MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 7318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013158	GAA	2	6	232501	232506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_013158	TAT	2	6	233541	233546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_013158	AAG	2	6	234970	234975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_013158	AGT	2	6	235000	235005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_013158	G	6	6	235036	235041	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
506	NC_013158	GTA	2	6	235116	235121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013158	ACTC	2	8	235164	235171	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_013158	GGT	2	6	235187	235192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013158	TGCG	2	8	236185	236192	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
510	NC_013158	GAG	2	6	236231	236236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_013158	CGCTT	2	10	236248	236257	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
512	NC_013158	GAT	2	6	238114	238119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_013158	CAT	2	6	238413	238418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_013158	AAAAT	2	10	238427	238436	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_013158	GCTG	2	8	238492	238499	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
516	NC_013158	TC	3	6	238519	238524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_013158	CCT	2	6	238608	238613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_013158	TACGA	2	10	239143	239152	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
519	NC_013158	TAA	2	6	239153	239158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_013158	GGA	2	6	239166	239171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_013158	CCG	2	6	239204	239209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_013158	TCGG	2	8	240036	240043	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
523	NC_013158	CGG	2	6	241246	241251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_013158	CCG	2	6	241272	241277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_013158	CGC	2	6	241307	241312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_013158	CAG	2	6	241313	241318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_013158	CT	3	6	242444	242449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
528	NC_013158	TCCG	2	8	242472	242479	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
529	NC_013158	CAGA	2	8	242536	242543	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
530	NC_013158	GGTGG	2	10	242775	242784	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
531	NC_013158	TCG	2	6	243450	243455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_013158	CAC	2	6	243530	243535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_013158	ACG	2	6	245325	245330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_013158	GT	3	6	245344	245349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_013158	GGTC	2	8	245467	245474	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
536	NC_013158	CGT	2	6	245617	245622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_013158	GGA	2	6	247390	247395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_013158	GACC	2	8	247746	247753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
539	NC_013158	GCG	2	6	247820	247825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_013158	A	6	6	247895	247900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_013158	AT	3	6	247906	247911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_013158	CCT	2	6	247919	247924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_013158	ATT	2	6	247991	247996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_013158	GGC	2	6	251392	251397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_013158	CGC	2	6	253387	253392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_013158	CGA	2	6	253409	253414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_013158	GCT	2	6	253425	253430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_013158	TGGT	2	8	254287	254294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_013158	ACA	2	6	254399	254404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_013158	GGC	2	6	254421	254426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_013158	CCG	2	6	254476	254481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_013158	AG	3	6	254603	254608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013158	ACG	2	6	254615	254620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_013158	CGG	2	6	254644	254649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_013158	GAT	2	6	257450	257455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_013158	GGCC	2	8	257478	257485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_013158	CGG	2	6	257518	257523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_013158	CGC	2	6	257555	257560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_013158	TCC	2	6	257572	257577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_013158	CGG	2	6	257601	257606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_013158	AGCGA	2	10	257645	257654	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
562	NC_013158	TCC	2	6	257779	257784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_013158	CTC	2	6	257786	257791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_013158	TCG	2	6	257799	257804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_013158	ACGG	2	8	257807	257814	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
566	NC_013158	CGC	2	6	257851	257856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_013158	CGT	2	6	257860	257865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_013158	GT	3	6	257864	257869	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013158	GACG	2	8	257893	257900	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
570	NC_013158	CGG	2	6	257901	257906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_013158	GAA	2	6	257990	257995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013158	TAT	2	6	258349	258354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013158	CGC	2	6	258964	258969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_013158	AC	3	6	259837	259842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
575	NC_013158	CAC	2	6	259879	259884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_013158	TGT	2	6	260478	260483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_013158	TC	4	8	260667	260674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
578	NC_013158	GCG	2	6	261495	261500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_013158	CG	3	6	261518	261523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
580	NC_013158	ACG	2	6	261524	261529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_013158	CCG	2	6	261543	261548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_013158	ATA	2	6	263788	263793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_013158	CAG	2	6	264889	264894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_013158	CTGT	2	8	264899	264906	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
585	NC_013158	AC	3	6	266637	266642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
586	NC_013158	CA	3	6	266679	266684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
587	NC_013158	GGA	2	6	266719	266724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013158	CGG	2	6	266789	266794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_013158	GCGTT	2	10	267997	268006	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
590	NC_013158	GGCC	2	8	268024	268031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_013158	CGG	2	6	269410	269415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_013158	CGG	2	6	270171	270176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_013158	CGC	2	6	273570	273575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_013158	ACC	2	6	274481	274486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_013158	CCG	2	6	274506	274511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_013158	TCA	2	6	274568	274573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_013158	CG	4	8	277032	277039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
598	NC_013158	TCGGA	2	10	277191	277200	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
599	NC_013158	CGC	2	6	277325	277330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_013158	ACG	2	6	277342	277347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_013158	GGC	2	6	277458	277463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_013158	CGT	2	6	278270	278275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_013158	CA	3	6	278276	278281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
604	NC_013158	CGG	2	6	278993	278998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_013158	CCG	2	6	279020	279025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_013158	AAC	2	6	279045	279050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_013158	CCGT	2	8	279631	279638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
608	NC_013158	CGT	2	6	279651	279656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_013158	CGC	2	6	279661	279666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_013158	TCCCG	2	10	279680	279689	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
611	NC_013158	GAC	2	6	279705	279710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_013158	AT	3	6	279761	279766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013158	TAA	2	6	279795	279800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_013158	A	6	6	285998	286003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_013158	ACG	2	6	286130	286135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_013158	CCA	2	6	286159	286164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_013158	GAA	2	6	288051	288056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_013158	AGA	2	6	288485	288490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_013158	ACG	2	6	288526	288531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_013158	CGG	3	9	289435	289443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_013158	GCC	2	6	289473	289478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_013158	CGG	2	6	289501	289506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_013158	GAA	2	6	292711	292716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_013158	ACGA	2	8	292757	292764	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_013158	ATA	2	6	293514	293519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_013158	GCC	2	6	293568	293573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_013158	GTAC	2	8	293627	293634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
628	NC_013158	CGAGT	2	10	295579	295588	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
629	NC_013158	CGTCTT	2	12	295589	295600	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_013158	TCGA	2	8	295655	295662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
631	NC_013158	CGA	3	9	295660	295668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_013158	GAC	2	6	295702	295707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_013158	CG	3	6	296613	296618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_013158	TCG	2	6	296662	296667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_013158	GAC	2	6	296692	296697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_013158	TGG	2	6	297821	297826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_013158	T	6	6	303617	303622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_013158	CGA	2	6	304454	304459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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642	NC_013158	CGAT	2	8	309466	309473	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
643	NC_013158	ATTT	2	8	309492	309499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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646	NC_013158	CCG	2	6	312669	312674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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650	NC_013158	GC	3	6	314288	314293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
651	NC_013158	TCA	2	6	314469	314474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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