MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori G27 chromosome

Total Repeats: 364

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011333	AG	3	6	7313	7318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011333	CA	3	6	16436	16441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011333	GC	3	6	22870	22875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011333	GT	3	6	25347	25352	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011333	TA	3	6	27370	27375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011333	AG	3	6	40415	40420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011333	AT	3	6	44065	44070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011333	GT	3	6	44394	44399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011333	AG	3	6	44510	44515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011333	TG	3	6	44828	44833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011333	AT	3	6	45725	45730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011333	TA	3	6	45912	45917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011333	TA	3	6	45951	45956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011333	GT	3	6	46036	46041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011333	AG	3	6	46205	46210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011333	TA	3	6	55836	55841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011333	CT	3	6	55976	55981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011333	CT	3	6	56403	56408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011333	CT	3	6	63317	63322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011333	CT	3	6	65683	65688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011333	AG	3	6	65709	65714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011333	AG	3	6	66114	66119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011333	GC	3	6	66562	66567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011333	GA	4	8	67190	67197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011333	AC	3	6	67350	67355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011333	CG	3	6	68454	68459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011333	GA	3	6	68574	68579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011333	AG	3	6	68836	68841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011333	GA	4	8	69658	69665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011333	AC	3	6	69685	69690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011333	AG	3	6	70550	70555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011333	TA	3	6	70764	70769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011333	GA	4	8	71179	71186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011333	GT	3	6	71471	71476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011333	AC	3	6	72175	72180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011333	AG	3	6	74914	74919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011333	AG	3	6	76417	76422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011333	CA	3	6	82692	82697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011333	TA	5	10	82751	82760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011333	TC	3	6	83805	83810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011333	AG	4	8	83872	83879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011333	GA	3	6	86437	86442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011333	AG	3	6	87784	87789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011333	CA	3	6	88011	88016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011333	AG	3	6	88128	88133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011333	AG	3	6	88153	88158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011333	AG	3	6	96545	96550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011333	TA	3	6	96593	96598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011333	CT	3	6	98976	98981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011333	TA	3	6	99876	99881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011333	AG	3	6	101061	101066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011333	AG	3	6	114926	114931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011333	GA	5	10	115375	115384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011333	AC	5	10	119268	119277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011333	CA	3	6	135565	135570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011333	AG	3	6	136529	136534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011333	GC	3	6	140810	140815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011333	GA	3	6	142840	142845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011333	AG	3	6	142883	142888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011333	AG	3	6	157101	157106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011333	TG	3	6	164915	164920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011333	TC	3	6	168355	168360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011333	AC	3	6	177799	177804	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011333	GT	3	6	180320	180325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011333	AG	4	8	180503	180510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011333	AG	3	6	189203	189208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011333	AG	3	6	189254	189259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011333	AG	3	6	189484	189489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011333	TA	3	6	204598	204603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011333	AT	3	6	205218	205223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011333	CT	11	22	210637	210658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011333	GC	3	6	212321	212326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011333	AT	3	6	215187	215192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011333	TG	3	6	226126	226131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011333	GT	3	6	233718	233723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011333	CA	3	6	239734	239739	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011333	AT	3	6	266329	266334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011333	AG	3	6	276036	276041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011333	AG	3	6	303949	303954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011333	TC	3	6	324016	324021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011333	AG	3	6	328918	328923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011333	TG	3	6	331480	331485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011333	AG	3	6	337935	337940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011333	AG	3	6	348971	348976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011333	AG	3	6	350006	350011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011333	GA	3	6	350063	350068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011333	GA	3	6	364157	364162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011333	AT	3	6	383774	383779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011333	AG	3	6	385466	385471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011333	AG	3	6	386921	386926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011333	CA	3	6	387464	387469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011333	AG	3	6	390606	390611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011333	GA	4	8	395042	395049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011333	TG	3	6	413387	413392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011333	AG	3	6	416097	416102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011333	GA	3	6	416276	416281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011333	GC	3	6	433318	433323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011333	TA	3	6	448230	448235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011333	GC	3	6	448322	448327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011333	AT	5	10	462966	462975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011333	AG	3	6	466267	466272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011333	GT	4	8	476752	476759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011333	AG	3	6	476770	476775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011333	TA	3	6	477856	477861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011333	AT	3	6	481383	481388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011333	GA	3	6	498095	498100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011333	TG	3	6	505450	505455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011333	GA	3	6	514290	514295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011333	CA	3	6	514346	514351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011333	AT	3	6	520757	520762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011333	GA	3	6	522610	522615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011333	CT	3	6	522639	522644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011333	GA	3	6	522934	522939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011333	CT	3	6	522963	522968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_011333	GA	3	6	523258	523263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011333	CT	3	6	523287	523292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011333	CT	3	6	523401	523406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011333	AC	3	6	523449	523454	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011333	CT	3	6	523835	523840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011333	AC	3	6	523883	523888	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_011333	CT	3	6	524156	524161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011333	CT	3	6	524273	524278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011333	CT	3	6	524387	524392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011333	CT	3	6	524708	524713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_011333	CT	3	6	524825	524830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_011333	TC	3	6	525270	525275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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128	NC_011333	AG	4	8	530831	530838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011333	GA	3	6	532411	532416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011333	TA	3	6	533513	533518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011333	TA	3	6	533552	533557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011333	AT	3	6	533739	533744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011333	CA	3	6	534635	534640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011333	CT	3	6	534953	534958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_011333	CA	3	6	535068	535073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011333	AC	3	6	536112	536117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_011333	GA	3	6	536423	536428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011333	TA	3	6	536907	536912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011333	CT	3	6	546486	546491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_011333	AT	3	6	547862	547867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011333	AC	3	6	547885	547890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_011333	GT	3	6	548185	548190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011333	AG	3	6	552129	552134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011333	GA	3	6	559230	559235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011333	AG	3	6	559395	559400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011333	AC	3	6	559517	559522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_011333	TA	3	6	563619	563624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011333	AT	3	6	568110	568115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011333	GA	3	6	581944	581949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011333	AT	3	6	597877	597882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011333	TA	3	6	668751	668756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011333	AT	3	6	668757	668762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011333	CT	3	6	670013	670018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_011333	TA	3	6	684317	684322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.