MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 chromosome 1

Total Repeats: 8508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012029	GAGTT	2	10	129376	129385	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
502	NC_012029	CCG	2	6	129404	129409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_012029	CCG	2	6	129450	129455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_012029	TTC	2	6	129464	129469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_012029	CCG	2	6	129505	129510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_012029	CGA	2	6	129569	129574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_012029	GGA	2	6	129610	129615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_012029	GA	3	6	129614	129619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_012029	ACGG	2	8	129643	129650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
510	NC_012029	GGC	2	6	131219	131224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_012029	CGG	2	6	131230	131235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_012029	GAT	2	6	131268	131273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_012029	CG	3	6	132687	132692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_012029	GGC	2	6	132693	132698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_012029	GAC	2	6	132702	132707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_012029	CCG	2	6	134570	134575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_012029	CGG	2	6	134579	134584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_012029	CATA	2	8	134596	134603	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
519	NC_012029	CGA	2	6	134631	134636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_012029	AC	3	6	134660	134665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_012029	CGG	2	6	138168	138173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_012029	CT	3	6	138202	138207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
523	NC_012029	TGC	2	6	138246	138251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_012029	TCGC	2	8	138276	138283	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
525	NC_012029	ATT	2	6	138306	138311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_012029	GCCG	2	8	138316	138323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_012029	CCG	2	6	138330	138335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_012029	CGC	3	9	139158	139166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_012029	ATCGCC	2	12	139181	139192	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
530	NC_012029	CGC	3	9	139208	139216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_012029	GACCG	2	10	139238	139247	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
532	NC_012029	TCG	2	6	142748	142753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_012029	TCT	2	6	142777	142782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_012029	GTG	2	6	142783	142788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_012029	TCG	2	6	142789	142794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_012029	GCG	2	6	142826	142831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_012029	CCG	2	6	144134	144139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_012029	CGT	2	6	144447	144452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_012029	CGGGA	2	10	144487	144496	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
540	NC_012029	GC	3	6	144501	144506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
541	NC_012029	TCG	2	6	144508	144513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_012029	GTC	2	6	144524	144529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_012029	ACG	2	6	144595	144600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_012029	TGAC	2	8	144609	144616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
545	NC_012029	GCT	2	6	144641	144646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_012029	TTCACT	2	12	144705	144716	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_012029	CA	3	6	144722	144727	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_012029	AACC	2	8	144746	144753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_012029	CGA	2	6	146500	146505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_012029	CGG	2	6	146926	146931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_012029	CGC	2	6	146970	146975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_012029	ACG	2	6	147051	147056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_012029	GTT	2	6	147090	147095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_012029	TC	3	6	147110	147115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_012029	CCT	2	6	147141	147146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_012029	TAA	2	6	147162	147167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_012029	ATA	2	6	147184	147189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_012029	GGT	2	6	152373	152378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_012029	CGG	2	6	152385	152390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_012029	TA	3	6	152715	152720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_012029	GTT	2	6	153368	153373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_012029	GAGT	2	8	153510	153517	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012029	GC	3	6	153534	153539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_012029	CCCGC	3	15	153578	153592	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
565	NC_012029	TCG	2	6	153618	153623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_012029	TCGCT	2	10	153632	153641	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
567	NC_012029	GCT	2	6	153645	153650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_012029	AGCGTG	2	12	153688	153699	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
569	NC_012029	CTG	2	6	153712	153717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_012029	CGG	2	6	153721	153726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_012029	GCT	2	6	153750	153755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_012029	ACG	2	6	154194	154199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_012029	GCG	2	6	154200	154205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_012029	GCG	2	6	154301	154306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_012029	CGA	2	6	154314	154319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_012029	TGG	2	6	154382	154387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_012029	CA	3	6	154439	154444	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
578	NC_012029	CGA	2	6	154509	154514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_012029	CGC	2	6	154532	154537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_012029	GAC	2	6	154883	154888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_012029	TCCG	2	8	154894	154901	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
582	NC_012029	TC	3	6	154924	154929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_012029	GCC	2	6	154960	154965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_012029	TC	3	6	155390	155395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_012029	TG	3	6	155462	155467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_012029	TCC	2	6	155523	155528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_012029	CGG	2	6	155555	155560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_012029	GC	3	6	156002	156007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_012029	GGT	2	6	160153	160158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_012029	CAG	2	6	160275	160280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_012029	CTC	2	6	160305	160310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_012029	GCT	2	6	160356	160361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_012029	CCCCG	2	10	160378	160387	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
594	NC_012029	GTACC	2	10	160392	160401	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
595	NC_012029	CGC	2	6	160419	160424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_012029	TCGC	2	8	160454	160461	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
597	NC_012029	CTC	2	6	160480	160485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_012029	GC	4	8	160507	160514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
599	NC_012029	GCT	2	6	160519	160524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_012029	GTC	2	6	160525	160530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_012029	CGC	2	6	160551	160556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_012029	ACCG	2	8	161259	161266	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
603	NC_012029	CGG	2	6	161332	161337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_012029	CCT	2	6	161392	161397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_012029	CGA	2	6	163609	163614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_012029	TC	5	10	163643	163652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_012029	ACG	2	6	164176	164181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_012029	GA	3	6	164195	164200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_012029	CGA	2	6	164235	164240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_012029	GGA	2	6	164248	164253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_012029	CGT	2	6	164263	164268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_012029	TCAC	2	8	164305	164312	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_012029	CGC	2	6	164510	164515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_012029	CCGTC	2	10	164534	164543	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
615	NC_012029	CCG	2	6	164567	164572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_012029	TCGCT	2	10	166206	166215	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
617	NC_012029	GT	3	6	166257	166262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_012029	CGCT	2	8	168012	168019	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
619	NC_012029	GCCGTC	2	12	168023	168034	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
620	NC_012029	TCG	2	6	168037	168042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_012029	GTC	2	6	172784	172789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_012029	CCG	2	6	172811	172816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_012029	CG	3	6	172820	172825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
624	NC_012029	CGG	2	6	175043	175048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_012029	ACGC	2	8	175089	175096	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
626	NC_012029	CTC	2	6	175105	175110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_012029	CCCGC	2	10	175183	175192	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
628	NC_012029	TCG	2	6	175223	175228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_012029	GAC	2	6	175250	175255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_012029	CG	3	6	175265	175270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
631	NC_012029	TCG	2	6	175295	175300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_012029	TTTA	2	8	175316	175323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_012029	GGT	2	6	175372	175377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_012029	GTC	2	6	175382	175387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_012029	CCT	2	6	175399	175404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_012029	GGC	2	6	175416	175421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_012029	GCC	2	6	176230	176235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_012029	CCAC	2	8	176236	176243	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
639	NC_012029	TAT	2	6	178420	178425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_012029	CCCG	2	8	178436	178443	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
641	NC_012029	ACCC	2	8	178476	178483	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
642	NC_012029	CGC	2	6	178495	178500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
643	NC_012029	GACG	2	8	180155	180162	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
644	NC_012029	GACG	2	8	181164	181171	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
645	NC_012029	TTG	2	6	181183	181188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
646	NC_012029	GTCA	2	8	181203	181210	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
647	NC_012029	CGG	2	6	181234	181239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_012029	CGA	2	6	181280	181285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
649	NC_012029	CGCT	2	8	181331	181338	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
650	NC_012029	CTC	2	6	181342	181347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
651	NC_012029	ACCGCA	2	12	181434	181445	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
652	NC_012029	CTCC	2	8	181471	181478	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
653	NC_012029	CGC	2	6	181482	181487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
654	NC_012029	GC	4	8	181537	181544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
655	NC_012029	CGC	3	9	181542	181550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
656	NC_012029	TCC	3	9	181574	181582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
657	NC_012029	CCGA	2	8	181612	181619	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
658	NC_012029	ACGG	2	8	181623	181630	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
659	NC_012029	TGGG	2	8	183453	183460	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
660	NC_012029	TTC	2	6	183471	183476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
661	NC_012029	GCG	2	6	183592	183597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
662	NC_012029	CGCT	2	8	183600	183607	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
663	NC_012029	GC	3	6	183608	183613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
664	NC_012029	TCGC	2	8	183619	183626	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
665	NC_012029	GCTC	2	8	183630	183637	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
666	NC_012029	TGCT	2	8	183641	183648	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
667	NC_012029	GCC	2	6	183657	183662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
668	NC_012029	CCCG	2	8	183684	183691	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
669	NC_012029	ACCAC	2	10	183698	183707	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
670	NC_012029	TCG	2	6	183728	183733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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672	NC_012029	CG	3	6	183800	183805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
673	NC_012029	CTTA	2	8	183885	183892	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
674	NC_012029	CACG	2	8	183893	183900	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
675	NC_012029	CCG	2	6	183901	183906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
676	NC_012029	TCG	2	6	185662	185667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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679	NC_012029	GTTC	2	8	186261	186268	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
680	NC_012029	GGAC	2	8	186269	186276	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
681	NC_012029	GC	3	6	186282	186287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
682	NC_012029	TCTCG	2	10	186961	186970	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
683	NC_012029	AAT	2	6	186972	186977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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686	NC_012029	GCG	2	6	193608	193613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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702	NC_012029	GCGGA	2	10	199166	199175	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
703	NC_012029	CGG	2	6	199183	199188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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737	NC_012029	GGT	3	9	222116	222124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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770	NC_012029	GTC	2	6	230514	230519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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772	NC_012029	CGGCGT	2	12	230582	230593	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
773	NC_012029	CCT	2	6	230620	230625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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778	NC_012029	GTT	2	6	232004	232009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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915	NC_012029	AGT	2	6	315803	315808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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946	NC_012029	GCC	2	6	321514	321519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1000	NC_012029	ACCG	2	8	340663	340670	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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