MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1 chromosome

Total Repeats: 1048

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011126	TTG	2	6	230	235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011126	GTT	2	6	2785	2790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011126	CCT	2	6	8685	8690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_011126	TAT	2	6	10669	10674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011126	TAT	2	6	10688	10693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011126	ACC	2	6	10826	10831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_011126	TAT	2	6	10846	10851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011126	AAT	2	6	10852	10857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011126	GTA	2	6	10931	10936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011126	CCT	2	6	11572	11577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011126	ATT	2	6	11697	11702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011126	TGA	2	6	17471	17476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011126	AAT	2	6	21972	21977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011126	TTA	2	6	23556	23561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011126	TAT	2	6	29335	29340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011126	CCT	2	6	33519	33524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_011126	TTA	2	6	33561	33566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011126	CCT	2	6	34994	34999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_011126	ATA	2	6	35008	35013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011126	TTG	2	6	35075	35080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011126	CCT	2	6	37176	37181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011126	ATA	2	6	37194	37199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011126	CCT	2	6	39109	39114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_011126	GAT	2	6	39118	39123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011126	ATT	2	6	39159	39164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011126	TAT	2	6	39201	39206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011126	ATA	2	6	39263	39268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011126	CCT	2	6	49443	49448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_011126	ATT	2	6	49553	49558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011126	TAT	2	6	49606	49611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011126	CTG	2	6	49633	49638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011126	TAA	2	6	53798	53803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011126	CGA	2	6	54549	54554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011126	TAA	2	6	60260	60265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011126	GAT	2	6	60322	60327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011126	GCT	2	6	60390	60395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011126	AGC	2	6	60404	60409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011126	TAA	2	6	60633	60638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011126	CGC	2	6	60699	60704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_011126	CCA	2	6	60707	60712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_011126	TAA	3	9	60713	60721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011126	ACA	2	6	60722	60727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011126	ATA	2	6	60767	60772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011126	CTG	2	6	67603	67608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011126	AGT	2	6	67661	67666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011126	CCT	2	6	67950	67955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_011126	CCT	2	6	68589	68594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_011126	TAT	2	6	72223	72228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011126	TGT	2	6	72401	72406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011126	AGG	2	6	77383	77388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011126	AGG	2	6	78202	78207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011126	TTA	2	6	79258	79263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011126	CTT	2	6	88914	88919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011126	CTA	2	6	88924	88929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011126	TTA	2	6	94841	94846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011126	ATG	2	6	94851	94856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011126	AGG	2	6	94892	94897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011126	TAT	2	6	97606	97611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011126	GGT	2	6	97683	97688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011126	GGT	2	6	100504	100509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011126	ATA	2	6	100589	100594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011126	GAT	2	6	105943	105948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011126	GAT	2	6	106086	106091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011126	AGC	2	6	107721	107726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011126	TCG	2	6	107735	107740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011126	TTC	2	6	111951	111956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011126	TTA	2	6	111969	111974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011126	GTT	2	6	111997	112002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011126	TAT	2	6	112223	112228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011126	AGG	2	6	112237	112242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011126	TTA	2	6	113558	113563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011126	TAT	2	6	113564	113569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011126	AGG	2	6	113572	113577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011126	GTA	2	6	114577	114582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011126	TAA	2	6	114593	114598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011126	CCT	2	6	118765	118770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_011126	CCT	2	6	119138	119143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_011126	AAT	2	6	119177	119182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011126	TAT	2	6	119203	119208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011126	ATA	2	6	121020	121025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011126	CAC	2	6	121029	121034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_011126	CAC	2	6	134955	134960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_011126	CCT	2	6	136507	136512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_011126	GTT	2	6	136546	136551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011126	TAA	2	6	136602	136607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011126	ACC	2	6	136653	136658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_011126	CTC	2	6	142583	142588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_011126	ATA	2	6	142600	142605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011126	CCT	2	6	148039	148044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_011126	AGG	2	6	149446	149451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011126	AGG	2	6	153797	153802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011126	AAC	2	6	156045	156050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011126	CCT	2	6	166060	166065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011126	CAA	2	6	166133	166138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011126	ATT	2	6	166522	166527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011126	TTA	2	6	168679	168684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011126	TAT	2	6	168747	168752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011126	TAA	2	6	168755	168760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011126	AGG	2	6	168764	168769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011126	AGG	2	6	169008	169013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011126	AGG	2	6	169773	169778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011126	AGG	2	6	170175	170180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011126	AGG	2	6	172064	172069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011126	TGT	2	6	175563	175568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011126	AGG	2	6	176402	176407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011126	TCT	2	6	181886	181891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011126	ATT	3	9	188629	188637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011126	TAT	2	6	188653	188658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011126	ATA	2	6	190958	190963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011126	CTT	2	6	190986	190991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011126	TAA	2	6	201662	201667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011126	TCA	2	6	201744	201749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011126	ACG	2	6	201832	201837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011126	CCT	2	6	202936	202941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_011126	TTA	2	6	202956	202961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011126	ATT	2	6	202988	202993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011126	TGT	2	6	203014	203019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011126	TTA	2	6	203187	203192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011126	ACC	2	6	203220	203225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_011126	ACA	2	6	203232	203237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011126	TAT	2	6	203878	203883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011126	ATG	3	9	203900	203908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011126	TGA	2	6	203910	203915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011126	TCG	2	6	204044	204049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011126	CCT	2	6	204674	204679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_011126	TAA	2	6	204693	204698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011126	GTA	2	6	204733	204738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011126	TAT	2	6	204987	204992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011126	TCA	2	6	205243	205248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011126	TAT	2	6	205494	205499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011126	ACA	2	6	205503	205508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011126	CCT	2	6	206358	206363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_011126	CCT	2	6	206984	206989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_011126	ATA	2	6	207060	207065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011126	GAT	2	6	216720	216725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011126	TCC	2	6	216762	216767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_011126	ATT	2	6	216778	216783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011126	CCT	2	6	216918	216923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_011126	TAT	3	9	216927	216935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011126	TAT	2	6	216943	216948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011126	ATA	2	6	216992	216997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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