MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV3

Total Repeats: 956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013964	GTG	2	6	44	49	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013964	TAC	2	6	72	77	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013964	TCG	2	6	85	90	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013964	TTA	2	6	169	174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013964	GAC	2	6	1542	1547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013964	CGC	2	6	2748	2753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_013964	TCG	2	6	3186	3191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013964	CTC	2	6	3255	3260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013964	ACG	2	6	3294	3299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013964	AAC	3	9	3310	3318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013964	CCG	2	6	5005	5010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_013964	GCC	2	6	5017	5022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_013964	ACG	2	6	6327	6332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013964	GCG	2	6	6341	6346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013964	ACG	2	6	6360	6365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013964	CGA	2	6	6406	6411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013964	GCG	2	6	7380	7385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013964	ACT	2	6	7415	7420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013964	GAA	2	6	8205	8210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013964	GAA	2	6	9735	9740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013964	TCG	2	6	9763	9768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013964	TTC	2	6	11129	11134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013964	TAT	2	6	11154	11159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013964	ATG	2	6	11175	11180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013964	GTC	2	6	11262	11267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013964	GTC	2	6	11337	11342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013964	CGG	2	6	13316	13321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013964	CTC	2	6	13340	13345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_013964	TCG	2	6	13361	13366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013964	TCG	2	6	13379	13384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013964	TCG	2	6	13402	13407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013964	GTG	2	6	13425	13430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013964	ACT	2	6	13508	13513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013964	TCG	2	6	16047	16052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013964	CCG	2	6	16144	16149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_013964	TTG	2	6	16173	16178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013964	TCC	2	6	16207	16212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_013964	GAG	2	6	16461	16466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013964	GCG	2	6	16528	16533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013964	TGA	2	6	16556	16561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013964	CTA	2	6	16828	16833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013964	AAT	2	6	18302	18307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013964	AAC	2	6	18329	18334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013964	AAT	2	6	18347	18352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013964	AAT	2	6	18356	18361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013964	GGC	2	6	18407	18412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013964	TCG	2	6	18510	18515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013964	ACC	2	6	19959	19964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_013964	ACG	2	6	20030	20035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013964	TTG	2	6	20713	20718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013964	ACT	2	6	22776	22781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013964	CGC	2	6	26835	26840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_013964	CTC	2	6	26850	26855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_013964	GAA	2	6	26950	26955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013964	AAT	2	6	26962	26967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013964	ATT	2	6	26974	26979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013964	TCT	2	6	27003	27008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013964	TAT	2	6	27185	27190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013964	GCC	2	6	29250	29255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_013964	CTG	2	6	29271	29276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013964	TAA	2	6	29558	29563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013964	GGT	2	6	29580	29585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013964	CGA	2	6	29592	29597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013964	GTC	2	6	29609	29614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013964	TCG	2	6	29647	29652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013964	CCG	2	6	29671	29676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_013964	TCG	2	6	29767	29772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013964	TCG	2	6	29777	29782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013964	CCG	2	6	29829	29834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_013964	CGC	2	6	29863	29868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_013964	TTA	2	6	29887	29892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013964	CGT	2	6	31971	31976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013964	TAT	2	6	31989	31994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013964	GCC	2	6	33964	33969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_013964	TGC	2	6	33971	33976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013964	CGC	2	6	34030	34035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_013964	TTA	2	6	34869	34874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013964	TCG	2	6	35700	35705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013964	TAC	2	6	35912	35917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013964	GCC	2	6	41595	41600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_013964	CGC	2	6	41693	41698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_013964	GGT	2	6	41730	41735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013964	CGT	2	6	43133	43138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013964	CAA	2	6	43146	43151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013964	CTC	2	6	44718	44723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_013964	CCG	2	6	44754	44759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_013964	TGT	2	6	44764	44769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013964	TCG	3	9	44861	44869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013964	GAT	2	6	44904	44909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013964	GCT	2	6	44919	44924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013964	ATT	2	6	45710	45715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013964	GCA	2	6	45806	45811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013964	CAC	2	6	45896	45901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_013964	ACC	2	6	45903	45908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_013964	TCA	2	6	45995	46000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013964	TTC	2	6	46024	46029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013964	ACA	2	6	46045	46050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013964	GTT	2	6	46057	46062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013964	CTG	2	6	46133	46138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013964	TCC	2	6	46183	46188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_013964	TGT	2	6	46192	46197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013964	GGT	2	6	46303	46308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013964	CGG	2	6	46332	46337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013964	TCG	2	6	54961	54966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013964	TCG	2	6	55070	55075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013964	CGA	2	6	55080	55085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013964	GGT	2	6	55144	55149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013964	CGC	2	6	55183	55188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_013964	CGG	2	6	55209	55214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013964	CGA	2	6	55243	55248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013964	CCG	2	6	55264	55269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_013964	CGC	2	6	55345	55350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_013964	AGG	2	6	56680	56685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013964	TTG	2	6	73026	73031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013964	TTA	2	6	73068	73073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013964	TCA	2	6	73136	73141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013964	GAC	2	6	74531	74536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013964	AAT	2	6	74614	74619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013964	CGC	2	6	75169	75174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_013964	CCG	2	6	75187	75192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_013964	CAC	2	6	76620	76625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_013964	GAC	2	6	76711	76716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013964	CGA	2	6	76725	76730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013964	GCG	2	6	78293	78298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013964	TCG	2	6	78304	78309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013964	GTC	2	6	78328	78333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013964	CAG	2	6	78360	78365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013964	AAT	2	6	78498	78503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013964	TTA	2	6	78504	78509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013964	GCC	2	6	79845	79850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_013964	GGT	2	6	79912	79917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013964	GCC	2	6	79960	79965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_013964	CCG	2	6	79967	79972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_013964	GGC	2	6	81133	81138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013964	GCG	2	6	81190	81195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013964	TGG	2	6	82504	82509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013964	TGG	3	9	82598	82606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013964	CGC	2	6	82631	82636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_013964	GCG	2	6	82664	82669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013964	CAC	2	6	82694	82699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_013964	CGA	2	6	93643	93648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013964	ATT	2	6	93691	93696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013964	TTA	2	6	93821	93826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013964	TTA	2	6	93835	93840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013964	GTG	2	6	94042	94047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_013964	GTC	2	6	95002	95007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_013964	CGG	2	6	95476	95481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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150	NC_013964	GTC	3	9	95609	95617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_013964	CGG	2	6	100478	100483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_013964	TGG	2	6	104764	104769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_013964	GGC	2	6	112397	112402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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