MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR04

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013747	CG	3	6	74	79	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013747	TC	3	6	153	158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013747	GC	3	6	519	524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013747	GT	3	6	552	557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013747	GC	3	6	788	793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013747	CG	3	6	796	801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013747	CT	3	6	3110	3115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013747	GA	3	6	4931	4936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013747	TA	3	6	5626	5631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013747	GA	3	6	8756	8761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013747	GC	4	8	11899	11906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013747	AT	3	6	11916	11921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013747	TG	3	6	12340	12345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013747	TG	3	6	24180	24185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013747	TC	3	6	25766	25771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013747	CT	3	6	28073	28078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013747	GC	3	6	28287	28292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013747	GA	3	6	29242	29247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013747	AT	3	6	31800	31805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013747	GA	3	6	32882	32887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013747	TA	3	6	38829	38834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013747	GA	3	6	40118	40123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013747	AT	3	6	42490	42495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013747	GA	3	6	56973	56978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013747	AT	3	6	57364	57369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013747	GC	3	6	61844	61849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013747	GA	3	6	63100	63105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013747	CG	3	6	63701	63706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013747	GA	3	6	63917	63922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013747	CG	3	6	64196	64201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013747	CG	3	6	67289	67294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013747	TC	4	8	68088	68095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013747	GC	3	6	68508	68513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013747	TC	3	6	69479	69484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013747	CG	3	6	69897	69902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013747	AG	3	6	70025	70030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013747	GA	3	6	71429	71434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013747	CG	3	6	79395	79400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013747	GA	3	6	79870	79875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013747	GA	3	6	82265	82270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013747	TA	3	6	82683	82688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013747	TA	3	6	82708	82713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013747	CG	3	6	83811	83816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013747	GT	3	6	91058	91063	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013747	TG	3	6	91199	91204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013747	GC	3	6	92119	92124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013747	CT	3	6	92747	92752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013747	GA	3	6	100806	100811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013747	CT	3	6	100893	100898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013747	CA	3	6	100986	100991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013747	CA	3	6	101042	101047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013747	AC	3	6	101306	101311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013747	GT	3	6	101446	101451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013747	TC	3	6	101471	101476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013747	GT	3	6	101737	101742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013747	AC	3	6	101907	101912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013747	GA	3	6	101932	101937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013747	AC	3	6	101996	102001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013747	GA	3	6	102145	102150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013747	AC	3	6	103504	103509	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013747	TA	3	6	103588	103593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013747	TG	3	6	103926	103931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013747	GA	3	6	104085	104090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013747	TC	3	6	104137	104142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013747	CA	3	6	104265	104270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013747	CA	5	10	104322	104331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013747	TC	4	8	104531	104538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013747	GA	3	6	104674	104679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013747	TC	3	6	104690	104695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013747	TC	3	6	104914	104919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013747	GT	4	8	105167	105174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013747	TG	3	6	108481	108486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013747	GT	3	6	110981	110986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013747	AG	3	6	118703	118708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013747	AT	3	6	118721	118726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013747	AC	5	10	118759	118768	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013747	TC	3	6	118992	118997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013747	GA	3	6	119124	119129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013747	TG	3	6	119307	119312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013747	CT	3	6	119360	119365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013747	TG	4	8	119452	119459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013747	GC	4	8	119520	119527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013747	GT	3	6	119802	119807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013747	TG	3	6	119886	119891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013747	CG	3	6	121495	121500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013747	CG	3	6	121595	121600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013747	GC	3	6	121646	121651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013747	CG	3	6	125261	125266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013747	GC	3	6	126385	126390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013747	AT	3	6	135834	135839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013747	TC	3	6	136393	136398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013747	GC	4	8	136592	136599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013747	CA	3	6	136869	136874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013747	CT	3	6	138136	138141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013747	TG	4	8	138572	138579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013747	CG	3	6	138895	138900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013747	CA	3	6	140726	140731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013747	AG	3	6	140790	140795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013747	TC	3	6	141051	141056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013747	GA	3	6	141074	141079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013747	GT	3	6	141109	141114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013747	CT	3	6	142641	142646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013747	GT	4	8	142708	142715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013747	CG	3	6	142856	142861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013747	AC	3	6	142869	142874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013747	GT	4	8	142952	142959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013747	AC	3	6	143065	143070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013747	CT	3	6	143079	143084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013747	TC	3	6	143201	143206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013747	GA	4	8	145671	145678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013747	GA	3	6	145683	145688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013747	CG	4	8	146001	146008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013747	GT	3	6	146191	146196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013747	CT	3	6	146953	146958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_013747	TC	3	6	147003	147008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013747	CG	3	6	148596	148601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013747	GT	3	6	150723	150728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013747	TG	3	6	150759	150764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013747	CG	3	6	150835	150840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013747	AT	3	6	152020	152025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013747	AT	3	6	152051	152056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013747	CG	3	6	152379	152384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013747	CG	4	8	152548	152555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_013747	CT	3	6	154618	154623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013747	GC	3	6	154820	154825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013747	GC	3	6	156194	156199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013747	GC	3	6	158166	158171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013747	GT	3	6	158288	158293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013747	AC	3	6	160165	160170	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013747	TA	3	6	165618	165623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013747	GA	3	6	165786	165791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013747	GC	3	6	165793	165798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.