MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 8508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012029	TTA	2	6	340704	340709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_012029	AAC	2	6	340713	340718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_012029	GATCG	2	10	340720	340729	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1004	NC_012029	CGA	2	6	340750	340755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_012029	GTTCGC	2	12	340849	340860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_012029	CGC	2	6	340870	340875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_012029	CGT	2	6	342749	342754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_012029	GTAG	2	8	343160	343167	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_012029	TG	3	6	343240	343245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_012029	CGA	3	9	343250	343258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_012029	CG	3	6	343259	343264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_012029	CGG	2	6	343288	343293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_012029	TCGC	2	8	343964	343971	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_012029	ATCC	2	8	344056	344063	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_012029	GTC	2	6	344252	344257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_012029	CGC	2	6	344282	344287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_012029	AG	3	6	344356	344361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_012029	TCG	2	6	344893	344898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_012029	TGT	2	6	344905	344910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_012029	ACCGC	2	10	344995	345004	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1021	NC_012029	TCG	2	6	345035	345040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_012029	GCC	2	6	345088	345093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_012029	GGC	2	6	345096	345101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_012029	GC	4	8	345111	345118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_012029	GGT	2	6	345162	345167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_012029	TCG	2	6	345200	345205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_012029	GTC	2	6	345210	345215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_012029	GCG	2	6	346335	346340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_012029	AGA	2	6	346377	346382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_012029	GCC	2	6	346424	346429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_012029	GTC	2	6	350605	350610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_012029	CG	4	8	350655	350662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_012029	GTG	2	6	352528	352533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_012029	GGC	2	6	352569	352574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_012029	GGC	2	6	352576	352581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_012029	CGCC	2	8	352603	352610	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1037	NC_012029	CGC	2	6	352803	352808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_012029	GA	3	6	352838	352843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_012029	GCGTTC	2	12	352849	352860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_012029	GCC	2	6	352887	352892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_012029	GC	4	8	352916	352923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_012029	CGCC	2	8	353496	353503	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1043	NC_012029	CGG	2	6	353521	353526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_012029	AGT	2	6	353593	353598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_012029	GA	3	6	353610	353615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_012029	GAGC	2	8	353619	353626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_012029	TG	3	6	353633	353638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_012029	GCCG	2	8	353651	353658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_012029	CGA	2	6	353794	353799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_012029	GAC	2	6	353812	353817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_012029	CGG	2	6	355236	355241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_012029	CGA	3	9	355290	355298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_012029	CGA	2	6	355320	355325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_012029	CG	3	6	355328	355333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_012029	TGA	2	6	355370	355375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_012029	CTC	2	6	355404	355409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_012029	CGCTC	2	10	355417	355426	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1058	NC_012029	CGG	2	6	355496	355501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_012029	GCC	2	6	355506	355511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_012029	CGCAC	2	10	355537	355546	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1061	NC_012029	AAC	2	6	355547	355552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_012029	CG	3	6	355612	355617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_012029	CTC	2	6	355620	355625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_012029	AG	3	6	356846	356851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_012029	CG	3	6	357881	357886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_012029	CGA	2	6	357892	357897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_012029	CG	3	6	357952	357957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_012029	CGT	2	6	357982	357987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_012029	GTCGAT	2	12	357992	358003	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1070	NC_012029	GCA	2	6	358025	358030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_012029	CGG	2	6	358073	358078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_012029	CGAT	2	8	358155	358162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_012029	CAC	2	6	358246	358251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_012029	GTC	2	6	358271	358276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_012029	CGG	2	6	358327	358332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_012029	GTC	2	6	358345	358350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_012029	GCCG	2	8	358379	358386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_012029	CGA	2	6	359463	359468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_012029	AG	3	6	359510	359515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_012029	CCCGA	2	10	359635	359644	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1081	NC_012029	GGCGC	2	10	359657	359666	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1082	NC_012029	GC	3	6	361152	361157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_012029	AGG	2	6	361199	361204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_012029	CGG	2	6	361233	361238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_012029	CGCT	2	8	364957	364964	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_012029	CGC	2	6	364968	364973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_012029	TCG	2	6	364979	364984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_012029	ATCAT	2	10	365635	365644	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1089	NC_012029	GT	3	6	365648	365653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_012029	A	7	7	365677	365683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_012029	GC	3	6	365690	365695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_012029	GAC	2	6	366165	366170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_012029	TAG	2	6	366175	366180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_012029	CGG	2	6	366220	366225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_012029	CGGG	2	8	366843	366850	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_012029	ACGG	2	8	366860	366867	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1097	NC_012029	CGGG	2	8	366883	366890	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_012029	GACGGA	2	12	366896	366907	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1099	NC_012029	AGC	2	6	368666	368671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_012029	ACG	2	6	368673	368678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_012029	AGA	2	6	368684	368689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_012029	CGAG	2	8	368710	368717	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_012029	CGC	3	9	368739	368747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_012029	GA	3	6	368770	368775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_012029	GA	3	6	368804	368809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_012029	CGCC	2	8	368850	368857	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1107	NC_012029	AC	3	6	368885	368890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_012029	CGG	2	6	369419	369424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_012029	TC	3	6	369482	369487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_012029	ACGGA	2	10	369619	369628	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1111	NC_012029	CGGCG	2	10	369647	369656	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1112	NC_012029	TA	3	6	371462	371467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012029	CCGG	2	8	371499	371506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_012029	ACA	2	6	371527	371532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_012029	CCG	2	6	371545	371550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_012029	CCAC	2	8	372412	372419	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1117	NC_012029	CGG	3	9	373219	373227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_012029	A	6	6	373229	373234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_012029	CGGC	2	8	374192	374199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_012029	AAC	2	6	374214	374219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_012029	CGGG	2	8	374220	374227	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_012029	CGG	2	6	374322	374327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_012029	CGA	2	6	374337	374342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_012029	ACA	2	6	374348	374353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_012029	CGCA	2	8	375884	375891	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_012029	GAT	2	6	375973	375978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_012029	CGG	2	6	376013	376018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_012029	TCG	2	6	376022	376027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_012029	CGAG	2	8	376069	376076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_012029	AGGTA	2	10	376115	376124	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_012029	CTTC	2	8	376180	376187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_012029	CTC	2	6	376227	376232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_012029	TTCG	2	8	376237	376244	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_012029	GTT	2	6	376246	376251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1136	NC_012029	TCGC	2	8	376274	376281	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1442	NC_012029	GTC	2	6	452855	452860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1444	NC_012029	TCC	2	6	452902	452907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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