MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Halothermothrix orenii H 168 chromosome

Total Repeats: 5091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011899	TAA	2	6	136	141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011899	TTA	2	6	146	151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011899	AAT	2	6	220	225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011899	ATA	2	6	413	418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011899	ACT	2	6	526	531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011899	AGG	2	6	579	584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011899	TAA	2	6	2068	2073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011899	TAA	2	6	2101	2106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011899	CTT	2	6	2163	2168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011899	AAC	2	6	2203	2208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011899	TAC	2	6	2242	2247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011899	GGT	2	6	4809	4814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011899	ATT	2	6	7127	7132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011899	TTG	2	6	9585	9590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011899	CAT	2	6	9928	9933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011899	CTT	2	6	9961	9966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011899	AAC	2	6	9989	9994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011899	CTC	2	6	10841	10846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_011899	TGG	2	6	10858	10863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011899	TTA	2	6	10925	10930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011899	TTA	2	6	10987	10992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011899	ACC	2	6	11028	11033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_011899	ATA	2	6	11058	11063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011899	TGC	2	6	14972	14977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011899	AGA	2	6	15201	15206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011899	ATA	2	6	15213	15218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011899	TAA	2	6	15256	15261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011899	TCC	2	6	15295	15300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_011899	CAT	2	6	15331	15336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011899	TAA	2	6	15359	15364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011899	TAA	3	9	15366	15374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011899	AGG	2	6	16889	16894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011899	GAA	2	6	16934	16939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011899	ATT	2	6	17093	17098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011899	TAA	2	6	17158	17163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011899	ATT	2	6	17174	17179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011899	ATA	2	6	17243	17248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011899	AAT	2	6	17250	17255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011899	AGG	2	6	17271	17276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011899	TAT	2	6	17836	17841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011899	CAT	2	6	18018	18023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011899	TAA	2	6	18155	18160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011899	ATT	2	6	18185	18190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011899	CAG	2	6	18197	18202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011899	TTA	2	6	18228	18233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011899	AGG	2	6	18260	18265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011899	TGA	2	6	18574	18579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011899	TGA	2	6	18592	18597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011899	ATG	2	6	19442	19447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011899	ATA	2	6	19453	19458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011899	AAC	2	6	19484	19489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011899	CAA	2	6	19657	19662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011899	CAA	2	6	19667	19672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011899	AAC	2	6	19746	19751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011899	GGC	2	6	19860	19865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011899	GAC	2	6	19918	19923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011899	CGA	2	6	20121	20126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011899	GCA	2	6	20195	20200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011899	CGC	2	6	20242	20247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_011899	GAA	2	6	20291	20296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011899	AGG	2	6	20304	20309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011899	GAG	2	6	20335	20340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011899	CAG	2	6	20363	20368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011899	GAA	2	6	20555	20560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011899	GGC	2	6	20574	20579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011899	GAA	2	6	20817	20822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011899	GGT	2	6	20894	20899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011899	GTC	2	6	20908	20913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011899	GGA	2	6	21021	21026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011899	GCG	2	6	21102	21107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011899	CAC	2	6	21256	21261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011899	CCT	2	6	21366	21371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_011899	TGT	2	6	21410	21415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011899	GCT	2	6	21635	21640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011899	GAG	2	6	21686	21691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011899	AAG	2	6	21711	21716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011899	GAG	2	6	21763	21768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011899	GCG	2	6	21796	21801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011899	GAG	2	6	21812	21817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011899	TGG	2	6	21830	21835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011899	CCA	2	6	21939	21944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_011899	ACC	2	6	22002	22007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_011899	GAA	2	6	22028	22033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011899	TCC	2	6	22044	22049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_011899	GGA	2	6	22161	22166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011899	GGT	2	6	22369	22374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011899	CCA	2	6	22518	22523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_011899	AGC	2	6	22703	22708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011899	CCG	2	6	22929	22934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_011899	GGA	2	6	23096	23101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011899	AGG	2	6	23118	23123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011899	AGG	2	6	23128	23133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011899	GCC	2	6	23199	23204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011899	CGG	2	6	23522	23527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011899	CAA	2	6	23616	23621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011899	GCC	2	6	23779	23784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_011899	ACC	2	6	23793	23798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_011899	CCT	2	6	23880	23885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_011899	CGG	2	6	24015	24020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011899	TCG	2	6	24131	24136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011899	CGT	2	6	24211	24216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011899	GTT	2	6	24314	24319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011899	AGG	2	6	24418	24423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011899	TCC	2	6	24721	24726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_011899	GCC	2	6	24854	24859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_011899	TCC	2	6	24946	24951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_011899	CGG	2	6	25016	25021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011899	CGG	2	6	25051	25056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011899	GAT	2	6	25152	25157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011899	TAA	2	6	25161	25166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011899	CAC	2	6	25245	25250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_011899	GGC	2	6	25406	25411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011899	CCA	2	6	25512	25517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_011899	CCA	2	6	25758	25763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_011899	ATA	2	6	25778	25783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011899	CCA	2	6	25865	25870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_011899	AAC	2	6	26037	26042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011899	ACA	2	6	26143	26148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011899	ATT	2	6	26151	26156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011899	TAT	2	6	28612	28617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011899	AAG	2	6	28784	28789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011899	CTT	2	6	29555	29560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011899	TAA	2	6	29603	29608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011899	ATA	2	6	30297	30302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011899	AAG	2	6	30306	30311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011899	AGG	2	6	31926	31931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011899	GAT	2	6	32965	32970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011899	CTA	2	6	34205	34210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011899	TAA	2	6	34260	34265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011899	GAA	2	6	34288	34293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011899	ATT	2	6	34387	34392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011899	TGA	2	6	34461	34466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011899	ATA	3	9	34484	34492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011899	ATA	2	6	34514	34519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011899	AAT	2	6	34627	34632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011899	ATT	2	6	34651	34656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011899	CTT	2	6	34657	34662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011899	TGA	2	6	34668	34673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011899	AGA	2	6	34692	34697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011899	AGA	2	6	34791	34796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011899	GCT	2	6	34888	34893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011899	CGT	2	6	35066	35071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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