MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter mustelae 12198 chromosome

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013949	CAAAA	2	10	1339	1348	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013949	AAAGG	2	10	5754	5763	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013949	TAGGA	2	10	6379	6388	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013949	ACAAA	2	10	7619	7628	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013949	TTTTA	2	10	7634	7643	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013949	CTTTT	2	10	22535	22544	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013949	TGGAA	2	10	24591	24600	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013949	GCTTG	2	10	24669	24678	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013949	TCCCT	2	10	29892	29901	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_013949	CCCCT	2	10	64638	64647	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
11	NC_013949	GGTGG	2	10	67555	67564	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013949	TTTAA	2	10	77570	77579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013949	AGGGG	2	10	92059	92068	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013949	ATCAA	2	10	96559	96568	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013949	CCAAT	2	10	96624	96633	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_013949	TTATC	2	10	120993	121002	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013949	ATTTA	2	10	121082	121091	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013949	CTTTG	2	10	123046	123055	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013949	CTTTG	2	10	124514	124523	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013949	ATTTT	2	10	124758	124767	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013949	TCGTG	2	10	125946	125955	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013949	TTCTA	2	10	128147	128156	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013949	AGATG	2	10	128760	128769	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013949	TTGAA	2	10	128994	129003	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013949	CTTTT	2	10	132413	132422	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013949	TCTCT	2	10	132433	132442	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_013949	TTATT	2	10	132466	132475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013949	GGATG	2	10	132765	132774	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013949	CATTG	2	10	134147	134156	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013949	TCCGC	2	10	144872	144881	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_013949	ATTTT	2	10	145003	145012	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013949	TTGCT	2	10	154162	154171	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_013949	CTTTT	2	10	162920	162929	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013949	TTGGG	2	10	163033	163042	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013949	CTTTG	2	10	174436	174445	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_013949	TTTTG	2	10	175145	175154	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013949	ATCCT	2	10	195875	195884	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_013949	AAAAT	2	10	233622	233631	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013949	TTTTG	2	10	236334	236343	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013949	AATCA	2	10	249128	249137	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_013949	CCAAA	2	10	249153	249162	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_013949	TAAAA	2	10	255142	255151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013949	GGGTG	2	10	267300	267309	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013949	ATTTG	2	10	271918	271927	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013949	ATTTT	2	10	276409	276418	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013949	CAAAA	2	10	298612	298621	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013949	AGAGG	2	10	321871	321880	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013949	TGGAG	2	10	332580	332589	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013949	ATTTT	2	10	339107	339116	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013949	ATTAT	2	10	350711	350720	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013949	TTTTA	2	10	367232	367241	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013949	TATGT	2	10	370647	370656	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013949	GTTCT	2	10	396980	396989	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013949	ATTCT	2	10	399726	399735	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013949	ATAGA	2	10	405422	405431	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013949	ACTGA	2	10	415782	415791	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013949	TTTGG	2	10	416084	416093	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013949	AGTTT	2	10	458543	458552	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013949	TTTGT	2	10	480814	480823	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013949	CTTTT	2	10	528717	528726	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013949	ATCGT	2	10	546599	546608	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013949	GCAGT	2	10	546750	546759	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013949	AAAAC	2	10	547070	547079	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013949	CATTG	2	10	549796	549805	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013949	TTCAA	2	10	551213	551222	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_013949	CCAAA	2	10	552370	552379	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_013949	CCAGC	2	10	554498	554507	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_013949	CTTTG	2	10	554828	554837	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013949	ATTTT	2	10	555072	555081	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013949	TCGTG	2	10	556260	556269	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_013949	TTCTA	2	10	558461	558470	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013949	AGATG	2	10	559074	559083	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013949	TTGAA	2	10	559308	559317	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013949	GCCAT	2	10	565318	565327	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_013949	TAATT	2	10	577489	577498	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013949	TAAAA	2	10	585598	585607	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013949	TATTG	2	10	586177	586186	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013949	TGCAT	2	10	586218	586227	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_013949	TGCAC	2	10	587218	587227	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_013949	GGAGA	2	10	595479	595488	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013949	TTGGA	2	10	596227	596236	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013949	ATTTT	2	10	596427	596436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013949	CGTTT	2	10	601048	601057	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_013949	TGGGC	2	10	609379	609388	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013949	GATTT	2	10	609524	609533	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013949	AGATT	2	10	613276	613285	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013949	CATAG	2	10	614381	614390	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_013949	TAATA	2	10	622995	623004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013949	TTATT	2	10	626589	626598	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013949	TGCGA	2	10	629040	629049	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_013949	ATTTT	2	10	648304	648313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013949	ACCAA	2	10	701415	701424	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_013949	AAGAA	2	10	705559	705568	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013949	TTATT	2	10	709897	709906	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013949	CACCC	2	10	709975	709984	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
96	NC_013949	GAGAT	2	10	715072	715081	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013949	TCTGA	2	10	727982	727991	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_013949	GTTTT	2	10	738498	738507	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013949	ATGGG	2	10	752141	752150	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013949	CGCGG	2	10	755758	755767	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_013949	GAAAA	2	10	756066	756075	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013949	TCCCT	2	10	769014	769023	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
103	NC_013949	AAAAT	2	10	769732	769741	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013949	GGGGT	2	10	770580	770589	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013949	AAAAG	2	10	771208	771217	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013949	AGGGA	2	10	771688	771697	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013949	TCTCT	2	10	786649	786658	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_013949	GTAGA	2	10	799955	799964	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013949	GGATT	2	10	803563	803572	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013949	TAATA	2	10	810363	810372	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013949	TCTTT	2	10	812675	812684	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_013949	TGTGC	2	10	843171	843180	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_013949	TCACC	2	10	859103	859112	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
114	NC_013949	CATAA	2	10	867471	867480	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_013949	TAAAA	2	10	869285	869294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013949	GTTTT	2	10	877455	877464	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013949	ATTGC	2	10	891200	891209	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_013949	CAAAA	2	10	893052	893061	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_013949	CAAAT	2	10	895681	895690	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_013949	AATAA	2	10	895694	895703	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013949	AAAAG	2	10	913310	913319	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013949	TATAA	2	10	920232	920241	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013949	CCCTG	2	10	933889	933898	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
124	NC_013949	TCCCC	2	10	953867	953876	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
125	NC_013949	GGGGA	2	10	956208	956217	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013949	TCCCC	2	10	977798	977807	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
127	NC_013949	ATAAG	2	10	980127	980136	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013949	TCCCC	2	10	987775	987784	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
129	NC_013949	GATTT	2	10	995755	995764	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013949	CCAGC	2	10	999088	999097	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
131	NC_013949	GCAAA	2	10	1008615	1008624	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_013949	TTATT	2	10	1022292	1022301	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013949	GTTAA	2	10	1028977	1028986	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013949	TAAAA	2	10	1067689	1067698	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013949	AGCCA	2	10	1080093	1080102	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_013949	AAACC	2	10	1102663	1102672	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_013949	ATTTA	2	10	1102869	1102878	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013949	TAAAA	2	10	1144033	1144042	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013949	CAATG	2	10	1150368	1150377	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_013949	CCCTT	2	10	1152481	1152490	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
141	NC_013949	GAGTT	2	10	1165183	1165192	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013949	CAAAT	2	10	1165215	1165224	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_013949	CAAAA	2	10	1192632	1192641	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_013949	TTGTC	2	10	1197472	1197481	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_013949	ATCCC	2	10	1205009	1205018	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
146	NC_013949	ACCAC	2	10	1206430	1206439	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
147	NC_013949	TCATT	3	15	1209428	1209442	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_013949	AAATC	2	10	1219845	1219854	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_013949	ATTTT	2	10	1220156	1220165	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_013949	AAATA	2	10	1344105	1344114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013949	AACAA	2	10	1353955	1353964	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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169	NC_013949	TGATT	2	10	1513526	1513535	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_013949	CAAAA	2	10	1523197	1523206	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
173	NC_013949	AAACT	2	10	1523855	1523864	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
174	NC_013949	ATGCT	2	10	1523887	1523896	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
175	NC_013949	TATGA	2	10	1561147	1561156	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
176	NC_013949	GGGAT	2	10	1565491	1565500	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.