MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus parasuis SH0165 chromosome

Total Repeats: 1461

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011852	TATT	2	8	1741	1748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011852	AAGT	2	8	1790	1797	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011852	GAAA	2	8	4832	4839	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011852	TTTC	2	8	4879	4886	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011852	AAAC	2	8	4935	4942	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011852	TTAA	2	8	7042	7049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011852	CGTT	2	8	7079	7086	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011852	CCAC	2	8	7648	7655	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_011852	ACTT	2	8	7997	8004	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011852	ACTT	2	8	8379	8386	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011852	TTTA	2	8	8866	8873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011852	ATTA	2	8	9468	9475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011852	TTAA	2	8	20063	20070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011852	TCTT	2	8	22693	22700	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011852	ACCG	2	8	25340	25347	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011852	ACCC	2	8	26005	26012	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_011852	TAAT	2	8	30553	30560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011852	ATTG	2	8	34214	34221	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011852	TATT	2	8	34240	34247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011852	TATT	2	8	36635	36642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011852	TTTA	2	8	37870	37877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011852	ATTT	2	8	38001	38008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011852	CGTT	2	8	43108	43115	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011852	TCAA	2	8	43417	43424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011852	GGGT	2	8	46956	46963	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011852	ACCC	2	8	47013	47020	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_011852	GGGT	2	8	47115	47122	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011852	ACCC	2	8	47172	47179	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_011852	AAAT	2	8	48604	48611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011852	ATGA	2	8	49168	49175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011852	AAGA	2	8	54014	54021	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011852	GAAT	2	8	54066	54073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011852	AAAT	2	8	60188	60195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011852	TTCT	2	8	64211	64218	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011852	TTAG	2	8	64712	64719	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011852	GGTT	2	8	66510	66517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011852	GAAA	2	8	66599	66606	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011852	AAAG	2	8	67701	67708	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011852	AAAT	2	8	68957	68964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011852	CCCT	2	8	69726	69733	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_011852	ATAA	2	8	71667	71674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011852	ATTT	2	8	72941	72948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011852	GGTA	2	8	72973	72980	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011852	AATA	2	8	73589	73596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011852	CAAA	2	8	73682	73689	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011852	GCTT	2	8	73692	73699	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011852	TCAA	2	8	73710	73717	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011852	GTTA	2	8	76031	76038	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011852	AGAT	2	8	80431	80438	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011852	GATA	2	8	81600	81607	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011852	TAAG	3	12	85289	85300	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011852	TTTG	2	8	88948	88955	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011852	ATTA	2	8	89056	89063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011852	TATT	2	8	94669	94676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011852	TAAA	2	8	99786	99793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011852	AGTA	2	8	100226	100233	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011852	ATTT	2	8	100247	100254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011852	ATTG	2	8	102172	102179	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011852	CAAT	2	8	102257	102264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011852	GATA	2	8	102416	102423	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011852	ATAA	2	8	103281	103288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011852	AACC	2	8	103512	103519	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011852	AACT	2	8	103690	103697	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011852	GTAA	2	8	103721	103728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011852	ATGG	2	8	104787	104794	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011852	GCTT	2	8	104934	104941	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011852	AATT	2	8	105000	105007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011852	CTAC	2	8	109300	109307	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011852	TTTG	3	12	109358	109369	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011852	TAAT	2	8	109370	109377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011852	AGTG	2	8	109535	109542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011852	ATGG	2	8	109559	109566	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011852	TGCC	2	8	109618	109625	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011852	AAAT	2	8	109777	109784	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011852	AGGA	2	8	112344	112351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011852	AGAT	2	8	114253	114260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011852	TGGG	2	8	116289	116296	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011852	GAAC	2	8	118706	118713	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011852	TAAA	2	8	124466	124473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011852	ATTA	2	8	132180	132187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011852	TAAT	2	8	133968	133975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011852	TAAA	2	8	142218	142225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011852	TATT	2	8	144057	144064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011852	TAAA	2	8	145747	145754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011852	ATTA	2	8	147780	147787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011852	ATCA	2	8	147891	147898	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011852	TAAA	2	8	147938	147945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011852	CCCA	2	8	147979	147986	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_011852	TATT	2	8	150273	150280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011852	TCAA	2	8	150990	150997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011852	GCTT	2	8	159282	159289	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011852	TGAT	2	8	160197	160204	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011852	CGGT	2	8	161633	161640	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011852	CAAC	2	8	161753	161760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011852	CGTT	2	8	161762	161769	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011852	ATTT	2	8	161799	161806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011852	ATCC	2	8	161842	161849	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011852	TTGA	2	8	162847	162854	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011852	TTTC	2	8	163259	163266	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011852	TGGT	2	8	163410	163417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011852	TGTC	4	16	163587	163602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_011852	TCTT	2	8	163724	163731	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011852	ATTT	2	8	163822	163829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011852	TAAT	2	8	163881	163888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011852	TTAT	2	8	163996	164003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011852	TTAT	2	8	166741	166748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011852	TGAT	2	8	167067	167074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011852	TTTA	2	8	167243	167250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011852	ATTC	2	8	168502	168509	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011852	ATTT	2	8	169091	169098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011852	TAAC	2	8	170070	170077	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011852	TTTA	2	8	172536	172543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011852	ATCA	2	8	173399	173406	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011852	ATTT	2	8	174285	174292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011852	AAAT	2	8	174344	174351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011852	AATA	2	8	176212	176219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011852	TTCA	2	8	180186	180193	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011852	TAGA	2	8	180469	180476	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011852	ATGT	2	8	180581	180588	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011852	ATTT	2	8	180603	180610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011852	ACGC	2	8	180879	180886	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011852	GAAG	2	8	184070	184077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011852	ATTC	2	8	184107	184114	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011852	TTTA	2	8	185062	185069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011852	TAAA	2	8	185201	185208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011852	ATTG	2	8	189900	189907	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011852	TTTA	2	8	190002	190009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011852	ACCC	2	8	190946	190953	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
129	NC_011852	TTTG	2	8	191368	191375	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011852	TCTA	2	8	192012	192019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011852	GAAT	2	8	192033	192040	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011852	TAAA	2	8	196538	196545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011852	TAAA	2	8	203602	203609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011852	AAAT	2	8	211277	211284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011852	ATTT	2	8	211287	211294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011852	AAGT	2	8	212124	212131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011852	AATG	2	8	212353	212360	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011852	ATTG	2	8	212379	212386	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011852	CATT	2	8	216713	216720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011852	TCTA	2	8	216901	216908	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011852	AAAC	2	8	216937	216944	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011852	GGGT	2	8	222847	222854	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011852	ACCC	2	8	222904	222911	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_011852	TAAA	2	8	223028	223035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011852	TTGG	2	8	224031	224038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011852	GTGG	2	8	224309	224316	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011852	AAAC	2	8	224375	224382	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011852	AACG	2	8	224881	224888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011852	TTAA	2	8	224918	224925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011852	ATCT	2	8	226819	226826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_011852	TGCT	2	8	228552	228559	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_011852	AGTG	2	8	233472	233479	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011852	ATGT	2	8	234502	234509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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