MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Halomicrobium mukohataei DSM 12286 plasmid pHmuk01

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013201	GATC	2	8	4439	4446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013201	CTGT	2	8	7784	7791	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013201	ATTC	2	8	7810	7817	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013201	CGGT	2	8	11983	11990	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013201	TCGA	2	8	12456	12463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013201	TCTA	2	8	12813	12820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013201	ATAG	2	8	13015	13022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013201	CCTA	2	8	13505	13512	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013201	TCCA	2	8	14352	14359	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013201	TTGG	2	8	14751	14758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013201	TGCC	2	8	15240	15247	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013201	CGTC	2	8	15604	15611	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013201	TTCC	2	8	16374	16381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013201	CGCT	3	12	17693	17704	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013201	CGTC	2	8	17763	17770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013201	GGCC	2	8	18583	18590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013201	CGTT	2	8	20125	20132	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013201	AGCG	2	8	21433	21440	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013201	CGAC	2	8	25796	25803	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013201	ACGA	2	8	32101	32108	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013201	CCGC	2	8	32557	32564	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_013201	GGCT	2	8	32968	32975	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013201	CGTG	2	8	34211	34218	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013201	TCAC	2	8	34810	34817	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013201	GCCC	2	8	35677	35684	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_013201	GTCG	2	8	36445	36452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013201	GGTC	2	8	36581	36588	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013201	CGTG	2	8	37409	37416	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013201	AAGC	2	8	37575	37582	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013201	CTGT	2	8	37734	37741	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013201	GTAC	2	8	38054	38061	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013201	GATC	2	8	38391	38398	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013201	AGTG	2	8	39124	39131	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013201	GATC	2	8	39185	39192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013201	GACG	2	8	40813	40820	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013201	CGAT	2	8	41271	41278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013201	CACT	2	8	41583	41590	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013201	CACT	2	8	41595	41602	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013201	CACT	2	8	41607	41614	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013201	CACT	2	8	41619	41626	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013201	TACT	2	8	41631	41638	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013201	ACCG	2	8	47419	47426	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013201	CCCG	2	8	54774	54781	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_013201	GACG	2	8	61939	61946	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013201	ACGG	2	8	67489	67496	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013201	GAAC	2	8	68268	68275	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013201	CGGT	2	8	68842	68849	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013201	GGAC	2	8	69408	69415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013201	GTCG	2	8	71039	71046	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013201	CGAC	2	8	73633	73640	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013201	CGAG	2	8	73668	73675	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013201	CCGC	2	8	73704	73711	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_013201	CCCT	2	8	75118	75125	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_013201	TCCG	2	8	75369	75376	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013201	GTCC	2	8	75433	75440	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013201	CGTC	2	8	77516	77523	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013201	CGAC	2	8	80306	80313	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013201	CGCT	2	8	80854	80861	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013201	CCCG	2	8	80933	80940	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_013201	TCGT	2	8	81447	81454	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013201	CCGT	2	8	87785	87792	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013201	AGGT	2	8	94875	94882	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013201	CCTT	2	8	95260	95267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013201	CCCA	2	8	97365	97372	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_013201	AACG	2	8	101217	101224	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013201	GCTG	2	8	101339	101346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013201	TAGC	2	8	101363	101370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013201	GCTG	2	8	101378	101385	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013201	AATC	2	8	107865	107872	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013201	CGGC	2	8	107913	107920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013201	CCGA	2	8	107954	107961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013201	CCGG	2	8	113707	113714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013201	AGAC	2	8	115224	115231	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013201	AATC	2	8	119170	119177	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013201	CTAG	2	8	119879	119886	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013201	GTCG	2	8	123385	123392	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013201	CAGC	2	8	123729	123736	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013201	GACT	2	8	123828	123835	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013201	ATCG	2	8	126026	126033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013201	AATA	2	8	127200	127207	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013201	ACGA	2	8	127237	127244	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013201	CGAT	2	8	127347	127354	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013201	CCGA	2	8	127370	127377	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013201	TCGC	2	8	133781	133788	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013201	CGAC	2	8	135074	135081	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013201	GACG	2	8	135291	135298	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013201	CGAG	2	8	135299	135306	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013201	ACCG	2	8	137240	137247	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013201	CGGT	2	8	137312	137319	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013201	AGGC	2	8	137417	137424	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013201	CCGA	2	8	145941	145948	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013201	TGAC	2	8	154414	154421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013201	TCAG	2	8	154867	154874	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013201	TCTG	2	8	155255	155262	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_013201	GTTG	2	8	158103	158110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013201	TTCG	2	8	158131	158138	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013201	GTTC	2	8	161267	161274	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013201	GTGA	2	8	165749	165756	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013201	TTCG	2	8	165870	165877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013201	ATCT	2	8	166000	166007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013201	CGGT	2	8	168210	168217	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013201	GTCC	2	8	168381	168388	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013201	GCGT	2	8	169505	169512	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013201	TGAC	2	8	169624	169631	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013201	ACGG	2	8	181798	181805	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013201	GCCA	2	8	181888	181895	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013201	GACG	2	8	182185	182192	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013201	GCTG	2	8	182208	182215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013201	CCAG	2	8	182232	182239	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013201	GTCG	2	8	182286	182293	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013201	GACC	2	8	182436	182443	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013201	CTGG	2	8	182830	182837	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013201	GAGT	2	8	187360	187367	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013201	ATGG	2	8	187439	187446	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013201	CCAG	2	8	187556	187563	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013201	ACGG	2	8	187626	187633	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013201	TAGT	2	8	189968	189975	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013201	GGAG	2	8	191915	191922	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013201	CGAT	2	8	194029	194036	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013201	GTAG	2	8	194827	194834	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013201	CGGC	2	8	194851	194858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013201	TCGG	2	8	198351	198358	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013201	CGGT	2	8	198393	198400	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013201	CCGT	2	8	202492	202499	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013201	GGTC	2	8	202531	202538	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013201	AACG	2	8	202750	202757	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013201	CGGC	2	8	208234	208241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013201	ACGA	2	8	209083	209090	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013201	GAAC	2	8	209202	209209	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_013201	GCGA	2	8	209322	209329	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013201	GCCG	2	8	212780	212787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013201	ACAT	2	8	212809	212816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013201	CGGC	2	8	216993	217000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013201	GTCG	2	8	217004	217011	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_013201	CGTG	2	8	218427	218434	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013201	GGTC	2	8	220597	220604	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_013201	ACTC	2	8	221822	221829	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.