MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 500

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013422	AC	3	6	13823	13828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013422	AC	3	6	15928	15933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013422	AC	3	6	16099	16104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013422	TA	3	6	17722	17727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013422	GC	3	6	24523	24528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013422	CA	3	6	26086	26091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013422	GC	3	6	33354	33359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013422	TG	4	8	33582	33589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013422	CG	3	6	64580	64585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013422	TC	3	6	67997	68002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013422	CG	4	8	68774	68781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013422	AC	3	6	79187	79192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013422	AC	3	6	81277	81282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013422	CA	3	6	81413	81418	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013422	CG	3	6	85318	85323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013422	CG	3	6	86837	86842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013422	CG	3	6	87109	87114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013422	CG	3	6	87381	87386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013422	CG	3	6	90531	90536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013422	GC	3	6	91533	91538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013422	TG	3	6	103684	103689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013422	GC	3	6	104018	104023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013422	AG	3	6	104160	104165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013422	TA	3	6	114710	114715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013422	TG	4	8	117504	117511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013422	GT	3	6	118963	118968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013422	GC	3	6	135185	135190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013422	TG	3	6	135197	135202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013422	AT	3	6	149954	149959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013422	TA	3	6	150157	150162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013422	GT	3	6	155029	155034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013422	TG	3	6	168241	168246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013422	GC	4	8	168543	168550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013422	AC	3	6	168931	168936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013422	CG	3	6	169554	169559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013422	CA	3	6	179591	179596	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013422	TC	3	6	185107	185112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013422	CT	3	6	193900	193905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013422	TG	3	6	194374	194379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013422	TA	3	6	194394	194399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013422	AG	3	6	201851	201856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013422	AG	3	6	201921	201926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013422	AT	3	6	204022	204027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013422	CG	3	6	214323	214328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013422	AT	4	8	216207	216214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013422	GT	3	6	219442	219447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013422	GT	3	6	221140	221145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013422	TG	3	6	221325	221330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013422	AT	3	6	222405	222410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013422	GC	3	6	222823	222828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013422	TG	3	6	224152	224157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013422	AT	3	6	225811	225816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013422	CA	3	6	234271	234276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013422	CT	3	6	234437	234442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013422	AC	3	6	242251	242256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013422	GC	3	6	242770	242775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013422	TG	3	6	255103	255108	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013422	CT	3	6	256075	256080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013422	TG	3	6	260538	260543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013422	TA	3	6	264361	264366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013422	GC	3	6	266547	266552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013422	TG	3	6	287735	287740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013422	GC	3	6	287752	287757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013422	AC	3	6	299003	299008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013422	TG	3	6	299104	299109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013422	GA	3	6	304845	304850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013422	CG	3	6	310807	310812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013422	GC	3	6	310839	310844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013422	GA	3	6	310889	310894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013422	GC	3	6	319063	319068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013422	TA	3	6	364176	364181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013422	CT	3	6	366071	366076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013422	GC	3	6	366190	366195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013422	CA	3	6	366717	366722	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013422	GA	3	6	371888	371893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013422	GC	3	6	387998	388003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013422	GC	3	6	388158	388163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013422	GC	3	6	388799	388804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013422	GC	3	6	389427	389432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013422	TG	3	6	389639	389644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013422	TC	3	6	391132	391137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013422	TA	3	6	393339	393344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013422	GT	3	6	393414	393419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013422	CG	3	6	396957	396962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013422	TG	3	6	399985	399990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013422	GC	3	6	402291	402296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013422	CA	3	6	402297	402302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013422	TC	3	6	408502	408507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013422	TC	3	6	430261	430266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013422	GC	3	6	442229	442234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013422	GC	3	6	463548	463553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013422	CT	3	6	464040	464045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013422	CG	3	6	464103	464108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013422	AT	3	6	464158	464163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013422	GC	3	6	482427	482432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013422	TA	3	6	484701	484706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013422	GT	3	6	484964	484969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013422	GT	3	6	489037	489042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013422	GC	3	6	490035	490040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013422	GT	3	6	497800	497805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013422	TC	3	6	502034	502039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013422	GC	3	6	503951	503956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013422	GA	3	6	506961	506966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013422	GC	3	6	506996	507001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013422	GT	3	6	507110	507115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013422	GC	3	6	511112	511117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013422	GT	3	6	533751	533756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013422	GA	3	6	533761	533766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013422	AC	3	6	541561	541566	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013422	CA	3	6	546106	546111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013422	CG	3	6	546489	546494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013422	TC	3	6	549845	549850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013422	TG	3	6	563854	563859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013422	AT	3	6	570942	570947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013422	GA	3	6	573597	573602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013422	TG	3	6	573689	573694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013422	GT	3	6	574179	574184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013422	AC	3	6	575002	575007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013422	AC	3	6	575172	575177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013422	GC	3	6	575655	575660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013422	GA	3	6	576572	576577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013422	GT	3	6	577490	577495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013422	GA	3	6	577667	577672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013422	AC	3	6	578692	578697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013422	TG	4	8	586586	586593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013422	AG	4	8	589459	589466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013422	TG	3	6	612604	612609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013422	GC	4	8	624161	624168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013422	GC	3	6	624348	624353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013422	AC	3	6	624492	624497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013422	GT	3	6	641462	641467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013422	TA	3	6	641484	641489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013422	TG	3	6	642509	642514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013422	GC	4	8	643577	643584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013422	AT	3	6	652058	652063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013422	AC	3	6	656539	656544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_013422	GT	3	6	666239	666244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013422	GC	3	6	666336	666341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013422	GC	3	6	666548	666553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013422	AT	3	6	673028	673033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013422	CA	3	6	674507	674512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013422	TG	3	6	678164	678169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013422	TG	3	6	685277	685282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013422	TG	3	6	687728	687733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013422	GT	3	6	690724	690729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013422	TG	3	6	695634	695639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013422	TA	3	6	696676	696681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013422	GC	3	6	698405	698410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013422	GC	3	6	702157	702162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013422	GT	3	6	709966	709971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013422	TA	3	6	719786	719791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013422	AT	4	8	719804	719811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013422	GC	4	8	726518	726525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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450	NC_013422	GC	3	6	2316865	2316870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
451	NC_013422	TG	3	6	2319397	2319402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
452	NC_013422	CA	3	6	2326816	2326821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
453	NC_013422	CG	3	6	2331473	2331478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
454	NC_013422	CG	3	6	2331487	2331492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
455	NC_013422	GA	3	6	2337438	2337443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
456	NC_013422	GT	3	6	2343802	2343807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
457	NC_013422	AC	3	6	2345200	2345205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
458	NC_013422	GC	4	8	2345704	2345711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
459	NC_013422	AC	3	6	2352375	2352380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
460	NC_013422	AC	3	6	2365831	2365836	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
461	NC_013422	CG	3	6	2370000	2370005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
462	NC_013422	CA	3	6	2375102	2375107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
463	NC_013422	AG	3	6	2384279	2384284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
464	NC_013422	CA	3	6	2387325	2387330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
465	NC_013422	AG	3	6	2390095	2390100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
466	NC_013422	GC	3	6	2408937	2408942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
467	NC_013422	GT	3	6	2410341	2410346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
468	NC_013422	GC	3	6	2410350	2410355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
469	NC_013422	GC	3	6	2420622	2420627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
470	NC_013422	AT	3	6	2420736	2420741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_013422	TC	3	6	2429070	2429075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
472	NC_013422	GC	3	6	2437249	2437254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
473	NC_013422	TG	3	6	2453790	2453795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
474	NC_013422	GC	3	6	2453858	2453863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
475	NC_013422	AC	3	6	2453918	2453923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
476	NC_013422	CA	3	6	2458952	2458957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
477	NC_013422	GC	3	6	2459469	2459474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
478	NC_013422	GT	3	6	2462005	2462010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
479	NC_013422	CG	3	6	2462394	2462399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
480	NC_013422	CG	3	6	2475941	2475946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
481	NC_013422	AG	4	8	2491312	2491319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
482	NC_013422	GC	5	10	2518517	2518526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
483	NC_013422	TG	3	6	2518555	2518560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
484	NC_013422	AC	3	6	2519024	2519029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
485	NC_013422	GC	3	6	2519130	2519135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
486	NC_013422	CG	3	6	2519807	2519812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
487	NC_013422	GT	3	6	2524644	2524649	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
488	NC_013422	AT	3	6	2524712	2524717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_013422	TA	3	6	2530497	2530502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_013422	TC	3	6	2539241	2539246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
491	NC_013422	TG	3	6	2548801	2548806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
492	NC_013422	AT	3	6	2548844	2548849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_013422	TA	3	6	2558902	2558907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
494	NC_013422	TC	3	6	2561545	2561550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
495	NC_013422	GT	3	6	2568533	2568538	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
496	NC_013422	CT	3	6	2573709	2573714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
497	NC_013422	TG	4	8	2576672	2576679	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
498	NC_013422	AC	3	6	2576844	2576849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
499	NC_013422	AT	3	6	2577394	2577399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_013422	TG	3	6	2582758	2582763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding