MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 plasmid pHmuk01

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013201	GAACG	2	10	12418	12427	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013201	CCGAG	2	10	15620	15629	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013201	GAGAG	2	10	21306	21315	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013201	TCGTC	2	10	31900	31909	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_013201	GAGAG	2	10	32437	32446	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013201	GAAAC	2	10	33918	33927	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013201	TGGGC	2	10	34343	34352	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013201	GAAAT	2	10	41010	41019	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013201	TATGT	2	10	41310	41319	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013201	CACCC	2	10	41525	41534	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
11	NC_013201	TTGAA	2	10	58319	58328	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013201	GTTTA	2	10	71670	71679	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013201	CGATG	2	10	76625	76634	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013201	GACGC	2	10	80423	80432	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_013201	ATGTG	2	10	93600	93609	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013201	TCGCT	2	10	102777	102786	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_013201	GAAGC	2	10	132326	132335	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013201	CCGGA	2	10	137476	137485	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_013201	CGGGA	2	10	149946	149955	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013201	TCAAC	2	10	159201	159210	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_013201	CACTA	2	10	159466	159475	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_013201	ACACC	2	10	179797	179806	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_013201	CGCGA	2	10	182301	182310	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_013201	TCCTC	2	10	182531	182540	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_013201	ACGAC	2	10	182717	182726	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_013201	ACGTG	2	10	187426	187435	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013201	ATATA	2	10	198442	198451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013201	CTCGT	2	10	202601	202610	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_013201	AGCTT	2	10	202689	202698	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013201	AGCTA	2	10	202702	202711	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013201	AGCGG	2	10	209227	209236	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013201	TCGAC	2	10	209375	209384	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_013201	ACCGT	2	10	209658	209667	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_013201	CACCG	2	10	220584	220593	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.