MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 7318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013158	GCT	2	6	1104487	1104492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_013158	CGT	2	6	1104538	1104543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_013158	CGAG	2	8	1104571	1104578	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2504	NC_013158	CCAT	2	8	1104591	1104598	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2505	NC_013158	ACA	2	6	1104616	1104621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_013158	GAC	2	6	1104702	1104707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_013158	AAC	2	6	1104793	1104798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_013158	GTC	2	6	1104834	1104839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_013158	AAC	2	6	1104859	1104864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_013158	GTTC	2	8	1104919	1104926	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2511	NC_013158	CGA	2	6	1104983	1104988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_013158	ACC	2	6	1105034	1105039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2513	NC_013158	TCGA	2	8	1105062	1105069	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2514	NC_013158	GC	4	8	1105082	1105089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2515	NC_013158	TTTC	2	8	1105133	1105140	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2516	NC_013158	CTG	2	6	1105143	1105148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_013158	GACG	2	8	1106349	1106356	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2518	NC_013158	GA	3	6	1106421	1106426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_013158	CGT	2	6	1108759	1108764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_013158	CGAT	2	8	1108816	1108823	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2521	NC_013158	ACGA	2	8	1108878	1108885	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2522	NC_013158	AAC	2	6	1108887	1108892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_013158	GGA	2	6	1108911	1108916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_013158	ACA	2	6	1108919	1108924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_013158	GCAA	2	8	1108936	1108943	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2526	NC_013158	CGA	2	6	1109594	1109599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_013158	TCG	2	6	1109689	1109694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_013158	GGTC	2	8	1109695	1109702	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2529	NC_013158	TCGCG	2	10	1109769	1109778	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2530	NC_013158	CGA	2	6	1109855	1109860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_013158	ACC	2	6	1110697	1110702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2532	NC_013158	GGA	2	6	1110703	1110708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_013158	AT	3	6	1112653	1112658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_013158	GTC	2	6	1113711	1113716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_013158	CAG	2	6	1114512	1114517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_013158	CGC	2	6	1114521	1114526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2537	NC_013158	CTTCGA	2	12	1114559	1114570	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_013158	CTC	2	6	1114619	1114624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2539	NC_013158	ACCG	2	8	1114634	1114641	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2540	NC_013158	TCG	2	6	1114651	1114656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_013158	CGG	2	6	1114714	1114719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_013158	TGAA	2	8	1114765	1114772	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_013158	AAC	2	6	1114847	1114852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_013158	CTT	2	6	1116924	1116929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_013158	CGT	2	6	1116931	1116936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_013158	CGC	2	6	1116965	1116970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2547	NC_013158	ACCGG	2	10	1117328	1117337	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2548	NC_013158	GGGA	2	8	1117350	1117357	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_013158	GATC	2	8	1117376	1117383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2550	NC_013158	GTC	2	6	1119086	1119091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_013158	GCCA	2	8	1119097	1119104	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2552	NC_013158	GCCA	2	8	1119127	1119134	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2553	NC_013158	CGG	2	6	1119158	1119163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_013158	CGA	2	6	1119200	1119205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_013158	AGG	2	6	1119978	1119983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_013158	ACG	2	6	1120239	1120244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_013158	TTG	2	6	1120262	1120267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_013158	TCG	2	6	1120271	1120276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_013158	ACCC	2	8	1120324	1120331	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2560	NC_013158	CGG	2	6	1126233	1126238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_013158	G	6	6	1126257	1126262	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_013158	GC	3	6	1126281	1126286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2563	NC_013158	CGGC	2	8	1128081	1128088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2564	NC_013158	T	6	6	1128114	1128119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_013158	GTC	2	6	1128127	1128132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_013158	AT	3	6	1131378	1131383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_013158	CG	3	6	1131402	1131407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2568	NC_013158	CGGC	2	8	1132157	1132164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2569	NC_013158	GCC	2	6	1132185	1132190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2570	NC_013158	CGA	2	6	1132218	1132223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_013158	GGGCC	2	10	1133537	1133546	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2572	NC_013158	GAC	2	6	1134361	1134366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_013158	TTC	2	6	1135389	1135394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_013158	GA	3	6	1135421	1135426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_013158	CG	3	6	1136679	1136684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2576	NC_013158	CCG	2	6	1138533	1138538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2577	NC_013158	CGGG	2	8	1138546	1138553	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2578	NC_013158	GGGC	2	8	1138873	1138880	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2579	NC_013158	GCT	2	6	1141187	1141192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_013158	CGAC	2	8	1144077	1144084	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2581	NC_013158	GCTC	2	8	1144404	1144411	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2582	NC_013158	TCGA	2	8	1151570	1151577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2583	NC_013158	T	6	6	1151602	1151607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_013158	TAA	2	6	1152424	1152429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_013158	CA	3	6	1152515	1152520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2586	NC_013158	TCG	2	6	1153330	1153335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2587	NC_013158	CTC	2	6	1153367	1153372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2588	NC_013158	CTT	2	6	1155146	1155151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_013158	TGAC	2	8	1155187	1155194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2590	NC_013158	ACG	2	6	1155226	1155231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2592	NC_013158	CAG	2	6	1156517	1156522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_013158	TTC	2	6	1156527	1156532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_013158	TCG	2	6	1156987	1156992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_013158	GCGG	2	8	1157025	1157032	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2596	NC_013158	CACT	2	8	1157061	1157068	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2597	NC_013158	GCG	2	6	1157083	1157088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_013158	ACG	2	6	1157822	1157827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_013158	CGA	2	6	1159766	1159771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_013158	GAC	2	6	1160765	1160770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2602	NC_013158	GCG	2	6	1160783	1160788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_013158	CGT	2	6	1161794	1161799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_013158	TTA	2	6	1161847	1161852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2606	NC_013158	GC	3	6	1161881	1161886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2607	NC_013158	ATG	2	6	1161937	1161942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_013158	TGG	2	6	1161951	1161956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_013158	TC	3	6	1161989	1161994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2610	NC_013158	GC	3	6	1162050	1162055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2611	NC_013158	ATAC	2	8	1163886	1163893	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2612	NC_013158	CCT	2	6	1163925	1163930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2613	NC_013158	CCG	2	6	1163962	1163967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2614	NC_013158	GACA	2	8	1163986	1163993	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2616	NC_013158	CAG	2	6	1167144	1167149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_013158	GA	3	6	1167164	1167169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_013158	ATT	2	6	1167229	1167234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2620	NC_013158	TC	3	6	1167823	1167828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2621	NC_013158	CCG	2	6	1167832	1167837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2622	NC_013158	ACGA	2	8	1169135	1169142	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2623	NC_013158	TCGA	2	8	1169159	1169166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2624	NC_013158	GGA	2	6	1169650	1169655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2626	NC_013158	A	6	6	1170823	1170828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_013158	GCC	2	6	1170839	1170844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2629	NC_013158	GACG	2	8	1171141	1171148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2630	NC_013158	GAT	2	6	1172349	1172354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_013158	AAG	2	6	1172372	1172377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_013158	CACC	2	8	1172390	1172397	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2633	NC_013158	ATC	2	6	1172468	1172473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2635	NC_013158	GA	3	6	1172516	1172521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_013158	CCT	2	6	1173859	1173864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2637	NC_013158	ACC	2	6	1173931	1173936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2638	NC_013158	AAG	2	6	1177173	1177178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2639	NC_013158	TTC	2	6	1177180	1177185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2642	NC_013158	CGGG	2	8	1177439	1177446	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2643	NC_013158	CCA	2	6	1178020	1178025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2651	NC_013158	GTCG	2	8	1179977	1179984	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2652	NC_013158	CAT	2	6	1182924	1182929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2654	NC_013158	TTC	2	6	1182965	1182970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2661	NC_013158	CGCA	2	8	1185728	1185735	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2662	NC_013158	TTA	2	6	1185783	1185788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2667	NC_013158	CGAA	2	8	1189481	1189488	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2675	NC_013158	CCAC	2	8	1192472	1192479	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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2756	NC_013158	TAG	2	6	1226883	1226888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2761	NC_013158	GTGG	2	8	1228888	1228895	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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2763	NC_013158	ATTC	2	8	1229501	1229508	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2764	NC_013158	GA	3	6	1230708	1230713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2765	NC_013158	CG	3	6	1231938	1231943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2766	NC_013158	CGG	2	6	1231963	1231968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2767	NC_013158	TCGT	2	8	1232038	1232045	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2891	NC_013158	TA	3	6	1270606	1270611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2892	NC_013158	CTGG	2	8	1270674	1270681	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2893	NC_013158	ACA	2	6	1270735	1270740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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