MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori B38 chromosome

Total Repeats: 334

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012973	GA	3	6	7437	7442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012973	TA	3	6	9645	9650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012973	CA	3	6	16538	16543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012973	GC	3	6	22939	22944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012973	TA	3	6	27296	27301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012973	AG	3	6	40349	40354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012973	GT	3	6	49417	49422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012973	CT	3	6	58767	58772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012973	GC	3	6	59614	59619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012973	GT	3	6	60451	60456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012973	AG	3	6	63907	63912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012973	TA	3	6	64119	64124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012973	GA	3	6	64151	64156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012973	GT	3	6	64837	64842	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012973	AG	3	6	69804	69809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012973	AG	3	6	72616	72621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012973	CA	3	6	76070	76075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012973	TA	5	10	76129	76138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012973	GT	3	6	76407	76412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012973	GA	3	6	77791	77796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012973	TC	3	6	78081	78086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012973	AG	3	6	82548	82553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012973	AG	3	6	82572	82577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012973	AG	3	6	91029	91034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012973	TA	3	6	91077	91082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012973	TA	3	6	94362	94367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012973	AG	3	6	95356	95361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012973	AG	3	6	95546	95551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012973	AG	3	6	109875	109880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012973	CT	3	6	122680	122685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012973	AG	3	6	130980	130985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012973	GC	3	6	135238	135243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012973	GA	3	6	137273	137278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012973	AG	3	6	137316	137321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012973	TG	3	6	159338	159343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012973	CA	3	6	160484	160489	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012973	TC	3	6	162514	162519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012973	AC	3	6	171941	171946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012973	AT	3	6	178023	178028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012973	GA	3	6	178029	178034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012973	AG	3	6	183252	183257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012973	TC	3	6	184695	184700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012973	CT	3	6	184952	184957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012973	TA	3	6	198582	198587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012973	AT	3	6	199384	199389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012973	TC	3	6	200387	200392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012973	TC	3	6	200923	200928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012973	TA	3	6	201309	201314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012973	CT	3	6	201435	201440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012973	GC	3	6	206333	206338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012973	AG	3	6	216442	216447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012973	TG	3	6	217208	217213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012973	TG	3	6	221530	221535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012973	CT	3	6	225503	225508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012973	GA	3	6	229258	229263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012973	AG	3	6	252237	252242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012973	GA	3	6	261477	261482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012973	AG	3	6	261869	261874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012973	AG	3	6	298590	298595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012973	TG	3	6	320809	320814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012973	AG	3	6	327226	327231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012973	TA	3	6	328800	328805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012973	CT	3	6	329356	329361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012973	AG	3	6	336158	336163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012973	AG	3	6	337178	337183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012973	CT	3	6	337331	337336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012973	GA	3	6	337475	337480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012973	GA	3	6	337745	337750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012973	TC	10	20	338032	338051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012973	CT	3	6	339725	339730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012973	CA	3	6	339929	339934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_012973	CT	3	6	353867	353872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012973	AT	3	6	371149	371154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012973	AG	3	6	372833	372838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012973	CA	3	6	374797	374802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012973	GA	4	8	382361	382368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012973	TG	3	6	400731	400736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012973	AG	3	6	403446	403451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012973	AG	3	6	403541	403546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012973	GT	3	6	407071	407076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012973	TA	3	6	435602	435607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012973	GC	3	6	435693	435698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012973	GC	3	6	439049	439054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012973	GT	3	6	440457	440462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012973	AT	4	8	450248	450255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012973	GT	4	8	462419	462426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012973	AG	3	6	462437	462442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012973	TA	3	6	463492	463497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012973	AG	3	6	467296	467301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012973	TG	3	6	468187	468192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012973	AT	3	6	468237	468242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012973	AG	3	6	468249	468254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012973	TA	3	6	468365	468370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012973	CT	3	6	468512	468517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012973	CA	3	6	468637	468642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_012973	AG	3	6	469828	469833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012973	AG	3	6	492019	492024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012973	AC	3	6	492122	492127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012973	CT	13	26	493037	493062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012973	TA	3	6	493550	493555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012973	AG	3	6	496872	496877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012973	CA	3	6	498189	498194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012973	GC	3	6	498557	498562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_012973	AG	3	6	498993	498998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012973	GT	3	6	499322	499327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012973	GT	3	6	502577	502582	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012973	AT	3	6	523750	523755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012973	GC	3	6	537594	537599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012973	GC	3	6	538080	538085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012973	GA	3	6	551614	551619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012973	GT	3	6	553799	553804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012973	GT	3	6	556788	556793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012973	AG	3	6	556902	556907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012973	GA	3	6	563398	563403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012973	TC	3	6	582618	582623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012973	AG	3	6	582658	582663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012973	AG	3	6	582734	582739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012973	TA	3	6	582766	582771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012973	AC	3	6	583066	583071	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012973	CT	3	6	583185	583190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_012973	AG	3	6	583963	583968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012973	CG	3	6	584167	584172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012973	CT	3	6	584420	584425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_012973	CT	3	6	584590	584595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012973	CT	3	6	594074	594079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_012973	CT	3	6	602976	602981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012973	AG	7	14	603220	603233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012973	TC	3	6	603934	603939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_012973	AG	3	6	614239	614244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012973	AG	3	6	614488	614493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012973	CG	3	6	614613	614618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_012973	AG	3	6	615016	615021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012973	TA	3	6	628138	628143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012973	CT	3	6	638440	638445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_012973	CA	3	6	653865	653870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_012973	CA	3	6	654477	654482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_012973	AG	3	6	655354	655359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012973	AG	3	6	679917	679922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012973	AT	3	6	679951	679956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012973	CT	3	6	680176	680181	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_012973	AG	3	6	680262	680267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012973	GT	3	6	682149	682154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012973	CT	3	6	682738	682743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_012973	TA	3	6	687062	687067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012973	TA	3	6	702598	702603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012973	TA	3	6	702605	702610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012973	AT	3	6	725945	725950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012973	TC	3	6	726126	726131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_012973	TG	3	6	727382	727387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012973	TC	3	6	738173	738178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_012973	TC	4	8	738196	738203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_012973	TA	3	6	744788	744793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012973	CA	3	6	745705	745710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_012973	TC	3	6	745841	745846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.