MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter mustelae 12198 chromosome

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013949	TGTTTT	2	12	6441	6452	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013949	TATTTT	2	12	13504	13515	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013949	CTTTGA	2	12	22605	22616	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013949	AAGAGA	2	12	72168	72179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013949	ATTAAA	2	12	78007	78018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013949	AAAAGC	2	12	126775	126786	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013949	ACTAGC	2	12	127165	127176	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013949	CATTTT	2	12	163840	163851	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013949	CTTTTT	2	12	256622	256633	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013949	TGCCTT	2	12	266083	266094	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013949	TTTTTG	2	12	278108	278119	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013949	TGAGGA	2	12	278182	278193	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013949	GCATTT	2	12	333086	333097	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013949	AAATTT	2	12	373727	373738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013949	TTGATT	2	12	397068	397079	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013949	GGGATT	2	12	397372	397383	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013949	ATGCCA	2	12	415846	415857	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013949	TTTTGT	2	12	480751	480762	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013949	TTGTTT	2	12	528529	528540	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013949	TTTCAT	2	12	528665	528676	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013949	CCTTTT	2	12	549709	549720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013949	AGATAG	2	12	551529	551540	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013949	AAAAGC	2	12	557089	557100	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013949	ACTAGC	2	12	557479	557490	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013949	CAAATA	2	12	582289	582300	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013949	AACACA	2	12	601689	601700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013949	TGGGTG	2	12	614327	614338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013949	TTTGCT	2	12	614492	614503	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013949	GAAATT	2	12	614755	614766	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013949	GAAATT	2	12	616946	616957	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013949	TTGCTT	2	12	622872	622883	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013949	CAAGGC	2	12	637294	637305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013949	TTTGTT	2	12	751606	751617	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013949	TGCCAA	2	12	824550	824561	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013949	TTTTTC	2	12	837037	837048	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013949	GAAACA	2	12	848475	848486	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013949	AAAAAT	2	12	869711	869722	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013949	ATCAAA	2	12	916758	916769	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013949	CCATTT	2	12	932066	932077	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013949	AAAGAA	2	12	950502	950513	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013949	TTTCTT	2	12	988557	988568	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_013949	TTTGTG	2	12	995728	995739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013949	ATTTTG	2	12	1015216	1015227	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013949	TAATGC	2	12	1015283	1015294	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013949	AGCACA	2	12	1016967	1016978	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013949	CAAGCA	2	12	1017011	1017022	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013949	GGTGCA	2	12	1017076	1017087	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013949	AGCACA	2	12	1017719	1017730	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013949	GGTGCA	3	18	1017828	1017845	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013949	CCTCCC	2	12	1022349	1022360	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
51	NC_013949	CAAAAA	2	12	1029650	1029661	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_013949	CCCCAT	2	12	1049957	1049968	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_013949	AAGCAC	2	12	1102701	1102712	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013949	TAAAAA	2	12	1103120	1103131	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013949	TAAAAA	2	12	1130795	1130806	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013949	AATCTC	2	12	1134122	1134133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013949	TGGTTT	2	12	1201678	1201689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013949	TTTTGT	2	12	1202263	1202274	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013949	ATTTTT	2	12	1202833	1202844	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013949	CAAAAA	2	12	1222627	1222638	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013949	CTTTTT	2	12	1292598	1292609	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013949	TTGTTT	2	12	1338247	1338258	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013949	AATCCA	2	12	1344266	1344277	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013949	AAAAAT	2	12	1344287	1344298	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013949	TCTCCC	2	12	1434343	1434354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_013949	ATCTCA	2	12	1474672	1474683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013949	ACAAAA	2	12	1483218	1483229	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_013949	CCCCCT	2	12	1495993	1496004	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
69	NC_013949	AAAGAA	2	12	1496009	1496020	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013949	TTTTGA	2	12	1565600	1565611	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.