TC	3	6	144083	144088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013964	GT	3	6	145173	145178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013964	TC	3	6	145442	145447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013964	AC	3	6	150209	150214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013964	CA	3	6	155602	155607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013964	AC	3	6	169029	169034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013964	GA	3	6	169855	169860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013964	GA	3	6	169981	169986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013964	GT	3	6	171627	171632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013964	TC	3	6	175141	175146	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013964	GA	3	6	179292	179297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013964	GC	3	6	181431	181436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013964	AC	3	6	182177	182182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013964	AG	3	6	182295	182300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013964	AG	3	6	184295	184300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013964	CA	3	6	184330	184335	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013964	AC	3	6	184870	184875	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013964	TC	3	6	184884	184889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013964	AG	3	6	185020	185025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013964	TA	3	6	186245	186250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013964	AC	3	6	197975	197980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013964	GT	3	6	198094	198099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013964	CG	4	8	199245	199252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013964	GA	6	12	199377	199388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013964	AT	3	6	199729	199734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013964	TC	3	6	199823	199828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013964	GC	3	6	199852	199857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013964	TC	3	6	199883	199888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013964	AT	4	8	210440	210447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013964	TC	4	8	210547	210554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013964	GC	3	6	211591	211596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013964	CT	3	6	217365	217370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013964	GC	3	6	221535	221540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013964	GA	3	6	223935	223940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013964	AC	3	6	229096	229101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013964	TC	3	6	230918	230923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013964	AT	3	6	231266	231271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013964	CA	3	6	231284	231289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013964	TC	3	6	233739	233744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013964	CA	3	6	243555	243560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013964	CT	3	6	246338	246343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013964	GC	3	6	254818	254823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013964	CA	5	10	255046	255055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013964	AC	3	6	262050	262055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013964	CG	3	6	264330	264335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_013964	GC	3	6	265247	265252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013964	CA	3	6	265318	265323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013964	AG	3	6	266879	266884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013964	GA	3	6	267432	267437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013964	GT	3	6	267714	267719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013964	GA	3	6	276445	276450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013964	TC	3	6	278205	278210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013964	CA	3	6	278392	278397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013964	GC	3	6	278525	278530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_013964	TG	3	6	279074	279079	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013964	TA	3	6	279758	279763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013964	CG	3	6	285906	285911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013964	GT	3	6	286024	286029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013964	AG	3	6	286035	286040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013964	GA	3	6	286049	286054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013964	CA	3	6	286189	286194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013964	AC	3	6	289358	289363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013964	GT	3	6	289374	289379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013964	TG	3	6	290623	290628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013964	AT	3	6	290724	290729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013964	CG	4	8	292683	292690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013964	CG	3	6	293257	293262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_013964	CG	3	6	294133	294138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013964	CA	3	6	294231	294236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013964	TC	3	6	294639	294644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013964	TG	3	6	296610	296615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013964	AC	3	6	297141	297146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013964	CT	3	6	299929	299934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013964	GA	3	6	300464	300469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013964	GA	3	6	301461	301466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013964	GC	3	6	301579	301584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013964	TA	3	6	301754	301759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013964	CG	3	6	306516	306521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_013964	GC	3	6	307330	307335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013964	CG	4	8	313630	313637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013964	CG	3	6	317771	317776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_013964	CG	3	6	327348	327353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_013964	GC	3	6	329561	329566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_013964	GT	3	6	331539	331544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013964	GA	3	6	334446	334451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_013964	AT	3	6	345870	345875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_013964	AT	3	6	406823	406828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_013964	GA	3	6	414871	414876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.