MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorhabdus utahensis DSM 12940 chromosome

Total Repeats: 7318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013158	CCGG	2	8	2499439	2499446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6002	NC_013158	TA	3	6	2500029	2500034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_013158	CGG	2	6	2500058	2500063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_013158	TTTCG	2	10	2500511	2500520	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6005	NC_013158	CGTA	2	8	2500861	2500868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6006	NC_013158	AGC	2	6	2500950	2500955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_013158	AAC	2	6	2500985	2500990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_013158	GTG	2	6	2501552	2501557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_013158	TTCGC	2	10	2501651	2501660	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6010	NC_013158	CGA	2	6	2501705	2501710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_013158	AGC	2	6	2501789	2501794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_013158	CTC	2	6	2503275	2503280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_013158	GTGA	2	8	2503320	2503327	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_013158	CG	3	6	2503348	2503353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_013158	TGGA	2	8	2503376	2503383	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_013158	CCT	2	6	2503444	2503449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_013158	CTT	2	6	2503470	2503475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_013158	CCG	2	6	2503615	2503620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_013158	CTTC	2	8	2503638	2503645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_013158	CAAATC	2	12	2503689	2503700	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_013158	TGC	2	6	2503707	2503712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_013158	GCA	2	6	2503727	2503732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_013158	TCGCT	2	10	2503772	2503781	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6024	NC_013158	GC	3	6	2503782	2503787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6025	NC_013158	TCG	2	6	2503820	2503825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_013158	GCGA	2	8	2503837	2503844	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6027	NC_013158	GAT	2	6	2503897	2503902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_013158	ACC	2	6	2503915	2503920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_013158	TCGA	2	8	2503968	2503975	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6030	NC_013158	CGA	2	6	2505428	2505433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_013158	TC	3	6	2505452	2505457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_013158	TTC	2	6	2505514	2505519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_013158	CGACC	2	10	2508630	2508639	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6034	NC_013158	G	6	6	2508667	2508672	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_013158	CGG	2	6	2508722	2508727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_013158	GGA	2	6	2510191	2510196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_013158	CGTT	2	8	2510212	2510219	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6038	NC_013158	GAA	2	6	2510240	2510245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_013158	CGG	2	6	2510286	2510291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_013158	CCGG	2	8	2510319	2510326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6041	NC_013158	GGGAC	2	10	2512951	2512960	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6042	NC_013158	CGG	2	6	2512969	2512974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_013158	CGGC	2	8	2512984	2512991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_013158	GCG	2	6	2513512	2513517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_013158	GAA	2	6	2513553	2513558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_013158	CCG	2	6	2513560	2513565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_013158	GCCA	2	8	2514171	2514178	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6048	NC_013158	CTG	2	6	2514179	2514184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_013158	CGT	2	6	2514231	2514236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_013158	GACA	2	8	2515610	2515617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6051	NC_013158	TGC	2	6	2515724	2515729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_013158	TGTC	2	8	2515770	2515777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6053	NC_013158	TCG	2	6	2515796	2515801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_013158	ATG	2	6	2515920	2515925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_013158	T	6	6	2517948	2517953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_013158	CGG	2	6	2517986	2517991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_013158	CAG	2	6	2518048	2518053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_013158	CCG	2	6	2520092	2520097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_013158	CCG	2	6	2520105	2520110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_013158	TGT	2	6	2520116	2520121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_013158	CGCGA	2	10	2520166	2520175	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6062	NC_013158	GGC	2	6	2524072	2524077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_013158	TG	3	6	2527515	2527520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_013158	TTTTC	2	10	2527534	2527543	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6065	NC_013158	GGT	2	6	2527595	2527600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_013158	GGC	2	6	2527618	2527623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_013158	CGCT	2	8	2529672	2529679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6068	NC_013158	CGGC	2	8	2529803	2529810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6069	NC_013158	TGGG	2	8	2529812	2529819	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_013158	GGC	2	6	2529868	2529873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_013158	GCC	2	6	2529877	2529882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6072	NC_013158	CG	3	6	2529889	2529894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6073	NC_013158	GAG	2	6	2529934	2529939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_013158	ACC	2	6	2530012	2530017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6075	NC_013158	CTC	2	6	2530050	2530055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_013158	CGGT	2	8	2530057	2530064	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6077	NC_013158	CCA	2	6	2532304	2532309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_013158	CGT	3	9	2532475	2532483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_013158	ATCC	2	8	2532494	2532501	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6080	NC_013158	CGA	2	6	2532517	2532522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_013158	ACG	2	6	2532552	2532557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_013158	CTGC	2	8	2532586	2532593	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6083	NC_013158	CCCA	2	8	2532725	2532732	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6084	NC_013158	GCT	2	6	2532746	2532751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_013158	ATC	2	6	2533423	2533428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_013158	TTG	2	6	2533437	2533442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_013158	GTCC	2	8	2533491	2533498	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6088	NC_013158	TTC	2	6	2533522	2533527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_013158	ACGG	2	8	2533556	2533563	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6090	NC_013158	ACG	2	6	2533580	2533585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_013158	TCG	2	6	2534559	2534564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_013158	ACG	2	6	2534590	2534595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_013158	GCCC	2	8	2534602	2534609	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6094	NC_013158	TGT	2	6	2535341	2535346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_013158	ACG	3	9	2535375	2535383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_013158	CCCG	2	8	2536440	2536447	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6097	NC_013158	CTGT	2	8	2539109	2539116	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6098	NC_013158	CAA	2	6	2539142	2539147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_013158	CGT	2	6	2539287	2539292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_013158	CGA	2	6	2539366	2539371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_013158	GCC	2	6	2539381	2539386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6102	NC_013158	TAA	2	6	2539417	2539422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_013158	TCC	2	6	2539453	2539458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6104	NC_013158	GCT	2	6	2542080	2542085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_013158	CAAT	2	8	2542113	2542120	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6106	NC_013158	GT	3	6	2543173	2543178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_013158	GCC	2	6	2543190	2543195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_013158	GGC	2	6	2543777	2543782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_013158	ACCCA	2	10	2545094	2545103	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6110	NC_013158	CGG	2	6	2545492	2545497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_013158	TC	5	10	2546102	2546111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_013158	TA	3	6	2546194	2546199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_013158	TAG	2	6	2546203	2546208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_013158	GAC	2	6	2547697	2547702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_013158	GCGG	2	8	2547712	2547719	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6116	NC_013158	ACTG	2	8	2547730	2547737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6117	NC_013158	CTTC	2	8	2547825	2547832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6118	NC_013158	TGA	2	6	2548612	2548617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_013158	TGA	2	6	2548648	2548653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_013158	AC	3	6	2551902	2551907	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_013158	AAT	2	6	2551928	2551933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_013158	CA	3	6	2551959	2551964	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_013158	CGT	2	6	2552008	2552013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_013158	GT	3	6	2552851	2552856	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_013158	GAG	2	6	2552860	2552865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_013158	CAG	2	6	2553454	2553459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_013158	TAG	2	6	2553496	2553501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_013158	TCC	2	6	2553502	2553507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_013158	TG	3	6	2553511	2553516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_013158	TC	3	6	2555762	2555767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6131	NC_013158	CGCC	2	8	2555784	2555791	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6132	NC_013158	AC	3	6	2556424	2556429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6133	NC_013158	GCGA	2	8	2561275	2561282	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6134	NC_013158	C	6	6	2561294	2561299	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6135	NC_013158	ACG	2	6	2561355	2561360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6137	NC_013158	GCC	2	6	2561405	2561410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6138	NC_013158	C	6	6	2561430	2561435	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6139	NC_013158	GCC	2	6	2561461	2561466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6153	NC_013158	TA	4	8	2576809	2576816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6154	NC_013158	CT	3	6	2576845	2576850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6247	NC_013158	GCTC	2	8	2616326	2616333	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6252	NC_013158	CGT	2	6	2619086	2619091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6253	NC_013158	GT	3	6	2619090	2619095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6254	NC_013158	TAG	2	6	2619158	2619163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6256	NC_013158	TCG	2	6	2621875	2621880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6258	NC_013158	TA	3	6	2621912	2621917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_013158	TG	3	6	2621919	2621924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6260	NC_013158	CAC	2	6	2622785	2622790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6261	NC_013158	AC	3	6	2623333	2623338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6263	NC_013158	CCGGC	2	10	2624355	2624364	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6264	NC_013158	GC	3	6	2624363	2624368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6265	NC_013158	GTC	2	6	2625743	2625748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6400	NC_013158	CGGC	2	8	2661394	2661401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6431	NC_013158	CCGTC	2	10	2678255	2678264	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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