MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 7318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_013158	CAT	2	6	2707041	2707046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_013158	TA	3	6	2707064	2707069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_013158	TTC	2	6	2707867	2707872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6504	NC_013158	TGGA	2	8	2707919	2707926	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_013158	AGT	2	6	2707957	2707962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_013158	GCC	2	6	2710452	2710457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6507	NC_013158	TCC	2	6	2710804	2710809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6508	NC_013158	TCG	2	6	2710816	2710821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_013158	CGA	2	6	2710825	2710830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_013158	TCG	2	6	2710833	2710838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_013158	CCCA	2	8	2710841	2710848	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6512	NC_013158	TAT	2	6	2713372	2713377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_013158	ATA	2	6	2713385	2713390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_013158	GCAT	2	8	2713396	2713403	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6515	NC_013158	CTC	2	6	2715453	2715458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6516	NC_013158	TG	3	6	2715465	2715470	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_013158	TCGGG	2	10	2715508	2715517	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6518	NC_013158	CCGG	2	8	2716058	2716065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6519	NC_013158	CGA	2	6	2718484	2718489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_013158	TCG	2	6	2718543	2718548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_013158	TCAC	2	8	2718562	2718569	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6522	NC_013158	AAG	2	6	2718598	2718603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_013158	ATT	2	6	2718619	2718624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_013158	GTG	2	6	2718663	2718668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_013158	GGC	2	6	2718669	2718674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_013158	CTG	2	6	2724828	2724833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_013158	ATCG	2	8	2724896	2724903	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6528	NC_013158	GATC	2	8	2724913	2724920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6529	NC_013158	GATG	2	8	2724944	2724951	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_013158	AGA	2	6	2725220	2725225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_013158	CCTG	2	8	2725226	2725233	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6532	NC_013158	ACA	2	6	2725260	2725265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_013158	ACG	3	9	2725385	2725393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_013158	GCT	2	6	2725423	2725428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_013158	TAT	2	6	2725437	2725442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_013158	GAC	2	6	2725459	2725464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_013158	CTC	2	6	2725465	2725470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6538	NC_013158	GAA	2	6	2725510	2725515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_013158	CAT	2	6	2725993	2725998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_013158	TC	3	6	2726698	2726703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6541	NC_013158	AGC	2	6	2726729	2726734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_013158	AGG	2	6	2726762	2726767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_013158	AAC	2	6	2726773	2726778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_013158	A	10	10	2726807	2726816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_013158	ACG	2	6	2726878	2726883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_013158	TTG	2	6	2726902	2726907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_013158	GTC	2	6	2726935	2726940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_013158	CGG	2	6	2727028	2727033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_013158	CGT	2	6	2727123	2727128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_013158	TGAG	2	8	2727155	2727162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_013158	TGA	2	6	2727176	2727181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_013158	CCAG	2	8	2727223	2727230	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6553	NC_013158	TCG	3	9	2727258	2727266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_013158	CTG	2	6	2727269	2727274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_013158	CG	3	6	2727332	2727337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6556	NC_013158	CGA	2	6	2727397	2727402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_013158	GTC	2	6	2727475	2727480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_013158	GCAA	2	8	2727519	2727526	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6559	NC_013158	AGA	2	6	2727549	2727554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_013158	TGT	2	6	2727706	2727711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_013158	GAG	2	6	2727757	2727762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_013158	GAG	2	6	2727815	2727820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_013158	CGG	2	6	2727833	2727838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6564	NC_013158	TG	3	6	2727854	2727859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_013158	GCCAGC	2	12	2727940	2727951	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6566	NC_013158	GAG	2	6	2727972	2727977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_013158	ACG	2	6	2728008	2728013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_013158	GGA	2	6	2728014	2728019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_013158	ACG	2	6	2728040	2728045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_013158	ACG	3	9	2728059	2728067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6571	NC_013158	CT	4	8	2728082	2728089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6572	NC_013158	AAC	2	6	2728202	2728207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6573	NC_013158	GC	3	6	2728218	2728223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6574	NC_013158	CGG	2	6	2731870	2731875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_013158	GTT	2	6	2731889	2731894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_013158	CGT	2	6	2731938	2731943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_013158	ACG	2	6	2731972	2731977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6578	NC_013158	GAG	2	6	2732913	2732918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_013158	GGC	3	9	2734400	2734408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6580	NC_013158	GAC	2	6	2734412	2734417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_013158	CGT	2	6	2734707	2734712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_013158	GCCGG	2	10	2734714	2734723	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6583	NC_013158	AT	3	6	2734726	2734731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_013158	ACT	2	6	2738783	2738788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_013158	CCA	2	6	2738822	2738827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6586	NC_013158	TGC	2	6	2739337	2739342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_013158	CGA	2	6	2739380	2739385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_013158	ACT	2	6	2739447	2739452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_013158	GTG	2	6	2739495	2739500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_013158	GGGAA	2	10	2739509	2739518	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_013158	GCT	2	6	2740133	2740138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_013158	GAA	2	6	2740168	2740173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_013158	GACT	2	8	2740258	2740265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6594	NC_013158	ATGA	2	8	2740277	2740284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_013158	ACA	2	6	2740292	2740297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_013158	TCG	2	6	2740328	2740333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_013158	GTC	2	6	2740370	2740375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_013158	CGG	2	6	2740497	2740502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6599	NC_013158	GAC	2	6	2740514	2740519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6600	NC_013158	AGCAG	2	10	2740520	2740529	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6601	NC_013158	CAG	2	6	2740541	2740546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_013158	CTC	2	6	2740591	2740596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6603	NC_013158	CAA	2	6	2740600	2740605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6604	NC_013158	CTC	2	6	2740636	2740641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6605	NC_013158	CAC	2	6	2743538	2743543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6606	NC_013158	GCC	2	6	2744206	2744211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6607	NC_013158	CGA	2	6	2744910	2744915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6608	NC_013158	CAGC	2	8	2744922	2744929	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6609	NC_013158	CGC	2	6	2744943	2744948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6610	NC_013158	CGG	2	6	2744949	2744954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_013158	TCG	2	6	2745693	2745698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6612	NC_013158	GC	3	6	2745986	2745991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6613	NC_013158	TGGT	2	8	2747867	2747874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_013158	TC	3	6	2747887	2747892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6615	NC_013158	TA	3	6	2747990	2747995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_013158	ATAG	2	8	2748086	2748093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_013158	TTG	2	6	2750314	2750319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_013158	GTC	2	6	2750355	2750360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_013158	CCG	2	6	2750364	2750369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6620	NC_013158	ACC	2	6	2751211	2751216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6621	NC_013158	TTC	2	6	2752298	2752303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_013158	AGC	2	6	2752315	2752320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6623	NC_013158	GCC	2	6	2753393	2753398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6624	NC_013158	CGT	2	6	2753429	2753434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6625	NC_013158	GGGC	2	8	2753443	2753450	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6626	NC_013158	CTG	2	6	2756182	2756187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_013158	GCC	2	6	2756230	2756235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6629	NC_013158	CCG	2	6	2758657	2758662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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