MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 7318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013158	TCG	2	6	1545921	1545926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_013158	CTG	2	6	1545934	1545939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_013158	GCC	2	6	1546009	1546014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3504	NC_013158	GGT	2	6	1546030	1546035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_013158	ATG	2	6	1546050	1546055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_013158	GCC	2	6	1546087	1546092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3507	NC_013158	GGA	2	6	1546179	1546184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_013158	TGT	2	6	1546311	1546316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_013158	ACG	2	6	1549045	1549050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_013158	AC	3	6	1549058	1549063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_013158	CGC	2	6	1549091	1549096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_013158	CGA	2	6	1549109	1549114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_013158	CGGG	2	8	1549139	1549146	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3514	NC_013158	GA	3	6	1549157	1549162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_013158	CGT	2	6	1549210	1549215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_013158	GCC	2	6	1549258	1549263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_013158	CGA	2	6	1549304	1549309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_013158	GTGA	2	8	1551561	1551568	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_013158	TGGA	2	8	1551592	1551599	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_013158	GAG	2	6	1551605	1551610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_013158	ATA	2	6	1552891	1552896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_013158	AC	3	6	1552959	1552964	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_013158	GGCT	2	8	1557045	1557052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3524	NC_013158	GA	3	6	1557137	1557142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_013158	CGT	2	6	1557200	1557205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_013158	CGG	2	6	1558179	1558184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_013158	TAG	2	6	1558225	1558230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_013158	CAG	2	6	1558587	1558592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_013158	TAG	2	6	1559904	1559909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_013158	TCG	2	6	1559976	1559981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_013158	CCGC	2	8	1561638	1561645	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3532	NC_013158	GGA	2	6	1561682	1561687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_013158	CGG	2	6	1561699	1561704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_013158	GGC	2	6	1561831	1561836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_013158	GA	3	6	1561871	1561876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_013158	TCA	2	6	1561889	1561894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_013158	G	6	6	1563102	1563107	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_013158	CGTC	2	8	1563115	1563122	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3539	NC_013158	CTG	2	6	1564454	1564459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_013158	AAAT	2	8	1564502	1564509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_013158	ATG	2	6	1564541	1564546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_013158	GC	3	6	1564789	1564794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_013158	CAG	2	6	1564795	1564800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_013158	C	6	6	1566867	1566872	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3545	NC_013158	CGG	2	6	1566880	1566885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_013158	AGCC	2	8	1566900	1566907	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_013158	CGG	2	6	1566920	1566925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_013158	TATG	2	8	1566971	1566978	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_013158	GGC	2	6	1567005	1567010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_013158	TAT	2	6	1567050	1567055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_013158	CT	3	6	1567081	1567086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3552	NC_013158	GAC	2	6	1568211	1568216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_013158	ACG	2	6	1568251	1568256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_013158	AC	3	6	1568267	1568272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3555	NC_013158	ACT	2	6	1573163	1573168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_013158	TGA	2	6	1573197	1573202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_013158	TA	3	6	1574261	1574266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_013158	GAC	2	6	1574319	1574324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_013158	TCGAC	2	10	1574336	1574345	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3560	NC_013158	CGT	2	6	1574402	1574407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_013158	CTG	2	6	1574445	1574450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_013158	G	6	6	1574455	1574460	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_013158	CACGTC	2	12	1574466	1574477	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3564	NC_013158	GAG	2	6	1574481	1574486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_013158	GAG	2	6	1574493	1574498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_013158	GCC	2	6	1574511	1574516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3567	NC_013158	CGG	3	9	1574534	1574542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_013158	CTT	2	6	1574579	1574584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_013158	CGG	2	6	1574651	1574656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_013158	GC	3	6	1574713	1574718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3571	NC_013158	CG	3	6	1574726	1574731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_013158	TCC	2	6	1574746	1574751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_013158	ACC	2	6	1574761	1574766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_013158	TCA	2	6	1574833	1574838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3576	NC_013158	GAA	2	6	1574930	1574935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_013158	CCG	3	9	1574942	1574950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_013158	GA	3	6	1575091	1575096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_013158	TG	3	6	1576325	1576330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_013158	GCTC	2	8	1576346	1576353	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3582	NC_013158	ATTT	2	8	1579228	1579235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_013158	TTCGG	2	10	1579240	1579249	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3584	NC_013158	GTC	2	6	1579253	1579258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_013158	CGT	2	6	1579300	1579305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_013158	TGCG	2	8	1579581	1579588	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3587	NC_013158	GTTC	2	8	1579640	1579647	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3588	NC_013158	GCG	2	6	1583781	1583786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_013158	C	7	7	1583811	1583817	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3590	NC_013158	AT	3	6	1583918	1583923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_013158	AGT	2	6	1583940	1583945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_013158	TGCG	2	8	1584014	1584021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3593	NC_013158	AAC	3	9	1584062	1584070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_013158	TCCG	2	8	1584099	1584106	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3595	NC_013158	TGC	2	6	1585542	1585547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_013158	GAA	2	6	1585550	1585555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_013158	CGGG	2	8	1585598	1585605	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3598	NC_013158	GAG	2	6	1587900	1587905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_013158	TCGA	2	8	1587918	1587925	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3600	NC_013158	TGTC	2	8	1587962	1587969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3601	NC_013158	TCGA	2	8	1588019	1588026	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3602	NC_013158	GAC	2	6	1588052	1588057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_013158	TCAGT	2	10	1588060	1588069	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3604	NC_013158	CCG	2	6	1589448	1589453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_013158	GTG	2	6	1589462	1589467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_013158	GGGA	2	8	1589529	1589536	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_013158	AT	3	6	1589846	1589851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_013158	GAA	2	6	1589886	1589891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_013158	AT	3	6	1589925	1589930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_013158	TATAA	2	10	1589932	1589941	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_013158	CGA	2	6	1592336	1592341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_013158	CTT	2	6	1595337	1595342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_013158	GGTG	2	8	1595452	1595459	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_013158	GAT	3	9	1595499	1595507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_013158	GGAG	2	8	1595593	1595600	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_013158	CA	3	6	1595654	1595659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3617	NC_013158	G	6	6	1595759	1595764	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_013158	AG	3	6	1595809	1595814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_013158	TC	3	6	1595847	1595852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_013158	TAG	2	6	1595874	1595879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_013158	TCCT	2	8	1595995	1596002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_013158	ATC	2	6	1596097	1596102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_013158	TAT	2	6	1596160	1596165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_013158	GGT	2	6	1596302	1596307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_013158	G	6	6	1596337	1596342	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_013158	CTCG	2	8	1596524	1596531	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3627	NC_013158	TTC	2	6	1598400	1598405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_013158	CCGAG	2	10	1602475	1602484	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3629	NC_013158	CGAA	2	8	1602556	1602563	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3630	NC_013158	GA	3	6	1602591	1602596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_013158	GCAG	2	8	1602602	1602609	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3632	NC_013158	CGGC	2	8	1602634	1602641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3883	NC_013158	TCT	2	6	1668098	1668103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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