MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori P12 chromosome

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011498	ACTATA	2	12	9622	9633	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011498	AAACAC	2	12	18181	18192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011498	TTTCTT	2	12	22825	22836	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011498	GACTTA	2	12	44800	44811	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_011498	AGAAAA	2	12	62358	62369	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011498	TACAAA	2	12	96254	96265	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011498	GTTTTA	2	12	133980	133991	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011498	TTGGGG	2	12	137510	137521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011498	TTGTTT	2	12	155966	155977	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011498	TAAAAA	2	12	170225	170236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011498	ATTAAA	2	12	229464	229475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011498	ATTTTA	2	12	252570	252581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011498	TGCATT	2	12	330336	330347	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011498	TGCATT	2	12	330352	330363	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011498	GTTTTT	2	12	366448	366459	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011498	AAAATA	2	12	439840	439851	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011498	TTCTTT	2	12	450866	450877	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011498	ATTTTA	2	12	480943	480954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011498	TTTAAA	2	12	486430	486441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011498	TAAAAA	2	12	494731	494742	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011498	AAATTT	2	12	514865	514876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011498	TTTAAT	2	12	528093	528104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011498	TTGTAA	2	12	567276	567287	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011498	TAAAGC	2	12	591953	591964	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011498	TTTAAA	2	12	592132	592143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011498	CATTAC	2	12	602995	603006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011498	TCTCAA	2	12	632939	632950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011498	AAAATC	2	12	635193	635204	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011498	AAGAAA	2	12	738634	738645	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011498	AATGAG	2	12	738670	738681	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011498	AAAAAT	2	12	745617	745628	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011498	TGGTGC	2	12	755145	755156	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_011498	TTGCGC	2	12	755613	755624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011498	CTTTTT	2	12	759227	759238	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011498	AATCTT	2	12	765613	765624	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011498	ATTTTA	2	12	775931	775942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011498	CGGCTT	2	12	807473	807484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011498	ATTTTT	2	12	924777	924788	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011498	ATTATA	2	12	968149	968160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011498	TTTTAT	2	12	968303	968314	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011498	ATTGAA	2	12	975644	975655	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011498	AATAAA	2	12	998206	998217	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011498	AATTCT	2	12	1044839	1044850	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011498	CTTTAA	2	12	1054482	1054493	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011498	CTAAAA	2	12	1061718	1061729	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_011498	ACAAAA	2	12	1149715	1149726	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011498	GCATTT	2	12	1208355	1208366	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011498	ATCCTT	2	12	1235655	1235666	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011498	TTGTAT	2	12	1238076	1238087	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011498	ACTTAA	2	12	1256356	1256367	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011498	CCCTAA	2	12	1274312	1274323	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011498	AAACTT	2	12	1281372	1281383	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_011498	TGTTAT	2	12	1290849	1290860	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011498	TTTGAT	2	12	1296517	1296528	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011498	ATTTTT	2	12	1313130	1313141	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011498	ATAAAA	2	12	1343648	1343659	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011498	TGGCTT	2	12	1392025	1392036	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_011498	GTGCCG	2	12	1394288	1394299	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011498	CACTGA	2	12	1411265	1411276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011498	AAAGAA	2	12	1412347	1412358	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011498	AAACCA	2	12	1418155	1418166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011498	TACCTT	2	12	1419960	1419971	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011498	CAAAAT	2	12	1421272	1421283	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011498	GTTTTT	2	12	1421599	1421610	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011498	TTAGCG	2	12	1424924	1424935	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_011498	ATCCTA	2	12	1455310	1455321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011498	TCTAAA	2	12	1455816	1455827	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_011498	CTTTAG	2	12	1456318	1456329	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011498	TTGATA	2	12	1456434	1456445	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011498	AGTTTT	2	12	1456917	1456928	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011498	CTTTAA	2	12	1459588	1459599	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_011498	AGCGGG	2	12	1468037	1468048	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_011498	GTTTTA	2	12	1478227	1478238	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011498	TAAAAA	2	12	1480063	1480074	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011498	CTAAGT	2	12	1491362	1491373	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_011498	TGTTTA	2	12	1500230	1500241	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011498	AAATTG	2	12	1582107	1582118	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011498	AAAGAT	2	12	1669148	1669159	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.