MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori P12 chromosome

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011498	GTTTT	2	10	2428	2437	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011498	GAAAC	2	10	4650	4659	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011498	TTTTA	2	10	4910	4919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011498	AAATT	2	10	7180	7189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011498	GCTTT	2	10	13462	13471	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011498	ATTGT	2	10	44251	44260	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011498	TCTTT	2	10	44615	44624	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011498	TTCTC	2	10	44632	44641	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_011498	ATTAA	2	10	56050	56059	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011498	AACGA	2	10	61412	61421	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011498	TTAAA	2	10	61424	61433	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011498	ACAAA	2	10	61453	61462	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011498	ATATA	2	10	61767	61776	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011498	GGTGG	2	10	70191	70200	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011498	TTACA	2	10	79842	79851	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011498	TTTGT	2	10	83442	83451	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011498	TTTTG	2	10	83515	83524	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011498	GATTT	2	10	83526	83535	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011498	AACAA	2	10	87866	87875	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011498	TAAAA	2	10	94232	94241	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011498	AAAAT	2	10	109866	109875	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011498	ATTTA	2	10	118840	118849	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011498	CAAAT	2	10	158950	158959	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011498	ATATT	2	10	177186	177195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011498	TTTCC	2	10	177237	177246	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_011498	TTTAA	2	10	184872	184881	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011498	TTCAA	2	10	198028	198037	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011498	TTAAG	2	10	202389	202398	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011498	ATTTA	2	10	209234	209243	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011498	AAACA	2	10	209256	209265	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011498	AAAAC	2	10	227954	227963	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_011498	AACAG	2	10	229385	229394	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011498	ATTTT	2	10	230775	230784	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011498	CTAAC	2	10	241930	241939	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_011498	CAAAA	2	10	243261	243270	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011498	AAATT	2	10	252610	252619	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011498	CCTTG	2	10	257500	257509	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_011498	AAAAT	2	10	257779	257788	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011498	ATCGT	2	10	258091	258100	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011498	CAATC	2	10	261692	261701	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_011498	CATTT	2	10	267868	267877	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011498	AAATA	2	10	279983	279992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011498	AATTT	2	10	285673	285682	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011498	GTGGG	2	10	319000	319009	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011498	ATATT	2	10	327321	327330	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011498	GATTT	2	10	327745	327754	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011498	TTTTA	2	10	327779	327788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011498	ACCTG	2	10	329089	329098	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_011498	TTTGC	2	10	329334	329343	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_011498	ATTAA	2	10	342724	342733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011498	TTGTG	2	10	345089	345098	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011498	TAAAA	2	10	354492	354501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011498	AAAAG	2	10	364048	364057	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011498	TAAAA	2	10	375549	375558	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011498	TAGAT	2	10	415064	415073	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011498	AAAGG	2	10	428032	428041	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011498	TTAAT	2	10	429643	429652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011498	TTGTT	2	10	434494	434503	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011498	ATAAA	2	10	439870	439879	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011498	AAAAT	2	10	439904	439913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011498	AAGGA	2	10	451527	451536	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011498	ATCTA	2	10	452042	452051	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011498	TGGGC	2	10	457660	457669	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011498	CTACA	2	10	475950	475959	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_011498	CAATC	2	10	485225	485234	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_011498	CTTTT	2	10	485859	485868	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011498	ATTCA	2	10	488561	488570	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011498	TTAGG	2	10	492842	492851	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011498	AATAA	2	10	493644	493653	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011498	AAAGC	2	10	493902	493911	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011498	TAACA	2	10	501513	501522	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_011498	TAAAA	2	10	502996	503005	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011498	TTTGA	2	10	503096	503105	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011498	AAAAT	2	10	507670	507679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011498	ACACC	2	10	518176	518185	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
76	NC_011498	GCATG	2	10	524895	524904	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_011498	TAACT	2	10	527952	527961	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_011498	AGGCT	2	10	537295	537304	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_011498	TTCAA	2	10	542865	542874	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_011498	TATAG	2	10	569774	569783	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011498	GCATT	2	10	585277	585286	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_011498	AAATT	2	10	589380	589389	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011498	ATTTT	2	10	592074	592083	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011498	TTGTA	2	10	596288	596297	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011498	AGGAT	2	10	596360	596369	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011498	ACTCT	2	10	620184	620193	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_011498	GATAC	2	10	632121	632130	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_011498	CCATT	2	10	632717	632726	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_011498	TAAAA	2	10	632990	632999	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011498	TAAGG	2	10	634899	634908	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011498	CGCTT	2	10	635011	635020	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_011498	ATAAG	2	10	652130	652139	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011498	TTTAA	2	10	667129	667138	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011498	TTTAA	2	10	682718	682727	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011498	TAAAA	2	10	685496	685505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011498	TTTAA	2	10	692290	692299	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011498	CACAA	2	10	697529	697538	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_011498	AAATC	2	10	738585	738594	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011498	TGTTT	2	10	740900	740909	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011498	CTTAT	2	10	742310	742319	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_011498	AAAAC	2	10	748767	748776	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_011498	TAAAA	2	10	748778	748787	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011498	AAAGA	2	10	754763	754772	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011498	AATAA	2	10	759399	759408	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011498	ATTTA	2	10	781489	781498	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011498	ACCAC	2	10	781980	781989	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_011498	TATAG	2	10	785439	785448	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011498	TCTTT	2	10	820591	820600	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_011498	AATTA	2	10	837364	837373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011498	GGTTT	2	10	841253	841262	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011498	TTTTA	2	10	845819	845828	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011498	TTCTT	2	10	860237	860246	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_011498	ATTAA	2	10	887099	887108	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011498	TTTTA	2	10	894443	894452	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011498	ATTTT	2	10	924693	924702	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011498	TGATT	2	10	928868	928877	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011498	CTAAA	2	10	930570	930579	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_011498	TATAA	2	10	933029	933038	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011498	AAATT	2	10	946747	946756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011498	TCGTA	2	10	950034	950043	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011498	TAAAA	2	10	953642	953651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011498	TTTGT	2	10	966232	966241	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011498	TTTAT	2	10	970893	970902	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011498	AATAA	2	10	985398	985407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011498	TCAAG	2	10	985436	985445	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_011498	TTAGT	2	10	1031418	1031427	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011498	ATTTT	2	10	1034413	1034422	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011498	TTATC	2	10	1054609	1054618	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011498	TTCAA	2	10	1055624	1055633	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_011498	CTCAT	2	10	1055854	1055863	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_011498	TCACT	2	10	1057332	1057341	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_011498	TACTT	2	10	1057631	1057640	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_011498	TAAAA	2	10	1058048	1058057	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011498	AACGA	2	10	1061774	1061783	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_011498	GATGC	2	10	1075151	1075160	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_011498	AAAAT	2	10	1084060	1084069	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011498	TCTTT	2	10	1100746	1100755	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011498	AATTG	2	10	1101410	1101419	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011498	TAAAA	2	10	1116373	1116382	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011498	CTTAT	2	10	1124030	1124039	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_011498	AAATC	2	10	1144874	1144883	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_011498	AAACT	2	10	1163490	1163499	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_011498	AAAAC	2	10	1163507	1163516	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_011498	TAATA	2	10	1181091	1181100	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011498	GATTT	2	10	1182441	1182450	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011498	CACGA	2	10	1183865	1183874	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_011498	TTACC	2	10	1184663	1184672	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.