MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR03

Total Repeats: 219

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013746	CA	3	6	793	798	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013746	AC	3	6	3182	3187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013746	CA	3	6	4192	4197	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013746	AG	3	6	5258	5263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013746	CA	3	6	5556	5561	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013746	CT	3	6	6779	6784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013746	TC	3	6	8274	8279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013746	GA	3	6	8529	8534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013746	AT	3	6	10346	10351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013746	TC	3	6	10433	10438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013746	GA	3	6	10478	10483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013746	CG	3	6	10786	10791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013746	TC	3	6	11323	11328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013746	GT	3	6	13632	13637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013746	GC	3	6	14894	14899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013746	TC	3	6	16679	16684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013746	CG	3	6	16994	16999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013746	AG	3	6	17066	17071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013746	AT	4	8	18662	18669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013746	TC	4	8	19017	19024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013746	AG	3	6	20401	20406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013746	AC	3	6	21277	21282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013746	CA	3	6	21358	21363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013746	CT	3	6	22929	22934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013746	GC	3	6	23412	23417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013746	TA	3	6	24335	24340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013746	GT	3	6	24497	24502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013746	AC	3	6	25210	25215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013746	TC	3	6	25276	25281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013746	AT	3	6	25816	25821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013746	GC	3	6	26177	26182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013746	AC	3	6	26337	26342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013746	AC	3	6	27001	27006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013746	AT	3	6	27178	27183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013746	TA	3	6	27217	27222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013746	AG	3	6	27290	27295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013746	TA	3	6	29108	29113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013746	GT	3	6	29452	29457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013746	AG	3	6	29770	29775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013746	GA	3	6	30437	30442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013746	AG	3	6	30603	30608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013746	AT	3	6	31368	31373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013746	TA	3	6	31579	31584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013746	CT	3	6	32150	32155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013746	GA	4	8	32159	32166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013746	AT	3	6	32209	32214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013746	AG	3	6	32265	32270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013746	AC	3	6	33217	33222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013746	TA	3	6	35692	35697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013746	AC	3	6	36832	36837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013746	CG	3	6	37878	37883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013746	AT	3	6	37985	37990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013746	AC	3	6	38777	38782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013746	GA	3	6	39487	39492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013746	CA	3	6	43337	43342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013746	AC	3	6	44184	44189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013746	CT	3	6	44354	44359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013746	GC	3	6	44478	44483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013746	CT	3	6	46699	46704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013746	AG	3	6	49979	49984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013746	TC	3	6	51239	51244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013746	CT	3	6	51598	51603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013746	CA	3	6	52993	52998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013746	TG	3	6	54625	54630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013746	CT	3	6	54635	54640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013746	TC	3	6	54792	54797	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013746	CT	3	6	56078	56083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013746	AT	3	6	56257	56262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013746	TA	3	6	57560	57565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013746	CA	4	8	58709	58716	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013746	CA	3	6	58810	58815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013746	AT	3	6	58907	58912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013746	AT	3	6	58940	58945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013746	TA	4	8	58951	58958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013746	TC	4	8	59205	59212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013746	GA	3	6	59790	59795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013746	GT	3	6	60690	60695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013746	TA	3	6	63709	63714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013746	GT	3	6	63840	63845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013746	AT	3	6	64148	64153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013746	TC	3	6	64325	64330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013746	GA	3	6	69078	69083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013746	TC	3	6	70142	70147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013746	CT	3	6	70631	70636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013746	AT	3	6	70639	70644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013746	AC	3	6	72265	72270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013746	GT	3	6	73320	73325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013746	GA	3	6	73442	73447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013746	TC	3	6	73897	73902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013746	GT	3	6	74039	74044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013746	GC	3	6	74101	74106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013746	GA	3	6	74122	74127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013746	CT	3	6	77006	77011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013746	GA	3	6	77061	77066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013746	TG	3	6	77199	77204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013746	GT	3	6	77207	77212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013746	CT	3	6	79146	79151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013746	CT	3	6	79185	79190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013746	GA	3	6	79554	79559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013746	TC	3	6	80801	80806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013746	TC	3	6	80851	80856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013746	AC	3	6	81013	81018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013746	TA	3	6	81186	81191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013746	GT	3	6	82902	82907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013746	TG	3	6	83992	83997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013746	GT	3	6	84120	84125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013746	AC	3	6	84648	84653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013746	AC	3	6	84757	84762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013746	TC	3	6	85475	85480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013746	GA	3	6	85481	85486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013746	GC	3	6	85785	85790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013746	GA	3	6	85863	85868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013746	TA	3	6	85885	85890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013746	TG	3	6	86057	86062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013746	CT	4	8	87930	87937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013746	TG	3	6	87963	87968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013746	AG	3	6	87999	88004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013746	GA	3	6	88554	88559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013746	GA	3	6	88604	88609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013746	GA	3	6	88891	88896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013746	AC	3	6	89266	89271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013746	GA	3	6	89870	89875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013746	GT	3	6	91501	91506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013746	CG	3	6	91887	91892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013746	GA	4	8	92350	92357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013746	TC	3	6	92376	92381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013746	CT	3	6	92702	92707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013746	TG	3	6	96251	96256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013746	CA	3	6	96803	96808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013746	GA	3	6	97051	97056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013746	TA	3	6	97437	97442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013746	GA	3	6	98995	99000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013746	AC	3	6	99144	99149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013746	TC	3	6	99526	99531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013746	GC	3	6	100140	100145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013746	GA	3	6	100221	100226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013746	TA	3	6	100243	100248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013746	CT	3	6	100569	100574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013746	GA	3	6	100582	100587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013746	GA	3	6	100688	100693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013746	TG	3	6	100738	100743	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013746	TC	3	6	101604	101609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013746	CA	3	6	101766	101771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013746	CT	3	6	101988	101993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013746	CG	3	6	102125	102130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013746	AT	3	6	102198	102203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013746	CG	3	6	102901	102906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_013746	AT	3	6	103168	103173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013746	TC	4	8	103500	103507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013746	AT	3	6	104528	104533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013746	AC	3	6	108423	108428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_013746	AG	3	6	108429	108434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013746	CT	3	6	108568	108573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_013746	AG	3	6	108620	108625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_013746	TA	3	6	112721	112726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_013746	AC	3	6	112736	112741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_013746	TC	3	6	112831	112836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
158	NC_013746	GT	3	6	115177	115182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013746	GA	3	6	116692	116697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013746	GT	3	6	117772	117777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_013746	TC	4	8	117979	117986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_013746	GT	3	6	119544	119549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013746	GT	3	6	119765	119770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
164	NC_013746	GT	3	6	120581	120586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
165	NC_013746	CT	3	6	123930	123935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
166	NC_013746	CG	3	6	124797	124802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
167	NC_013746	TA	3	6	124872	124877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_013746	AT	3	6	125537	125542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_013746	TC	3	6	125558	125563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
170	NC_013746	TA	3	6	125566	125571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013746	AG	3	6	125608	125613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
172	NC_013746	AG	3	6	126513	126518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_013746	TG	3	6	128127	128132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
174	NC_013746	CT	3	6	133451	133456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
175	NC_013746	TA	3	6	133475	133480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_013746	AT	3	6	136991	136996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_013746	AG	4	8	137933	137940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
178	NC_013746	CT	3	6	138285	138290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
179	NC_013746	GC	3	6	138321	138326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
180	NC_013746	GC	3	6	138331	138336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
181	NC_013746	AC	3	6	138423	138428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
182	NC_013746	CG	3	6	139480	139485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
183	NC_013746	GC	3	6	139602	139607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
184	NC_013746	GC	3	6	139945	139950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
185	NC_013746	CT	4	8	140002	140009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
186	NC_013746	CT	3	6	140194	140199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
187	NC_013746	TG	3	6	140509	140514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
188	NC_013746	TA	4	8	143974	143981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_013746	TG	3	6	144984	144989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
190	NC_013746	AG	3	6	145324	145329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
191	NC_013746	GT	3	6	145576	145581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
192	NC_013746	CT	3	6	145814	145819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
193	NC_013746	TC	3	6	146272	146277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
194	NC_013746	AG	3	6	146550	146555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
195	NC_013746	AT	3	6	146857	146862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_013746	TC	3	6	146918	146923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
197	NC_013746	AG	3	6	148970	148975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
198	NC_013746	CG	3	6	149699	149704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
199	NC_013746	GC	3	6	149916	149921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
200	NC_013746	AG	3	6	149947	149952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
201	NC_013746	AG	3	6	150374	150379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
202	NC_013746	AC	3	6	152354	152359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
203	NC_013746	TC	3	6	152458	152463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
204	NC_013746	CT	3	6	152557	152562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
205	NC_013746	TC	3	6	153095	153100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
206	NC_013746	AT	3	6	154376	154381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
207	NC_013746	AG	3	6	154569	154574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
208	NC_013746	TA	3	6	155511	155516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
209	NC_013746	TC	3	6	156277	156282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
210	NC_013746	TC	3	6	156892	156897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
211	NC_013746	AT	3	6	157416	157421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
212	NC_013746	AG	3	6	157505	157510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
213	NC_013746	AC	3	6	169679	169684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
214	NC_013746	GT	3	6	171649	171654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
215	NC_013746	AT	3	6	174768	174773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
216	NC_013746	TC	3	6	174894	174899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
217	NC_013746	AG	3	6	176735	176740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
218	NC_013746	GA	3	6	178176	178181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
219	NC_013746	GA	3	6	178258	178263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.