MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 2998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013744	TCC	2	6	269452	269457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_013744	CGA	2	6	269567	269572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_013744	ACT	2	6	269632	269637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_013744	AGCGA	2	10	269655	269664	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1005	NC_013744	TC	3	6	269742	269747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_013744	GAG	2	6	269761	269766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_013744	GGACAG	2	12	272391	272402	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1008	NC_013744	AAG	2	6	272422	272427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_013744	TCG	2	6	272452	272457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_013744	GCG	2	6	272470	272475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_013744	GAA	2	6	272493	272498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_013744	TTC	2	6	272500	272505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_013744	TAA	2	6	272513	272518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_013744	GCTA	2	8	272526	272533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_013744	ATGA	2	8	272546	272553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_013744	TTA	2	6	272567	272572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_013744	AAG	2	6	272611	272616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_013744	GCA	2	6	272642	272647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_013744	CTG	2	6	272704	272709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_013744	ACT	2	6	272712	272717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_013744	TGG	2	6	272721	272726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_013744	GAA	2	6	272798	272803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_013744	AGA	2	6	272839	272844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_013744	TTG	2	6	272964	272969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_013744	CGG	2	6	273028	273033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_013744	AC	3	6	273035	273040	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_013744	ACG	2	6	273085	273090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_013744	CGA	2	6	273105	273110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_013744	CTC	2	6	273241	273246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_013744	CCAA	2	8	273247	273254	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_013744	GTC	2	6	273259	273264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_013744	CGAA	2	8	273319	273326	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_013744	CAG	2	6	273337	273342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_013744	CTC	2	6	273355	273360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_013744	GAC	3	9	273399	273407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_013744	TCA	2	6	273440	273445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_013744	AGA	2	6	273500	273505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_013744	CG	3	6	273508	273513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_013744	TTCG	2	8	273667	273674	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_013744	TGG	2	6	273685	273690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_013744	TCAC	2	8	273722	273729	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_013744	ACC	2	6	273796	273801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_013744	CAAG	2	8	273898	273905	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_013744	AGG	2	6	273961	273966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_013744	AGG	2	6	274076	274081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_013744	ACT	2	6	274951	274956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_013744	GT	3	6	274968	274973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_013744	GGC	2	6	275017	275022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_013744	GTTC	2	8	276296	276303	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_013744	GGAG	2	8	276323	276330	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_013744	ATG	3	9	276331	276339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_013744	GACT	2	8	276406	276413	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_013744	TGG	3	9	276429	276437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_013744	TCG	2	6	276438	276443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_013744	CGG	2	6	276479	276484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_013744	GC	3	6	276505	276510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_013744	GTCCCA	2	12	276580	276591	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_013744	CGT	2	6	276593	276598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_013744	GGT	2	6	276659	276664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_013744	AGG	2	6	276692	276697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_013744	ACCGC	2	10	276787	276796	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1062	NC_013744	GTC	2	6	276799	276804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_013744	TGT	2	6	276830	276835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_013744	ACG	2	6	276848	276853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_013744	ACC	2	6	276922	276927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_013744	TCG	2	6	276979	276984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_013744	CGT	2	6	277070	277075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_013744	CGA	2	6	277142	277147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_013744	TCG	2	6	277162	277167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_013744	AGT	2	6	277196	277201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_013744	GTC	2	6	277224	277229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_013744	AGG	2	6	277357	277362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_013744	TCC	2	6	277381	277386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_013744	GAA	2	6	277388	277393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_013744	GCG	3	9	277400	277408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_013744	ACA	2	6	277431	277436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_013744	CGT	2	6	277448	277453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_013744	CCGAC	2	10	277529	277538	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1079	NC_013744	ACGA	2	8	277555	277562	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_013744	CCG	2	6	277588	277593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_013744	AGA	2	6	277604	277609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_013744	TAC	2	6	277638	277643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_013744	C	6	6	277643	277648	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1084	NC_013744	GAC	2	6	277658	277663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_013744	AGCC	2	8	277710	277717	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_013744	GAC	2	6	277760	277765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_013744	ACC	2	6	277766	277771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_013744	CTGT	2	8	277843	277850	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_013744	CGT	2	6	277870	277875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_013744	TCG	2	6	277881	277886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_013744	CTAG	2	8	277902	277909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_013744	GA	3	6	277922	277927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_013744	CAG	2	6	277979	277984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_013744	GA	4	8	278094	278101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_013744	CGT	2	6	278105	278110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_013744	GTAC	2	8	278124	278131	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1097	NC_013744	GTCT	2	8	279001	279008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_013744	AGG	2	6	279010	279015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_013744	AT	3	6	279059	279064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_013744	GAG	2	6	281936	281941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_013744	CGAA	2	8	281985	281992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_013744	GTTGGT	2	12	282002	282013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_013744	GGA	2	6	282456	282461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_013744	TGTGT	2	10	282979	282988	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_013744	CA	3	6	282989	282994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_013744	TAG	2	6	283590	283595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_013744	GT	3	6	284024	284029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_013744	GGA	2	6	284035	284040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_013744	GAG	2	6	284048	284053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_013744	TCG	3	9	284626	284634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_013744	TGC	2	6	284644	284649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_013744	AGC	2	6	284658	284663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_013744	TC	3	6	284705	284710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_013744	GCT	2	6	284744	284749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_013744	TCG	2	6	284750	284755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_013744	GTT	2	6	284781	284786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_013744	GTA	2	6	284791	284796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_013744	CGT	2	6	284896	284901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_013744	TGG	2	6	284905	284910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_013744	CGG	2	6	284926	284931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_013744	CTCG	2	8	284934	284941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_013744	TTCG	2	8	284954	284961	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_013744	ACC	2	6	286126	286131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_013744	GAA	2	6	286161	286166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_013744	TGC	2	6	286219	286224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_013744	TGA	2	6	286318	286323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_013744	GTC	2	6	286374	286379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_013744	GGA	2	6	286403	286408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_013744	CGG	2	6	286427	286432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_013744	GAG	2	6	286437	286442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_013744	GAT	2	6	286658	286663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_013744	GGTG	2	8	286677	286684	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_013744	GTC	2	6	286756	286761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1136	NC_013744	GTCG	2	8	286844	286851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1144	NC_013744	TGC	2	6	287553	287558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1197	NC_013744	CAT	2	6	302119	302124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1235	NC_013744	TAA	2	6	310128	310133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1246	NC_013744	AAT	2	6	317507	317512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1254	NC_013744	GCT	2	6	319851	319856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1266	NC_013744	GCG	2	6	320339	320344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1267	NC_013744	GGA	2	6	320379	320384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_013744	CCT	2	6	320451	320456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1269	NC_013744	CT	3	6	320489	320494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1270	NC_013744	GGA	2	6	320579	320584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_013744	GT	3	6	320619	320624	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_013744	TTA	2	6	320732	320737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1273	NC_013744	TCTGA	2	10	320795	320804	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1274	NC_013744	TTA	2	6	320877	320882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1287	NC_013744	AAAAT	2	10	321372	321381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1290	NC_013744	TGG	2	6	321473	321478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1291	NC_013744	CCT	2	6	321540	321545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1292	NC_013744	CTT	2	6	321548	321553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1300	NC_013744	AGTA	2	8	321892	321899	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1301	NC_013744	TTATA	2	10	321964	321973	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1312	NC_013744	ATT	2	6	322246	322251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1314	NC_013744	GAT	2	6	322335	322340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1393	NC_013744	ATC	2	6	330698	330703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1397	NC_013744	CTT	2	6	330931	330936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1398	NC_013744	AG	3	6	330956	330961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1399	NC_013744	TTC	2	6	330964	330969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1400	NC_013744	A	6	6	331064	331069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1401	NC_013744	TCT	2	6	331090	331095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1402	NC_013744	TCG	2	6	331096	331101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1403	NC_013744	TCG	2	6	331113	331118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1404	NC_013744	GTT	2	6	331122	331127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1405	NC_013744	GTT	2	6	331139	331144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_013744	TCT	2	6	331209	331214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1428	NC_013744	TAT	2	6	336554	336559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1431	NC_013744	CGCT	2	8	336611	336618	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1432	NC_013744	ACCC	2	8	336624	336631	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1433	NC_013744	CTT	2	6	336678	336683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1434	NC_013744	TGC	2	6	336777	336782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1436	NC_013744	AGA	2	6	336901	336906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_013744	CCCA	2	8	362540	362547	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

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