MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 5445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013422	GT	3	6	219442	219447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
502	NC_013422	GT	3	6	221140	221145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_013422	GGGTT	2	10	221248	221257	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
504	NC_013422	T	6	6	221256	221261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_013422	TAA	2	6	221265	221270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_013422	ATT	2	6	221276	221281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013422	TG	3	6	221325	221330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_013422	CTG	2	6	221358	221363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_013422	AT	3	6	222405	222410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013422	GC	3	6	222823	222828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_013422	CTAT	2	8	222886	222893	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
512	NC_013422	GCC	2	6	222921	222926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_013422	AGC	2	6	222973	222978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_013422	CCG	2	6	222979	222984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_013422	T	7	7	223043	223049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013422	TTC	2	6	223457	223462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_013422	TGA	2	6	224086	224091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_013422	TGTT	2	8	224097	224104	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_013422	TG	3	6	224152	224157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_013422	TAA	2	6	224180	224185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_013422	AT	3	6	225811	225816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_013422	TTAT	2	8	225850	225857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_013422	ATT	2	6	225861	225866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013422	ATTA	2	8	225899	225906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013422	TTA	2	6	225909	225914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_013422	GGC	2	6	227937	227942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_013422	GAT	2	6	227979	227984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013422	T	6	6	227994	227999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_013422	CTG	2	6	228024	228029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_013422	A	6	6	228046	228051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_013422	C	6	6	228072	228077	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
532	NC_013422	A	6	6	229855	229860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013422	TTGATG	2	12	229909	229920	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013422	AAT	2	6	232110	232115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_013422	ATT	2	6	232141	232146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_013422	T	6	6	232201	232206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013422	TTGG	2	8	232217	232224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_013422	ATAA	2	8	233642	233649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_013422	AAC	3	9	234052	234060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_013422	GCT	2	6	234187	234192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_013422	GCA	2	6	234241	234246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_013422	CA	3	6	234271	234276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_013422	ACG	2	6	234358	234363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_013422	GAA	2	6	234404	234409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_013422	T	6	6	234424	234429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_013422	CT	3	6	234437	234442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_013422	ATT	2	6	234460	234465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_013422	CGC	2	6	236461	236466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_013422	TAA	2	6	236504	236509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013422	ACG	2	6	241471	241476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_013422	ATT	2	6	241505	241510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013422	AC	3	6	242251	242256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_013422	GC	3	6	242770	242775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_013422	GCC	2	6	242833	242838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_013422	TCA	2	6	242921	242926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_013422	C	6	6	242938	242943	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
557	NC_013422	G	7	7	242953	242959	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
558	NC_013422	TTG	2	6	242970	242975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_013422	GGAA	2	8	244055	244062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_013422	CTG	2	6	245357	245362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_013422	A	8	8	245370	245377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_013422	CCTC	2	8	245387	245394	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
563	NC_013422	GAGG	2	8	245408	245415	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
564	NC_013422	GAG	2	6	245441	245446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_013422	GCGG	2	8	245519	245526	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
566	NC_013422	GGTT	2	8	251694	251701	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_013422	ATC	2	6	251721	251726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_013422	GCT	2	6	251786	251791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_013422	CAGG	2	8	251802	251809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
570	NC_013422	TGC	2	6	252216	252221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_013422	GCT	2	6	252236	252241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_013422	T	6	6	252277	252282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013422	TCGC	2	8	252627	252634	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
574	NC_013422	CGT	2	6	253478	253483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_013422	GTT	2	6	253487	253492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013422	TTA	2	6	254123	254128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_013422	GTG	2	6	254842	254847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_013422	GGC	2	6	255019	255024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_013422	TG	3	6	255103	255108	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_013422	G	10	10	255176	255185	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
581	NC_013422	CT	3	6	256075	256080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
582	NC_013422	T	6	6	256086	256091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_013422	G	7	7	256126	256132	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
584	NC_013422	GCGG	2	8	256147	256154	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
585	NC_013422	TTTC	2	8	257340	257347	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
586	NC_013422	GAA	2	6	258581	258586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_013422	CGAATG	2	12	260528	260539	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
588	NC_013422	TG	3	6	260538	260543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
589	NC_013422	CTC	2	6	263209	263214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_013422	AGA	2	6	263287	263292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_013422	T	6	6	263321	263326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_013422	A	7	7	263337	263343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_013422	ATG	2	6	264333	264338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_013422	TA	3	6	264361	264366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_013422	GC	3	6	266547	266552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
596	NC_013422	C	6	6	266630	266635	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
597	NC_013422	GGAT	2	8	266661	266668	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_013422	TGAT	2	8	267677	267684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
599	NC_013422	TTA	2	6	267691	267696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_013422	TGA	2	6	269056	269061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_013422	CGG	2	6	269096	269101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_013422	AGC	2	6	269123	269128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_013422	GGGC	2	8	269130	269137	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
604	NC_013422	CTATT	2	10	270024	270033	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
605	NC_013422	GCG	2	6	272163	272168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_013422	AGGC	2	8	274916	274923	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
607	NC_013422	GTTCG	2	10	275274	275283	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
608	NC_013422	TTAATT	2	12	275295	275306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013422	GGC	2	6	275355	275360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_013422	GCT	2	6	275419	275424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_013422	CTGC	2	8	275919	275926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
612	NC_013422	TGTT	2	8	275966	275973	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013422	ATG	2	6	275978	275983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_013422	TGC	2	6	275990	275995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_013422	TGA	2	6	278953	278958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_013422	A	6	6	279302	279307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_013422	CGA	2	6	281152	281157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_013422	TTG	2	6	281178	281183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_013422	TG	3	6	287735	287740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_013422	GC	3	6	287752	287757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_013422	AAG	2	6	287786	287791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_013422	CAC	2	6	287798	287803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_013422	CCT	2	6	288834	288839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_013422	GTA	2	6	288854	288859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_013422	GCT	3	9	288866	288874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_013422	GCT	2	6	288885	288890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_013422	GCG	2	6	294106	294111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_013422	GCG	2	6	294190	294195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_013422	GGT	2	6	296219	296224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_013422	CAT	2	6	296231	296236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_013422	CGT	2	6	296308	296313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_013422	A	6	6	296344	296349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_013422	T	6	6	296937	296942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_013422	CTC	2	6	298960	298965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_013422	GGT	2	6	298982	298987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_013422	AC	3	6	299003	299008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
637	NC_013422	GTG	2	6	299026	299031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_013422	TCA	2	6	299072	299077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_013422	GCAT	2	8	299080	299087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
640	NC_013422	TG	3	6	299104	299109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_013422	T	6	6	299128	299133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_013422	T	8	8	299214	299221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_013422	ATTT	2	8	299334	299341	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
645	NC_013422	T	6	6	299361	299366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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654	NC_013422	GTG	2	6	304864	304869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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665	NC_013422	ACG	2	6	308929	308934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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783	NC_013422	GC	3	6	387998	388003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
784	NC_013422	GC	3	6	388158	388163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
785	NC_013422	C	6	6	388188	388193	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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917	NC_013422	AAT	2	6	431156	431161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
918	NC_013422	A	6	6	431162	431167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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