MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013158	C	6	6	2341	2346	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_013158	G	6	6	31564	31569	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013158	T	6	6	33821	33826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013158	C	6	6	40974	40979	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_013158	A	6	6	47214	47219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013158	G	6	6	49819	49824	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013158	T	6	6	50036	50041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013158	T	6	6	52744	52749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013158	C	6	6	66914	66919	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10	NC_013158	T	6	6	84815	84820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013158	T	6	6	93097	93102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013158	G	6	6	103364	103369	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013158	G	6	6	127789	127794	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013158	A	6	6	138321	138326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013158	C	6	6	144541	144546	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_013158	C	6	6	148955	148960	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_013158	C	6	6	168762	168767	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_013158	T	6	6	198526	198531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013158	G	6	6	235036	235041	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013158	A	6	6	247895	247900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013158	A	6	6	285998	286003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013158	T	6	6	303617	303622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013158	C	6	6	316532	316537	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_013158	T	6	6	330302	330307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013158	C	6	6	339829	339834	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_013158	T	6	6	349191	349196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013158	G	6	6	363184	363189	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013158	A	6	6	371538	371543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013158	G	6	6	373351	373356	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013158	G	6	6	378890	378895	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013158	G	7	7	393603	393609	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013158	G	6	6	409246	409251	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013158	A	6	6	417146	417151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013158	G	6	6	422740	422745	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013158	G	6	6	425049	425054	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013158	G	6	6	428030	428035	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013158	C	6	6	464936	464941	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_013158	A	6	6	536653	536658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013158	G	6	6	538188	538193	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013158	G	6	6	560312	560317	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013158	C	6	6	560469	560474	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_013158	G	6	6	561475	561480	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013158	G	6	6	595729	595734	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013158	T	6	6	607051	607056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013158	T	6	6	625607	625612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013158	A	6	6	651835	651840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013158	A	6	6	654911	654916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013158	T	6	6	663680	663685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013158	C	6	6	720797	720802	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_013158	A	6	6	726780	726785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013158	C	6	6	739274	739279	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_013158	A	6	6	755694	755699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013158	C	6	6	775587	775592	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_013158	G	6	6	778123	778128	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013158	C	6	6	783775	783780	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_013158	G	6	6	841702	841707	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013158	G	6	6	844710	844715	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013158	A	6	6	862574	862579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013158	C	6	6	875671	875676	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_013158	C	6	6	881403	881408	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_013158	T	6	6	903490	903495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013158	T	6	6	920909	920914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013158	T	6	6	930439	930444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013158	T	6	6	943213	943218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013158	T	6	6	956371	956376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013158	A	6	6	991145	991150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013158	C	6	6	994688	994693	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_013158	G	6	6	1009559	1009564	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013158	T	6	6	1045244	1045249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013158	A	6	6	1045748	1045753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013158	G	6	6	1076231	1076236	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013158	G	6	6	1126257	1126262	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013158	T	6	6	1128114	1128119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013158	T	6	6	1151602	1151607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013158	A	6	6	1170823	1170828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013158	T	6	6	1178699	1178704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013158	A	6	6	1197010	1197015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013158	A	6	6	1199026	1199031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013158	C	6	6	1202409	1202414	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_013158	G	6	6	1202949	1202954	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013158	G	6	6	1203674	1203679	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013158	G	6	6	1210555	1210560	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013158	A	6	6	1248634	1248639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013158	C	6	6	1255061	1255066	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NC_013158	G	7	7	1262163	1262169	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013158	G	6	6	1262504	1262509	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013158	G	6	6	1269284	1269289	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013158	C	6	6	1270163	1270168	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_013158	G	6	6	1270437	1270442	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013158	G	6	6	1270453	1270458	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013158	G	7	7	1270494	1270500	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013158	G	6	6	1279748	1279753	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013158	A	6	6	1279780	1279785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013158	G	6	6	1282749	1282754	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013158	G	6	6	1289390	1289395	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013158	C	6	6	1303592	1303597	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
97	NC_013158	T	6	6	1317139	1317144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013158	G	6	6	1325408	1325413	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013158	A	6	6	1332468	1332473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013158	C	6	6	1376407	1376412	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_013158	C	6	6	1384046	1384051	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_013158	C	6	6	1391060	1391065	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_013158	G	6	6	1419204	1419209	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013158	C	6	6	1454738	1454743	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_013158	C	6	6	1457699	1457704	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
106	NC_013158	C	6	6	1457712	1457717	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_013158	A	6	6	1473960	1473965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013158	C	6	6	1499747	1499752	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_013158	G	6	6	1530746	1530751	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013158	G	6	6	1563102	1563107	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013158	C	6	6	1566867	1566872	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_013158	G	6	6	1574455	1574460	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013158	C	7	7	1583811	1583817	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_013158	G	6	6	1595759	1595764	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013158	G	6	6	1596337	1596342	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013158	C	6	6	1613806	1613811	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
117	NC_013158	T	8	8	1614489	1614496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013158	C	6	6	1614694	1614699	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_013158	C	6	6	1614769	1614774	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
120	NC_013158	T	6	6	1645572	1645577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013158	G	6	6	1658812	1658817	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013158	T	6	6	1659286	1659291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013158	C	6	6	1664792	1664797	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_013158	G	6	6	1664803	1664808	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013158	G	6	6	1688481	1688486	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013158	A	6	6	1726401	1726406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013158	C	6	6	1727384	1727389	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
128	NC_013158	C	6	6	1732591	1732596	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
129	NC_013158	A	6	6	1804625	1804630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013158	C	6	6	1806435	1806440	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
131	NC_013158	T	6	6	1820383	1820388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013158	A	6	6	1820805	1820810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013158	A	7	7	1843506	1843512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013158	C	6	6	1858660	1858665	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135	NC_013158	C	6	6	1862065	1862070	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
136	NC_013158	C	6	6	1867409	1867414	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
137	NC_013158	G	6	6	1867589	1867594	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013158	C	6	6	1890355	1890360	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_013158	C	6	6	1892461	1892466	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
140	NC_013158	T	6	6	1908192	1908197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013158	C	6	6	1910773	1910778	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
142	NC_013158	C	6	6	1914275	1914280	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
143	NC_013158	G	6	6	1918838	1918843	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013158	A	6	6	1949192	1949197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013158	A	6	6	1952873	1952878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013158	T	6	6	1952950	1952955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013158	C	6	6	1956724	1956729	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
148	NC_013158	C	10	10	1956757	1956766	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
149	NC_013158	G	6	6	1959820	1959825	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013158	G	6	6	1996274	1996279	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.